[发明专利]一种同步检测多种烟草病毒的方法无效
申请号: | 201010232750.3 | 申请日: | 2010-07-21 |
公开(公告)号: | CN101875982A | 公开(公告)日: | 2010-11-03 |
发明(设计)人: | 成巨龙;吴云锋 | 申请(专利权)人: | 陕西省烟草研究所;西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京亿腾知识产权代理事务所 11309 | 代理人: | 陈惠莲 |
地址: | 710061 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同步 检测 多种 烟草 病毒 方法 | ||
1.一种同步检测2-5种烟草病毒的方法,该方法包括烟草病毒总RNA的提取,多重RT-PCR和电泳检测确定病毒种类,其中烟草病毒选自烟草花叶病毒(TMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)、马铃薯Y病毒(PVY)、烟草蚀纹病毒(TEV)和烟草脉带花叶病毒(TVBMV)中的2-5种,其中多重RT-PCR反应中应用的引物为包含如下5对引物中的2-5对引物的引物组:
第1对引物:
SEQ ID NO.1:5′-TAGACCCGCTAGTCACAG-3′
SEQ ID NO.2:5′-CAGAGGTCCAAACCAAAC-3′
第2对引物:
SEQ ID NO.3:5′-GTGGGTGACAGTTCGTAAA-3′
SEQ ID NO.4:5′-GTGGGAATGCGTTGGT-3′
第3对引物:
SEQ ID NO.5:5′-TGATGGATGGTGAGGAG-3′
SEQ ID NO.6:5′-GTGCCGTTCAGTGTCTT-3′
第4对引物:
SEQ ID NO.7:5′-CCGAGAATCAAGGCTATC-3′
SEQ ID NO.8:5′-CGCTAAACCTACATCCC-3′
第5对引物:
SEQ ID NO.9:5′-GAGGTCGTGAACTTACAGC-3′
SEQ ID NO.10:5′-GAGGTCGTGAACTTACAGC-3′。
2.根据权利要求1所述的方法,其中引物组中包含5对引物SEQ IDNO.1-10。
3.根据权利要求1所述的方法,该方法包括如下步骤:
1)病毒总RNA的提取:
提取感染2-5种病毒的烟草叶中的病毒总RNA;
2)多重RT-PCR:
应用SEQ ID NO.2、4、6、8、10(第1-5对引物中反向引物序列)对病毒总RNA进行逆转录制备cDNA模板,然后应用SEQ ID NO.1-10(第1-5对引物中的正向和反向序列)对cDNA模板进行多重PCR反应,得扩增产物;
3)电泳检测:
对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,获得病毒基因扩增产物条带,判定烟草病毒种类。
4.根据权利要求3所述的方法,其中多重PCR反应中五对引物浓度比例为第1对引物∶第2对引物∶第3对引物∶第4对引物∶第5对引物=1.2-1.6∶0.8-1.2∶0.8-1.2∶0.8-1.2∶1.3-1.7。
5.根据权利要求4所述的方法,其中多重PCR反应中五对引物浓度比例为第1对引物∶第2对引物∶第3对引物∶第4对引物∶第5对引物=1.4∶1∶1∶1∶1.5。
6.根据权利要求3所述的方法,其中多重PCR反应中dNTPs浓度为0.12-0.32mmol/L;Taq DNA聚合酶浓度为0.02-0.12U/μL;Mg2+浓度为1.2-3.2mmol/L。
7.根据权利要求6所述的方法,其中多重PCR反应中dNTPs浓度为0.28mmol/L,Taq DNA聚合酶浓度为0.10U/μL,MG2+浓度为2.4mmol/L。
8.根据权利要求3所述的方法,其中多重PCR反应中,退火温度为48-51℃,延伸时间为60s-90s,循环次数为3045次。
9.根据权利要求8所述的方法,其中多重PCR反应中,扩增条件为退火温度51℃,延伸时间60s,循环次数35次。
10.根据权利要求3所述的方法,其中病毒总RNA的提取过程中,采用BIOzol试剂盒提取总RNA。
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