[发明专利]结构型核酸指导的化学合成

权利要求书

1.形成一种或多种化学结构的方法，其包括下列步骤：

(i)提供N＝3至100个载体模块，其包括：

(1)第1个位置的载体模块，具有

i)能够与第N个位置的载体模块的核酸区段杂交的核酸区段，和

ii)能够与第2个位置的载体模块的区段杂交的核酸区段，

(2)第n个位置的载体模块，n＝2至N-1，具有能够与第n-1个载体模块的所述核酸区段杂交的核酸区段，和能够与第n+1个载体模块的区段杂交的核酸区段，和

(3)第N个位置的载体模块，具有能够与所述第N-1个载体模块的所述核酸区段杂交的核酸区段，和能够与所述第1个载体模块的区段杂交的核酸区段，

其中

至少3个所述载体模块包含位于在所述杂交区段之间的中间部分或其附近的缔合的化学基团；

(ii)在允许所述杂交区段进行杂交的条件下使所述载体模块接触，从而使所述化学基团接近，其中所形成的化学化合物与至少一个所述载体模块缔合。

2.根据权利要求1的方法，其进一步包括下列步骤：提供允许第n-1个模块与第n个模块以及第N-1个模块与第N个模块的末端进行连接的条件，从而形成具有干-环结构和缔合的化学化合物的邻接的核酸分子。

3.权利要求1或2的方法，其中所形成的化学化合物与至少一个所述载体模块或所述邻接的核酸分子共价缔合。

4.根据权利要求3的方法，其包括

在允许杂交区段进行杂交的条件下使载体模块接触，从而使化学基团达到反应接近度；和

提供允许化学基团进行反应的条件，其中所形成的化学化合物与至少一个载体模块缔合；和允许第n-1个模块与第n个模块以及第N-1个模块与第N个模块的末端进行连接的条件，从而形成具有干-环结构和缔合的化学化合物的邻接的核酸分子。

5.根据权利要求1的方法，其中所述载体模块的接触顺次或同时进行。

6.根据权利要求4的方法，其中化学基团的反应顺次或同时进行，和/或其中所述连接以酶促或化学的方式并且顺次或同时进行。

7.根据权利要求6的方法，其进一步包括至少在所述第1个载体模块中和/或至少在所述第N个载体模块中的用于DNA聚合酶、RNA聚合酶或逆转录酶位点的引发位点。

8.根据权利要求7的方法，其包括实施酶促延伸反应以展示所形成的化学化合物的进一步步骤。

9.根据权利要求8的方法，其中N为3、4、5、6或7，并且特别地其中每个所述载体模块包含位于在所述杂交区段之间的中间部分或其附近的缔合的化学基团，和位于所述杂交区段之一的外部的密码子区段。

10.根据权利要求9的方法，其中通过具有在一个或多个位置上的载体模块的集合而合成超过一种化合物的文库。

11.根据权利要求10的方法，其中所述在至少一个位置上的集合包括至少10个不同的载体模块。

12.根据权利要求11的方法，其中所述在至少两个位置上的集合包括至少10个不同的载体模块。

13.根据权利要求3的方法，其中所述中间部分包括化学键或1-20个核苷酸。

14.根据权利要求13的方法，其中所述化学基团与所述中间部分的核碱基缔合。

15.根据权利要求13的方法，其中所述化学基团与所述中间部分的磷酸二酯键缔合。

16.根据权利要求15的方法，其中所述化学基团通过一个或多个共价键与所述中间部分缔合。

17.用于筛选超过一种化学化合物的文库的方法，所述化学化合物通过根据权利要求8的方法来制备，所述方法包括下列步骤：

在所述文库中探查有着具有所需特性的化学化合物的文库成员；

将具有所需特性的文库成员与不具有所需特性的文库成员分开；和

从而获得具有所需特性的文库成员的富集汇集物。

18.根据权利要求17的方法，其中所述方法进一步包括扩增所述富集汇集物的成员的核酸，所述核酸表明所述化学反应的历史。