[发明专利]人类基因FAM96A及其蛋白质的应用

说明书

技术领域

本发明涉及人类基因FAM96A及其蛋白质的应用。

背景技术

人类基因FAM96A(family with sequence similarity 96，memberA)，又名FLJ22875，人类FAM96A染色体定位于15q22.31。FAM96A基因拥有5个外显子和4个内含子，形成两个可变剪接体NM_032231.4(下称FAM96A-v1)和NM_001014812.1(下称FAM96A-v2)，二者均有核心结构域一功能未知结构域59(DUF59)，剪接符合GT-AG规律。

FAM96A-v1拥有该基因的全部外显子。其mRNA全长为1108bp，翻译起始密码子ATG位于第一外显子中段，mRNA的第241-243位。开放读码框架ORF全长483bp，编码160个氨基酸(NP_115607)。Uniprot数据库提示，全长形式V1在蛋白水平明确存在。FAM96A-v1mRNA序列及其蛋白质序列如SEQ ID NO.1和SEQID NO.2所示。

FAM96A-V2，起始密码子ATG与FAM96A-v1一致，较FAM96A-v1仅缺失第3外显子，由2-4外显子连接导致蛋白质翻译在第4外显子提前终止。ORF全长309bp，编码102个氨基酸(NP_001014812)。FAM96A-v2mRNA序列及其蛋白质序列如SEQID NO.3和SEQ ID NO.4所示。

美国国立生物技术信息中心(NCBI)Genbank数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)用于获取及分析上述FAM96A genomicDNA、mRNA和cDNA序列和蛋白质序列。

但，作为较早发现，并且命名基因，FAM96A并未进行过系统性功能研究与分析。迄今为止，在Pubmed数据库中，检索不到关于该基因的任何系统性功能研究报道。正是在这样的背景下，我们着手研究了FAM96A的功能及其应用。

另外，上皮-间质变迁(EMT)现象在1982年由已故奥地利女科学家ElizabethHay在角膜上皮细胞三维培养中发现首先发现并系统阐述(Jiri Zavadil et al.，“Epithelial-mesenchymal transition，”Cancer Research 68，no.23(December 1，2008)：9574-9577)。人们亲昵地称这位令人尊敬的前辈Betty Hay。此后20余年的系统性研究中，EMT现象在胚胎发育、纤维化疾病及肿瘤发生与发展中的重要而广泛的作用，经过无数科学家的努力和论证，逐渐由争议走向共识。可以毫不夸张的说，EMT研究领域已经成为生命科学领域最引人瞩目和炙手可热的研究焦点之一。

上皮-间质变迁是多重胞内、胞外因素诱发并调控的一系列复杂而影响深远的变化。简而言之，就是在分子水平上皮细胞通过多种因素上调一个或多个EMT核心转录因子(如TWIST1、SNAI1、ZEB1、ZEB2、TCF3-E47、Goosecoid、FOXC2等)或改变核心转录因子的功能状态(如β-连环蛋白(β-Catenin)的核转位)，这些转录因子一方面直接或间接上调间质细胞特征性分子的表达(如波形蛋白、α-SMA、S100A4、CDH2等)，另一方面抑制上皮细胞特征性分子的表达(如CDH1、KRT18、TJP-1/ZO-1、桥粒蛋白(Desmoplakin)、MUC1等)；同时通过RhoA、Racl、Cdc42等Rho家族激酶重塑细胞微丝，使细胞骨架由上皮细胞特征性的皮质(Cortical)细胞骨架转变为间质细胞特有的应力纤维样(Stress-Fiber Like)细胞骨架。这一系列分子水平的事件，使得细胞由原本上皮细胞的卵石样(Pebble-Like)形态转变为成纤维细胞样的梭形，同时失去原有的极性和粘附特性。最终由相对静止和稳定的典型上皮细胞转变为具有强大侵袭和运动能力的间质样细胞(MarcelloGuarino，“Epithelial-mesenchymal transition and tumour invasion，”The InternationalJournal ofBiochemistry & Cell Biology 39，no.12(2007)：2153-2160)。