[发明专利]供体角膜HBV和TP的荧光定量PCR检测试剂盒及检测方法有效
| 申请号: | 201010147924.6 | 申请日: | 2010-04-13 |
| 公开(公告)号: | CN101851687A | 公开(公告)日: | 2010-10-06 |
| 发明(设计)人: | 谢立信;陈鹏 | 申请(专利权)人: | 山东省眼科研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12Q1/04;G01N21/64 |
| 代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 张中南 |
| 地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 供体 角膜 hbv tp 荧光 定量 pcr 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种供体角膜HBV和TP的荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于试剂盒由DNA提取试剂、DNA扩增试剂和阳性工作标准品组成;其中DNA提取试剂为硅胶膜通用型DNA小提试剂盒;DNA扩增试剂包括2.5X PCR预混试剂,20X荧光探针增强剂,正向及反向HBV引物,HBV荧光探针,正向及反向TP引物,TP荧光探针,无核酸酶的蒸馏水,HBV阴性对照,HBV阳性对照,TP阴性对照,TP阳性对照;阳性工作标准品分别为含有HBV正向和反向引物扩增的目的序列的pUC57-HBV质粒,含有TP正向和反向引物扩增的目的序列的pUC57-TP质粒。上述的HBV和TP的引物、荧光探针与阳性工作标准品序列如下:
HBV:
正向HBV引物:TCCTGGCTATCGCTGGATGT
反向HBV引物:AGGCATAGCAGCAGGATGAAG
HBV荧光探针序列:FAM+CTGCGGCGTTTTATCATATTCC+TAMRA
HBV扩增片段长度为66bp;
HBV阳性工作标准品的目的序列为:
Tggccaaaattcgcagtccccaacctccaatcactcaccaacctcttgtcctccaacttgtcctggctatcgctgg
atgtgtctgcggcgttttatcatattcctcttcatcctgctgctatgcctcatcttcttgttggttcttctggactaccaa
ggtatgttgcccgtttgtcctctacttccaggaacatcaactaccagcacgggaccatgcagaacctgcacgatt
cctgctca
HBV阳性工作标准品的目的基因的片段长度为240bp;
TP:
正向TP引物:ATCCGGCATATGTCCAAGCT
反向TP引物:TGTGAGCGTCTCATCATTCCA
TP荧光探针序列:FAM+TCATGCACCAGCTTCGACGTCT+TAMRA
TP扩增片段长度为65bp
TP阳性工作标准品的目的序列为:
gtgtacatgtgcacgtagcactaatgtcgagactgaaaaggagtgcacagaacagcatggggtatctgcatctg
ctgtgcaggatccggcatatgtccaagctgtcatgcaccagcttcgacgtctttggaatgatgagacgctcacac
ttgttatgcataatggaaagtttgattatcacgttatgcatcgtgcaggcgtttttgagcactgtgcatgtaatattttc
gatacgatggt
TP阳性工作标准品的目的基因的片段长度为240bp。
2.权利要求1的检测试剂盒应用于临床眼库供体少量结膜组织标本中的HBV和TP的检测。
3.检测试剂盒对眼库供体HBV和TP DNA进行检测的方法:
(1)供体眼球结膜组织DNA的提取和阳性工作标准品的构建:取供体眼球的结膜组织块5mg,放入离心管中,应用DNA提取试剂提取组织DNA作为DNA模板,用于下面的扩增反应;
(2)HBV或TP DNA的扩增:
在两组反应管中分别加入下列组分:
2.5X PCR预混试剂: 8μL
正向HBV或TP引物(5pmol/μL): 1μL
反向HBV或TP引物(5pmol/μL): 1μL
HBV或TP荧光探针(5pmol/μL): 0.5μL
20X荧光探针增强剂: 1μL
DNA模板: 5pg-50ng
无核酸酶的蒸馏水: 至20μL
其中HBV组DNA模板为108-101拷贝/μL倍比稀释的HBV阳性工作标准品和从供体眼球的结膜组织提取的DNA;TP组DNA模板为108-101拷贝/μL倍比稀释的TP阳性工作标准品和从供体眼球的结膜组织提取的DNA,每个模板设立三个复孔,混匀离心后进行扩增反应,具体程序如下:
当供体眼球的结膜组织的DNA与阳性工作标准品同时进行反应后,制作出标准曲线,再将供体眼球的结膜组织的DNA扩增曲线得到的Ct值代入标准曲线,就可以得到供体眼球的结膜组织的HBV或TP DNA的拷贝数,从而确定供体角膜组织内是否感染致病病原体HBV或TP及其数量。
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