[发明专利]用环介导等温扩增方法检测诺沃克类病毒的试剂盒及方法无效

专利信息
申请号: 201010607570.9 申请日: 2010-12-28
公开(公告)号: CN102134611A 公开(公告)日: 2011-07-27
发明(设计)人: 王滔 申请(专利权)人: 王滔
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93
代理公司: 福州智理专利代理有限公司 35208 代理人: 丁秀丽
地址: 350001 福建省福州市*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 用环介导 等温 扩增 方法 检测 诺沃克 类病毒 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种用环介导等温扩增方法检测诺沃克类病毒的试剂盒及方法,其特征在于该试剂盒包括:

环介导等温扩增反应液A:

    含有10X Thermopol反应缓冲液、300-500uM dNTP、2-4mM硫酸镁、0.8-1.2uM上游内引物、0.8-1.2uM下游内引物、0.2-0.3uM上游外引物、0.2-0.3uM下游外引物;

    其中10X Thermopol反应缓冲液含有200mM pH8.8的三羟基甲基氨基甲烷一盐酸、l00mM氯化钾、l00mM硫酸铵、20mM硫酸镁和1%曲拉通X-100;

其中,上游内引物为:

GAGATYGCGRTCYCCTGTCCATTTTGVTGGCAGGCCATGTTCCG;

AGATTGCGATCGCCCTCCCATTTTGCCCAGACAAGARSCMATGTT;

CCCAHGTGCTSARGTCTGAGAATTTTTGGATTTTTACGTGCCMAGRCA;

CCCAHGTGCTSARGTCTGAGAATTTTCATGAGTTTTATGTGCCAAAGT;

下游内引物为:

TAAATGATGATGGCGTCTAAGGATTTTRCCTCYGGTACYAGCTGGC;

TAAATGATGATGGCGTCTAAGGATTTTTAACCTCCGGYACSAGYTGA;

TGDGAATGAAGATGGCGTCGATTTTTTGRCCTCTGGKACGAGGTT;

TGTGAATGAAGATGGCGTCGATTTTYYTCTGGGACGAGRCMGGC;

TGTGAATGAAGATGGCGTCGATTTTGACCTCATTATTACTTTCTGGC;

TGTGAATGAAGATGGCGTCGATTTTTCWTTKTKRMYCTCTGGKACGA;

TGTGAATGAAGATGGCGTCGATTTTGYCTCAKTATTRCTYTCTGGC;

上游外引物为:

GGTTTRGARATGTATGTSCCA;

AAGGGGGSYTTGARATSTAC;

GAAGGTGGCATGGAYTTTTA;

AGTGGTGGTCTGGARTTTTA;

ACWGARYTSAARGARGGTGG;

GGCATGGTWATCAAAGAAG;

GAGATYAAGAGTGGTGGTC;

下游外引物为:

CATTGRWATWGGSTCAGCT;

TGCAAGAGGGTCAGAAG;

GWGGCAGTGGTTCAGCA;

TCHAGWGCCATBRYCTCRTT;

ACSGGYTCAAGAGCCATG;

AGCCCCMRCCACRGGYTC;

AGCGCCYGCAACKGGG。

2.根据权利要求2所述的用环介导等温扩增方法检测诺沃克类病毒的试剂盒,其特征在于环介导等温扩增反应液A每管23uL的组成为:

2.5uL l0X Thermopol反应缓冲液、1.0uL l0mMdNTP、1.0uL 20uM上游内引物、1.0uL 20uM下游内引物、0.25uL 20uM上游外引物、0.25uL 20uM下游外引物、0.5uL l00mM 硫酸镁、16.5uL ddH---20。

3. 根据权利要求1所述的用环介导等温扩增方法检测诺沃克类病毒的方法,其特征是依次包括(1)-(3)下列步骤:---

(1)病毒RNA的提取:-

A. 取250uL样本,加入1.5mL离心管中;

B. 加入500uL的Solution A,剧烈振荡混匀后,室温放置5分钟;

C. 加入125uL的Solution B和125uL的DB Buffer,均匀混合后,12,000 rpm离心5分钟;

D. 将试剂盒中的Spin Column安置于Collection Tube(2mL)上;

E. 将上述操作步骤3的上清液850uL转移至Spin Column中,12,000 rpm离心2分钟,弃滤液;

F. 将500 uL的Rinse A加入至Spin Column中,12,000 rpm离心1分钟,弃滤液;

G. 将500 uL的Rinse B加入至Spin Column中,12,000 rpm离心1分钟,弃滤液;

H. 重复操作步骤7;

I. 将Spin Column安置于新的1.5 ml的离心管上,在Spin Column膜的中央处加入30 uL Elution Buffer(含RNase Inhibitor 1uL),室温静置1分钟;

J. 12,000rpm离心1分钟洗脱病毒RNA;

(2) RT反应:

A.按下述成分配置好20 uL的反应液:4uL 氯化镁、2uL 10×RT 缓冲液、6.5uL Rnase free dH2O、2uL dNTP Mixture (各10mM)、0.5uL Rnase Inhibitor (40U/μl)、2uL AMV Reverse Transcriptase(5U/μl)、1uL Random 9mers (50pmol/μl)、2uL样品RNA;

B.30℃ 保温 10分钟;

C.42℃ 左右 45分钟;

D.99℃ 加热 5分钟;

E.5℃  保持5分钟 获得DNA模板;

(3) 诺沃克类病毒的环介导等温扩增:

A.在装有23uL环介导等温扩增反应液A的反应管中加入luL待检模板DNA,于恒温金属浴上95℃放置3-5分钟,立即置于冰上1-3分钟;

B.在反应管中加入luL DNA聚合酶B;

C.于恒温金属浴上60-65℃放置45-90分钟;

D.将金属浴调到80-95℃终止反应,3-5分钟后取出待检;

(4)显色检测:

在反应管中加入1uL显色剂C,直接用肉眼观察颜色变化,反应液颜色变为绿色,说明待检样品含有或为诺沃克类病毒。

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