[发明专利]一种辅助鉴定具有不同体重性状鸡的方法

说明书

技术领域

本发明涉及一种辅助鉴定具有不同体重性状鸡的方法。

背景技术

SNP(single nucleotide polymorphism单核苷酸多态性)主要指在基因组水平，由单个核苷酸的变异引起的DNA序列的多态性，包括转换、颠换、插入或缺失。在基因组中分布密集的SNP，因其携带巨大的遗传信息量，被认为是应用前景最好的遗传标记物，人类SNP标记的检测已经成为基因诊断的重要手段。SNP标记的遗传图谱的研究，对分子辅助育种有巨大的促进作用，农业动物中很多重要性状的基因已经定位。

SNP检测常采用一些已有成熟技术，如DNA测序(Sanger测序法和焦磷酸测序法)、单链构象多态性(SSCP)、限制性酶切片段长度多态性(RFLP)、等位基因特异的寡聚核苷酸杂交(ASO)、寡聚核苷酸特异的连接、DNA芯片以及Taqman探针等技术手段。

作为结构性转录因子的HMGA2是一种非组蛋白的染色质蛋白，含有3个AT-hook结合域，可以特异性结合到DNA富含AT区域的小沟中。一般认为，HMGA2在细胞生长和脂肪代谢中起作用。HMGA2主要在胚胎时期表达，成体组织中几乎不表达，在肿瘤细胞中表达会被激活。HMGA2功能缺失的小鼠表现为侏儒症，并且脂肪组织大量减少，当过表达缺失C末端的HMGA2时，小鼠表现为巨人症和脂肪过多，并会形成肿瘤，因此，HMGA2主要作为与癌症相关的基因进行研究。鸡HMGA2基因的核苷酸序列见GENBANKACCESSION NO.：NC_006088(Chr1)自5’末端第36072025-36177364位核苷酸。

生长性状中的体重指标一直是畜牧业生产中重要的经济性状之一，也是肉鸡品种选育中的重要指标。与1957年相比，2001年肉鸡当代品系的屠体产量提高了6倍，其中85％-90％归功于遗传学效应，只有10％-15％是由于饲料营养水平的改良造成的。家禽遗传标记辅助育种研究在不断深入，大量的性状已经在遗传水平上确定了候选区域。我国有丰富的地方鸡品种资源，如何对其评估、保护和选育是迫切需要解决的问题。

发明内容

本发明的目的是提供一种辅助鉴定具有不同体重性状鸡的方法。

本发明提供的辅助鉴定具有不同体重性状鸡的方法(一)包括如下步骤：检测待测鸡的HMGA2基因中序列1自5′末端第101位脱氧核糖核苷酸是G还是T，确定待测鸡的基因型是GG还是TT；所述GG基因型为HMGA2基因中序列1自5′末端第101位脱氧核糖核苷酸为G的纯合体；所述TT基因型为HMGA2基因中序列1自5′末端第101位脱氧核糖核苷酸为T的纯合体；TT基因型鸡的体重在统计学上高于GG基因型鸡的体重。

所述方法(一)还可包括选择待测鸡的步骤；所述待测鸡为GG基因型的鸡和TT基因型的鸡。

所述方法(一)中，确定待测鸡的基因型的方法具体如下：用3730xl型号测序仪、美国应用生物公司的SNPlex Genotyping System 48-plex kit和杂交板对待测鸡的基因组DNA进行检测；进行所述检测所用的探针为序列表的序列3所示DNA、序列表的序列4所示DNA和序列表的序列5所示DNA；对荧光数据进行分析：当a＞6b时，待测鸡的基因型为GG；当a＜1/6b时，待测鸡的基因型为TT。

所述方法(一)具体还包括如下选择待测鸡的步骤：用3730xl型号测序仪、美国应用生物公司的SNPlex Genotyping System 48-plex kit和杂交板对待测鸡的基因组DNA进行检测；进行所述检测所用的探针为序列表的序列3所示DNA、序列表的序列4所示DNA和序列表的序列5所示DNA；对荧光数据进行分析：当a＞6b时，待测鸡的基因型为GG；当a＜1/6b时，待测鸡的基因型为TT；选择GG基因型的鸡和TT基因型的鸡作为待测鸡。

本发明提供的辅助鉴定具有不同体重性状鸡的方法(二)包括如下步骤：检测待测鸡的HMGA2基因中序列1自5′末端第101位脱氧核糖核苷酸是G还是T，确定待测鸡的基因型是GT还是TT；所述GT基因型为HMGA2基因中序列1自5′末端第101位脱氧核糖核苷酸为G和T的杂合体；所述TT基因型为HMGA2基因中序列1自5′末端第101位脱氧核糖核苷酸为T的纯合体；TT基因型鸡的体重在统计学上高于GT基因型鸡的体重。

所述方法(二)还可包括选择待测鸡的步骤；所述待测鸡为GT基因型的鸡和TT基因型的鸡。