[发明专利]一种基于DNA接头连接的标签文库构建方法及其所使用标签和标签接头有效

专利信息
申请号: 201010299257.3 申请日: 2010-09-21
公开(公告)号: CN102409045A 公开(公告)日: 2012-04-11
发明(设计)人: 章文蔚;龚梅花;于竞;张艳艳;田方;陈海燕;周妍 申请(专利权)人: 深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C40B40/06;C40B50/06
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 罗菊华
地址: 518083 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 dna 接头 连接 标签 文库 构建 方法 及其 使用
【权利要求书】:

1.一组DNA标签,所述DNA标签包括如下或由如下组成:表2所示DNA标签或与之相差1个碱基的DNA标签中的至少5个,或至少10个,或至少15个,或至少20个,至少25个,或至少30个,或至少35个,或至少40个,或45个,或至少50个,或至少55个,或至少60个,或全部67个,

所述DNA标签优选地至少包括表2所示的67个DNA标签的DNA Index-1~DNA Index-5,或DNA Index-6~DNA Index-10,或DNA Index-11~DNA Index-15,或DNA Index-16~DNA Index-20,或DNA Index-21~DNA Index-25,或DNA Index-26~DNA Index-30,或DNA Index-31~DNA Index-35,或DNA Index-36~DNA Index-40,或DNA Index-41~DNA Index-45,或DNA Index-46~DNA Index-50,或DNA Index-51~DNA Index-55,或DNA Index-56~DNA Index-60,或DNA Index-61~DNA Index-65,或DNA Index-63~DNA Index-67,或者他们任何两个或多个的组合。

2.权利要求1所述的DNA标签,其中所述的相差1个碱基包括标签中1个碱基的取代、添加或删除。

3.权利要求1所述的DNA标签用于构建DNA标签文库的用途,其中DNA标签文库的DNA标签接头在3’末端包含所述DNA标签,从而构成各自相对应的DNA标签接头,所述DNA标签接头优选地同时作为DNA标签文库的5’接头和3’接头使用。

4.权利要求1所述的用途,其中所述DNA标签插入DNA标签接头中的3’末端中,或通过或不通过连接子连接在DNA接头的3’末端,优选地不通过连接子连接在DNA接头的3’末端。

5.含有权利要求1或2所述的DNA标签的一组DNA标签接头,其中DNA标签文库的DNA标签接头在3’末端包含权利要求1所述的标签,并且优选地同时用作5’接头和3’接头,所述一组所述DNA标签接头包括如下或由如下组成:表2所示67个DNA标签接头与其所包含的DNA标签序列相差1个碱基的DNA标签接头中的至少5个,或至少10个,或至少15个,或至少20个,至少25个,或至少30个,或至少35个,或至少40个,或45个,或至少50个,或至少55个,或至少60个,或全部67个,

所述DNA标签接头优选地至少包括表2所示的67个DNA标签接头中的DNA Index-1F/R_adapte~DNA Index-5F/R_adapter,或DNA Index-6F/R_adapte~DNA Index-10F/R_adapter,或DNA Index-11F/R_adapte~DNA Index-15F/R_adapter,或DNA Index-16F/R_adapte~DNA Index-20F/R_adapter,或DNA Index-21F/R_adapte~DNA Index-25F/R_adapter,或DNA Index-26F/R_adapte~DNA Index-30F/R_adapter,或DNA Index-31F/R_adapte~DNA Index-35F/R_adapter,或DNA Index-36F/R_adapte~DNA Index-40F/R_adapter,或DNA Index-41F/R_adapte~DNA Index-45F/R_adapter,或DNA Index-46F/R_adapte~DNA Index-50F/R_adapter,或DNA Index-51F/R_adapte~DNA Index-55F/R_adapter,或DNA Index-56F/R_adapte~DNA Index-60F/R_adapter,或DNA Index-61F/R_adapte~DNA Index-65F/R_adapter,或DNA Index-66F/R_adapte~DNA Index-67F/R_adapter,或者他们任何两个或多个的组合。

6.权利要求5所述的DNA标签接头,其中所述的相差1个碱基包括标签中1个碱基的取代、添加或删除。

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