[发明专利]一种rpoB基因突变检测特异性引物和液相芯片无效
申请号: | 201010539631.2 | 申请日: | 2010-11-09 |
公开(公告)号: | CN101962686A | 公开(公告)日: | 2011-02-02 |
发明(设计)人: | 许嘉森;甘丹翠;邓晶晶;刘志明 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rpob 基因突变 检测 特异性 引物 芯片 | ||
1.一种rpoB基因突变检测液相芯片,其特征是,主要包括有:
(A)针对rpoB基因的突变位点,分别设计的野生型和突变型的ASPE引物对:每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对突变位点的特异性引物组成,所述特异性引物是:SEQ IDNO.21及SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23及SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28~SEQ ID NO.31中的一种以上、SEQ ID NO.32及SEQID NO.33、SEQ ID NO.34及SEQ ID NO.35~SEQ ID NO.36中的一种以上、SEQ ID NO.37及SEQ ID NO.38、和/或SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40;所述tag序列选自SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.20中的序列;
(B)分别包被有特异的anti-tag序列的、具有不同颜色编码的微球,所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.41~SEQ ID NO.60中的序列,所述anti-tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对,且所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列;
(C)用于扩增具有codon513、codon 516、codon 522、codon 526、codon 529、codon 531、codon 533、和/或codon 545的突变位点的rpoB基因目标序列的扩增引物。
2.根据权利要求1所述的rpoB基因突变检测液相芯片,其特征是,所述扩增引物为SEQID NO.61和SEQ ID NO.62。
3.根据权利要求1或2所述的rpoB基因突变检测液相芯片,其特征是,所述ASPE引物对为:针对codon513突变位点的由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.21组成的序列及由SEQ IDNO.2和SEQ ID NO.22组成的序列、针对codon 516突变位点的由SEQ ID NO.3和SEQ IDNO.23组成的序列及由SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.24组成的序列、针对codon 522突变位点的由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.25组成的序列及由SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.26组成的序列、针对codon526突变位点的由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.27组成的序列及选自如下至少一种序列:由SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.28组成的序列,由SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.29组成的序列,由SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.30组成的序列和由SEQ ID NO.11和SEQ IDNO.31组成的序列、针对codon529突变位点的由SEQ ID NO.12和SEQ ID NO.32组成的序列及由SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.33组成的序列、针对codon531突变位点的由SEQ IDNO.14和SEQ ID NO.34组成的序列及选自如下至少一种序列:由SEQ ID NO.15和SEQ IDNO.35组成的序列和由SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.36组成的序列、针对codon533突变位点的由SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.37组成的序列及由SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.38组成的序列、和/或针对codon545突变位点的由SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.39组成的序列及由SEQID NO.20和SEQ ID NO.40组成的序列。
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