[发明专利]一种虚拟合成物种调查异源多倍体物种起源的方法

权利要求书

1.一种虚拟合成物种调查异源多倍体物种起源的方法，其步骤如下：

1）亲本物种及自然异源多倍体全基因组水平分子扫描：采用PCR技术对自然异源多倍体及其亲本物种进行全基因组水平的分子标记分析；

2）虚拟合成异源多倍体：根据合成异源多倍体过程中，亲本具有的分子特征能在合成后代中得到体现的原则，利用亲本物种的分子标记数据，模拟合成种的分子标记数据；

3)亲缘关系分析：利用NTSYS软件计算各亲本与自然异源多倍体，以及各虚拟合成异源多倍体与自然异源多倍体间的遗传距离，并对分子标记数据进行UPGMA聚类分析和主成分分析（PCA）；用STRUCTURE软件分析二倍体亲本的不同变异类型与自然异源多倍体之间的血缘关系；用ARLEQUIN软件，按亲本物种进行分子标记方差分析(AMOVA)，检验各亲本物种对虚拟合成异源多倍体遗传差异的贡献率；用SAS软件对来源于同一亲本物种内不同个体的虚拟合成异源多倍体之间的遗传距离进行方差分析（ANOVA），并对亲本与自然异源多倍体、虚拟合成异源多倍体与自然异源多倍体间的遗传距离进行方差分析及多重比较；通过以上分析揭示不同亲本种类型模拟合成的虚拟异源多倍体与自然异源多倍体相互间遗传差异的大小，根据遗传差异越小，该亲本类型与异源多倍体越为接近，则该类型越可能是异源多倍体中亚基因组的来源的原则，推导异源多倍体中亚基因组的来源。

2.根据权利要求1所述的虚拟合成物种调查异源多倍体物种起源的方法，其特征在于：所述其中步骤2）中，根据双亲或亲本之一中标记为“1”的则在虚拟合成异源多倍体中记为“1”，在双亲中都为“0”的则在虚拟合成异源多倍体中记为“0”的原则，据此利用双亲的分子标记数据模拟出合成种的分子标记数据。

3.根据权利要求1或2所述的虚拟合成物种调查异源多倍体物种起源的方法，其特征在于：步骤1）用于分子标记的PCR技术采用全基因组水平分子标记AFLP, SSR, RAPD, ISSR中的任意一种或多种。

4.根据权利要求1或2所述的虚拟合成物种调查异源多倍体物种起源的方法，其特征在于：步骤3）采用的数据分析软件是SAS、SPSS软件；所采用的遗传关系分析软件选择NT-SYS、STRUCTURE软件。