[发明专利]检测胚胎染色体拷贝数的试剂盒、装置和方法有效
| 申请号: | 201010595234.7 | 申请日: | 2010-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN102108406A | 公开(公告)日: | 2011-06-29 |
| 发明(设计)人: | 王珺;张建光;田凤;高扬;周代星 | 申请(专利权)人: | 北京贝瑞和康生物技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 吴贵明 |
| 地址: | 102206 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 检测 胚胎 染色体 拷贝 试剂盒 装置 方法 | ||
1.一种检测胚胎染色体拷贝数的试剂盒,包括:
从母体取血液的器械;
适合将所述血液中的血细胞和血浆分离的器械;
抽提所述血浆中的DNA的试剂和器械;
通过物理方法根据所述DNA的片段大小对其进行分离的试剂和器械;和
取100bp-250bp之间的任意一点或任意一个区间的所有DNA进行测序的试剂和器械。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其中所述物理方法是琼脂糖凝胶电泳的方法。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,还包括:将所述DNA制成供双端测序的文库的试剂和器械。
4.根据权利要求1或3所述的试剂盒,还包括:对所述从血浆中抽提的DNA或所述供双端测序的文库进行PCR扩增的试剂和器械。
5.根据权利要求1所述的试剂盒,其中所述100-250bp之间的任意一点或任意一个区间的DNA是150bp-170bp的DNA。
6.根据权利要求4所述的试剂盒,其中所述100-250bp之间的任意一点或任意一个区间的DNA是150bp-170bp的DNA。
7.根据权利要求5或6所述的试剂盒,其中所述100-250bp之间的任意一点或任意一个区间的DNA是167bp的DNA。
8.根据权利要求3所述的试剂盒,其中所述双端测序对所述DNA两端各小于50bp的双端短序列进行测试。
9.一种检测胚胎染色体拷贝数的试剂盒,包括:
从母体取血液的器械;
适合将所述血液中的血细胞和血浆分离的器械;
抽提所述血浆中的DNA的试剂和器械;
将所述DNA制成可供双端测序的文库的试剂和器械;和
对所述DNA进行双端短序列测序的试剂和器械。
10.根据权利要求9所述的试剂盒,其中所述双端短序列是所述DNA两端各小于50bp的核苷酸。
11.根据权利要求9或10所述的试剂盒,还包括:对所述从血浆中抽提的DNA进行PCR扩增的试剂和器械。
12.一种检测胚胎染色体拷贝数的装置,包括:
检测模块,用于对母体血浆样本中的DNA进行测序;
比对模块,用于将所述DNA的测序结果与染色体组序列图谱进行比对,以确定所述DNA中的每段DNA来自几号染色体以及所述每段DNA的序列长度;
计算模块,用于计算在同一样本内所述DNA中100bp-250bp之间的任意一点或任意一个区间的所有DNA中来自待测染色体与来自参考染色体的DNA片段数的比值,并计算各个样本间所述比值的变异,根据所述变异的数值确定待测染色体的拷贝数;以及
输出模块,用于输出所述待测染色体的拷贝数。
13.根据权利要求12所述的装置,其中对所述母体血浆样本中DNA进行测序仅包括对所述DNA中100bp-250bp之间的任意一点或任意一个区间的DNA进行测序,通过物理方法可以分离出100bp-250bp之间的任意一点或任意一个区间的DNA。
14.根据权利要求12或13所述的装置,其中所述母体血浆样本中DNA在检测前被制作成可供双端测序的文库。
15.根据权利要求14所述的装置,其中所述双端测序对所述DNA两端各小于50bp的双端短序列进行测试。
16.根据权利要求15所述的装置,其中对所述DNA的所述双端短序列进行测试后,通过将所测得的DNA的双端短序列与染色体组序列图谱进行比对能够确定每段所述DNA的长度以及每段所述DNA来自几号染色体。
17.根据权利要求12所述的装置,其中所述母体血浆样本中DNA在检测前进行了PCR的扩增。
18.根据权利要求14所述的装置,其中所述母体血浆样本中DNA在被制作成可供双端测序的文库之前或之后进行了PCR的扩增。
19.根据权利要求13或15所述的装置,其中所述100-250bp之间的任意一点或任意一个区间的DNA是150bp-170bp的DNA。
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