[发明专利]用环介导等温扩增方法检测诺沃克类病毒的试剂盒及方法无效
申请号: | 201010607570.9 | 申请日: | 2010-12-28 |
公开(公告)号: | CN102134611A | 公开(公告)日: | 2011-07-27 |
发明(设计)人: | 王滔 | 申请(专利权)人: | 王滔 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
代理公司: | 福州智理专利代理有限公司 35208 | 代理人: | 丁秀丽 |
地址: | 350001 福建省福州市*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用环介导 等温 扩增 方法 检测 诺沃克 类病毒 试剂盒 | ||
1.一种用环介导等温扩增方法检测诺沃克类病毒的试剂盒及方法,其特征在于该试剂盒包括:
环介导等温扩增反应液A:
含有10X Thermopol反应缓冲液、300-500uM dNTP、2-4mM硫酸镁、0.8-1.2uM上游内引物、0.8-1.2uM下游内引物、0.2-0.3uM上游外引物、0.2-0.3uM下游外引物;
其中10X Thermopol反应缓冲液含有200mM pH8.8的三羟基甲基氨基甲烷一盐酸、l00mM氯化钾、l00mM硫酸铵、20mM硫酸镁和1%曲拉通X-100;
其中,上游内引物为:
GAGATYGCGRTCYCCTGTCCATTTTGVTGGCAGGCCATGTTCCG;
AGATTGCGATCGCCCTCCCATTTTGCCCAGACAAGARSCMATGTT;
CCCAHGTGCTSARGTCTGAGAATTTTTGGATTTTTACGTGCCMAGRCA;
CCCAHGTGCTSARGTCTGAGAATTTTCATGAGTTTTATGTGCCAAAGT;
下游内引物为:
TAAATGATGATGGCGTCTAAGGATTTTRCCTCYGGTACYAGCTGGC;
TAAATGATGATGGCGTCTAAGGATTTTTAACCTCCGGYACSAGYTGA;
TGDGAATGAAGATGGCGTCGATTTTTTGRCCTCTGGKACGAGGTT;
TGTGAATGAAGATGGCGTCGATTTTYYTCTGGGACGAGRCMGGC;
TGTGAATGAAGATGGCGTCGATTTTGACCTCATTATTACTTTCTGGC;
TGTGAATGAAGATGGCGTCGATTTTTCWTTKTKRMYCTCTGGKACGA;
TGTGAATGAAGATGGCGTCGATTTTGYCTCAKTATTRCTYTCTGGC;
上游外引物为:
GGTTTRGARATGTATGTSCCA;
AAGGGGGSYTTGARATSTAC;
GAAGGTGGCATGGAYTTTTA;
AGTGGTGGTCTGGARTTTTA;
ACWGARYTSAARGARGGTGG;
GGCATGGTWATCAAAGAAG;
GAGATYAAGAGTGGTGGTC;
下游外引物为:
CATTGRWATWGGSTCAGCT;
TGCAAGAGGGTCAGAAG;
GWGGCAGTGGTTCAGCA;
TCHAGWGCCATBRYCTCRTT;
ACSGGYTCAAGAGCCATG;
AGCCCCMRCCACRGGYTC;
AGCGCCYGCAACKGGG。
2.根据权利要求2所述的用环介导等温扩增方法检测诺沃克类病毒的试剂盒,其特征在于环介导等温扩增反应液A每管23uL的组成为:
2.5uL l0X Thermopol反应缓冲液、1.0uL l0mMdNTP、1.0uL 20uM上游内引物、1.0uL 20uM下游内引物、0.25uL 20uM上游外引物、0.25uL 20uM下游外引物、0.5uL l00mM 硫酸镁、16.5uL ddH---20。
3. 根据权利要求1所述的用环介导等温扩增方法检测诺沃克类病毒的方法,其特征是依次包括(1)-(3)下列步骤:---
(1)病毒RNA的提取:-
A. 取250uL样本,加入1.5mL离心管中;
B. 加入500uL的Solution A,剧烈振荡混匀后,室温放置5分钟;
C. 加入125uL的Solution B和125uL的DB Buffer,均匀混合后,12,000 rpm离心5分钟;
D. 将试剂盒中的Spin Column安置于Collection Tube(2mL)上;
E. 将上述操作步骤3的上清液850uL转移至Spin Column中,12,000 rpm离心2分钟,弃滤液;
F. 将500 uL的Rinse A加入至Spin Column中,12,000 rpm离心1分钟,弃滤液;
G. 将500 uL的Rinse B加入至Spin Column中,12,000 rpm离心1分钟,弃滤液;
H. 重复操作步骤7;
I. 将Spin Column安置于新的1.5 ml的离心管上,在Spin Column膜的中央处加入30 uL Elution Buffer(含RNase Inhibitor 1uL),室温静置1分钟;
J. 12,000rpm离心1分钟洗脱病毒RNA;
(2) RT反应:
A.按下述成分配置好20 uL的反应液:4uL 氯化镁、2uL 10×RT 缓冲液、6.5uL Rnase free dH2O、2uL dNTP Mixture (各10mM)、0.5uL Rnase Inhibitor (40U/μl)、2uL AMV Reverse Transcriptase(5U/μl)、1uL Random 9mers (50pmol/μl)、2uL样品RNA;
B.30℃ 保温 10分钟;
C.42℃ 左右 45分钟;
D.99℃ 加热 5分钟;
E.5℃ 保持5分钟 获得DNA模板;
(3) 诺沃克类病毒的环介导等温扩增:
A.在装有23uL环介导等温扩增反应液A的反应管中加入luL待检模板DNA,于恒温金属浴上95℃放置3-5分钟,立即置于冰上1-3分钟;
B.在反应管中加入luL DNA聚合酶B;
C.于恒温金属浴上60-65℃放置45-90分钟;
D.将金属浴调到80-95℃终止反应,3-5分钟后取出待检;
(4)显色检测:
在反应管中加入1uL显色剂C,直接用肉眼观察颜色变化,反应液颜色变为绿色,说明待检样品含有或为诺沃克类病毒。
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