[发明专利]用于数字基因表达谱的标签及其使用方法有效
| 申请号: | 201010299248.4 | 申请日: | 2010-09-21 |
| 公开(公告)号: | CN102409044A | 公开(公告)日: | 2012-04-11 |
| 发明(设计)人: | 章文蔚;张艳艳;田方;于竞;龚梅花 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技有限公司;深圳华大基因研究院 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C40B40/06;C40B50/06;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 | 代理人: | 罗菊华 |
| 地址: | 518083 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 数字 基因 表达 标签 及其 使用方法 | ||
1.一组标签,所述一组标签包括如下或由如下组成:表1所示12个标签与其相差1个碱基的标签中的至少2个,或至少3个,或至少4个,或至少5个,至少6个,或至少7个,或至少8个,或至少9个,或至少10个,或至少11个,或全部12个,
所述一组标签优选地至少包括表1所示的12个标签中的Index1和Index2,或Index3和Index4,或Index5和Index6,或Index7和Index8,或Index9和Index10,或Index11和Index12,或者他们任何两个或多个的组合。
2.权利要求1所述的标签,其中所述相差1个碱基包括对表1所示12个标签的序列中1个碱基的取代、添加或缺失。
3.权利要求1或2所述的标签用于数字基因表达谱标签文库构建并测序的用途,其中所述标签包含在GEX接头2的5’末端中,从而构成各自相对应的GEX标签接头2,其用作数字基因表达谱标签文库的3’接头。
4.权利要求3所述的用途,所述标签包含在GEX接头2的5’末端中,包括标签通过或不通过连接子与GEX接头1的5’末端相连,或者插入GEX接头2的5’末端中,优选的是不通过连接子与GEX接头1的5’末端相连。
5.使用权利要求1或2所述的标签构建的数字基因表达谱标签文库。
6.包含权利要求1所述的标签的一组GEX标签接头2,其在5’末端包含权利要求1所述的标签,并且优选地用作数字基因表达谱标签文库3’接头,所述一组GEX标签接头2包括如下或由如下组成:表1所示12个GEX标签接头2或与其中包含的标签序列相差1个碱基的接头中的至少2个,或至少3个,或至少4个,或至少5个,至少6个,或至少7个,或至少8个,或至少9个,或至少10个,或至少11个,或全部12个,
所述一组GEX标签接头2优选地至少包括表2所示的12个GEX标签接头2中的Gex Index1 adapter2 F/R和Gex Index2 adapter2 F/R,或Gex Index3 adapter2 F/R和Gex Index4 adapter2 F/R,或Gex Index5 adapter2 F/R和Gex Index6 adapter2 F/R,或Gex Index7 adapter2 F/R和Gex Index8 adapter2 F/R,或Gex Index9 adapter2 F/R和Gex Index10 adapter2 F/R,或Gex Index11 adapter2 F/R和Gex Index12 adapter2 F/R,或者他们任何两个或多个的组合。
7.权利要求6所述的GEX标签接头2,其中所述相差1个碱基包括对标签序列中1个碱基的取代、添加或缺失。
8.权利要求6或7所述的GEX标签接头2用于数字基因表达谱标签文库构建并测序的用途,所述GEX标签接头2用作数字基因表达谱标签文库的3’接头。
9.使用权利要求6或7所述的GEX标签接头2构建的数字基因表达谱标签文库,其中所述GEX标签接头2用作数字基因表达谱标签文库的3’接头。
10.一种构建数字基因表达谱标签文库并测序的方法,所述方法的特征在于使用不同的选自表1的GEX标签接头2与其中包含的标签序列相差1个碱基的接头用作数字基因表达谱标签文库的3’接头,构建数字基因表达谱标签文库。
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