[实用新型]HIV病毒耐药性单核苷酸多态性检测装置

说明书

技术领域

本实用新型涉及一种确定基因单碱基突变的装置，尤其涉及一种检测单核苷酸多态性的装置，及时了解患者体内HIV病毒耐药性状况，为改变诊疗方案和药物组合提供依据。

背景技术

人类免疫缺陷病毒（Human immunodeficiency virus，HIV）是导致获得性免疫缺陷症（Acquired immunodeficiency syndrome，AID）的病原体。受HIV病毒感染后，在体内的潜伏期一般为1-12年，平均潜伏期为7-8年，极少数可以达到15年。个体在感染病毒后的几周内会出现发热、肌关节痛、皮疹和头痛等症状，然后大部分个体进入无症状的病毒潜伏期，不易引起关注。此外，病毒的潜伏期时间较长，是的该疾病在全球范围内迅速传播，对该病毒的检测（现代检验医学杂志[J]，2004，19(6)，64-67；卫生职业教育[J]，2008，20，149-151；中国国境卫生检疫杂志[J]，2009，32(4)，285-292），以及对由其引起的疾病进行诊断和治疗已成为临床医学、免疫学和病毒学等多学科研究的热点。

HIV病毒属于逆转录病毒，具有高度遗传变异性，致使多种HIV抗病毒治疗药物都无法取得良好效果。及时了解患者的HIV耐药性，对医治艾滋病患者十分重要，对这个艾滋病疫情控制意义重大（全国免疫学与分子生物学技术新进展研讨会，362-365）。

中国发明专利ZL200510132118.0公开了一种检测HIV对逆转录酶抑制剂抗性的基因芯片，使用自动点样仪将96个探针点于由四个阵区组成的玻片上而成。在检测之前，首先得到待检样品的cDNA，进行PCR扩增后，利用随机引物和荧光素Cy5-dCTP对纯化片段进行标记。标记产物烘干后与杂交液混匀，变性后加在基因芯片的探针阵列上进行杂交。之后按照离子强度由高到低的顺序对芯片进行清洗。利用生物芯片专用的扫描仪读取芯片上的荧光信号并利用相应的生物芯片数据分析软件对结果进行分析，根据对每一个位点设计的不同探针的荧光数据的比值来确定不同位点核苷酸的种类。通过对14个位点核苷酸的判断，就可以达到对HIV进行耐药性位点突变情况检测，从而完成其耐药性检测。该发明的技术方案对HIV病毒耐药性检测的时间较长，且步骤多，分析过程需要依赖专门的软件，应用的通用性不高。

中国发明专利申请200880008644.8公开了一种检测HIV耐药变异体的系统和方法。该方法适用于通过单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，SNP）来检测和分析HIV病毒耐药性相关的序列变异体。从HIV样品群中各RNA分子生成复数个cDNA种类，并扩增出数个第一扩增子，由第一扩增子产生复数个第二扩增子，在单个仪器上平行测定来自至少100个固定化群的基本相同拷贝的核酸序列组合物，检测该至少100个固定化群的核酸序列组合物中以5%或更低频率出现的一个或更多个序列变异体，并将此与HIV耐药性变异相关联。该发明中并没有提供一种便于应用此方法的检测装置。

在当前的研究性实验室或医院临床检测室中，尚没有一种针对HIV耐药性检测的装置，以简化检测过程，便于结果判断，减少检测时间和提高检测效率。

实用新型内容

本实用新型的目的在于提供一种HIV病毒耐药性单核苷酸多态性检测装置，包括多个检测单元，在生物检测器的配合下，直接判断与HIV病毒耐药性相关的序列变异体，以简化检测过程，便于结果判断，减少检测时间和提高检测效率。

单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在，平均每500～1000个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多。SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异，这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起，也可由碱基的插入或缺失所致。

本实用新型提供的一种HIV病毒耐药性单核苷酸多态性检测装置，包括对照部件和检测部件。对照部件上结合有能与含有突变位点的待检核酸分子互补结合的阳性对照核酸分子，或能与不含突变位点的待检核酸分子互补结合的阴性对照核酸分子。检测部件包括若干个检测单元，每个检测单元上结合有单一的探针分子，探测分子能与待检核酸分子上单碱基突变位点互补结合。检测单元的数量与单核苷酸多态性所具有的等位数的整数倍相一致。