[发明专利]石油污染土壤生物修复过程中微生物多样性的PCR-DGGE分析方法无效
| 申请号: | 201010609004.1 | 申请日: | 2010-12-17 |
| 公开(公告)号: | CN102174648A | 公开(公告)日: | 2011-09-07 |
| 发明(设计)人: | 杨玉楠;郭若勤 | 申请(专利权)人: | 北京航空航天大学 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;G01N27/447 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 100191*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 石油 污染 土壤 生物 修复 过程 微生物 多样性 pcr dgge 分析 方法 | ||
1.采用的石油污染土壤生物修复过程中微生物多样性的PCR-DGGE分析方法,提取土壤样品DNA的最佳土壤样品量为0.4g,得到的DNA沉淀采用100μLTE缓冲液溶解,纯化后的DNA沉淀采用50μL TE缓冲液溶解。
2.根据权利要求1所述的DNA提取方法,其纯化后的DNA产品取1μL即可直接用于PCR反应,参考PCR程序为:起始94℃预变性5min,94℃变性45s,55℃引物复性45s,72℃引物延伸90s,25个循环,72℃终延伸10min。
3.根据权利要求2所述的PCR反应方法,取3~5μL PCR产物即可直接用于DGGE实验。
4.DGGE制胶时,宜用9μLTEMED,40μL 10%APS投加入18mL的变性丙烯酰胺胶溶液中;增大试剂用量会导致胶凝固时间快而使浓度梯度不均匀。
5.根据权利要求4所述的制胶方法,灌胶后,在顶端用保鲜膜覆盖,隔夜放置(约10h),能获得比短时间(1~2h)更为优良的变性胶。
6.根据权利要求5所述的制胶方法,设置电压120V,电泳温度60℃,电泳时间5h,即可获得良好的DGGE图谱,较长(约12h以上)的电泳时间对电泳效果改善不明显。
7.根据权利要求6所述的电泳方法,银染时,固定时间为15min,染色时间15min,显色1~2min,每次间隔均用去离子水快速清洗两遍,终止液可以不予使用。
8.根据权利要求1~7所述的实验方法,发现少量合理的试剂用量可以大大地节约实验成本和时间,并能得到理想的实验效果。
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