[发明专利]猪PSMA1基因中一个可用于溯源的SNP分子标记及其检测方法无效

专利信息
申请号: 201010282912.4 申请日: 2010-09-16
公开(公告)号: CN102399775A 公开(公告)日: 2012-04-04
发明(设计)人: 吴潇;唐雪明;张小波;赵凯;朱宏;谭芙蓉;蒋玲曦;王金斌;陶世如 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12Q1/68
代理公司: 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 代理人: 费开逵
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: psma1 基因 一个 用于 溯源 snp 分子 标记 及其 检测 方法
【权利要求书】:

1.猪PSMA1基因的DNA片段,其序列如SEQ ID NO 1所示,其第30位碱基处有一个碱基突变30A→30G。

2.根据权利要求1所述的猪PSMA1基因的DNA片段,其编码的氨基酸序列如SEQ ID NO 2所示。

3.根据权利要求1所述的猪PSMA1基因的DNA片段,其特征在于,所DNA片段共1487bp,其包含部分第六外显子、第八外显子的序列,完整的第七外显子,第六内含子和第七内含子序列。

4.分离权利要求1至3任一项所述的PSMA1基因的DNA片段的正、反向引物,其碱基序列如SEQ ID NO 5和SEQ ID NO 6所示。

5.一种SNP分子标记,位于权利要求1至3任一项所述的猪PSMA1基因的DNA片段中,其序列如SEQ ID NO 3所示。

6.根据权利要求5所述的SNP分子标记,其编码的氨基酸序列如SEQ IDNO 4所示。

7.根据权利要求5所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记的第30位碱基处有一个碱基突变30A→30G。

8.根据权利要求5所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记的第263位有一等位基因A或G。

9.根据权利要求5所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记的第27位有一等位基因G。

10.权利要求5所述的SNP分子标记的检测方法,其特征在于,采用PCR-BfaI-RFLP方法进行,具体包括以下步骤:

(1)构建猪的DNA池;

(2)设计正、反引物分离猪PSMA1基因的DNA片段,测序并分析;

(3)突变位点检测的正、反引物的重新设计及检测方法的建立;

(4)采集猪的9个品种或品系的耳组织样,共计204个个体;

(5)检测SNP标记在试验群体的分布,筛选适用于猪肉产品溯源的SNP标记。

11.根据权利要求10所述的检测方法,其特征在于,突变位点检测的正、反向引物的序列分别如SEQ ID NO 5和SEQ ID NO 7所示。

12.权利要求5所述的SNP分子标记用于猪肉产品的DNA溯源。

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