[发明专利]供体角膜HBV和TP的荧光定量PCR检测试剂盒及检测方法有效

专利信息
申请号: 201010147924.6 申请日: 2010-04-13
公开(公告)号: CN101851687A 公开(公告)日: 2010-10-06
发明(设计)人: 谢立信;陈鹏 申请(专利权)人: 山东省眼科研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12Q1/04;G01N21/64
代理公司: 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 代理人: 张中南
地址: 266071 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 供体 角膜 hbv tp 荧光 定量 pcr 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种供体角膜HBV和TP的荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于试剂盒由DNA提取试剂、DNA扩增试剂和阳性工作标准品组成;其中DNA提取试剂为硅胶膜通用型DNA小提试剂盒;DNA扩增试剂包括2.5X PCR预混试剂,20X荧光探针增强剂,正向及反向HBV引物,HBV荧光探针,正向及反向TP引物,TP荧光探针,无核酸酶的蒸馏水,HBV阴性对照,HBV阳性对照,TP阴性对照,TP阳性对照;阳性工作标准品分别为含有HBV正向和反向引物扩增的目的序列的pUC57-HBV质粒,含有TP正向和反向引物扩增的目的序列的pUC57-TP质粒。上述的HBV和TP的引物、荧光探针与阳性工作标准品序列如下:

HBV:

正向HBV引物:TCCTGGCTATCGCTGGATGT

反向HBV引物:AGGCATAGCAGCAGGATGAAG

HBV荧光探针序列:FAM+CTGCGGCGTTTTATCATATTCC+TAMRA

HBV扩增片段长度为66bp;

HBV阳性工作标准品的目的序列为:

Tggccaaaattcgcagtccccaacctccaatcactcaccaacctcttgtcctccaacttgtcctggctatcgctgg

atgtgtctgcggcgttttatcatattcctcttcatcctgctgctatgcctcatcttcttgttggttcttctggactaccaa

ggtatgttgcccgtttgtcctctacttccaggaacatcaactaccagcacgggaccatgcagaacctgcacgatt

cctgctca

HBV阳性工作标准品的目的基因的片段长度为240bp;

TP:

正向TP引物:ATCCGGCATATGTCCAAGCT

反向TP引物:TGTGAGCGTCTCATCATTCCA

TP荧光探针序列:FAM+TCATGCACCAGCTTCGACGTCT+TAMRA

TP扩增片段长度为65bp

TP阳性工作标准品的目的序列为:

gtgtacatgtgcacgtagcactaatgtcgagactgaaaaggagtgcacagaacagcatggggtatctgcatctg

ctgtgcaggatccggcatatgtccaagctgtcatgcaccagcttcgacgtctttggaatgatgagacgctcacac

ttgttatgcataatggaaagtttgattatcacgttatgcatcgtgcaggcgtttttgagcactgtgcatgtaatattttc

gatacgatggt

TP阳性工作标准品的目的基因的片段长度为240bp。

2.权利要求1的检测试剂盒应用于临床眼库供体少量结膜组织标本中的HBV和TP的检测。

3.检测试剂盒对眼库供体HBV和TP DNA进行检测的方法:

(1)供体眼球结膜组织DNA的提取和阳性工作标准品的构建:取供体眼球的结膜组织块5mg,放入离心管中,应用DNA提取试剂提取组织DNA作为DNA模板,用于下面的扩增反应;

(2)HBV或TP DNA的扩增:

在两组反应管中分别加入下列组分:

2.5X PCR预混试剂:                      8μL

正向HBV或TP引物(5pmol/μL):            1μL

反向HBV或TP引物(5pmol/μL):            1μL

HBV或TP荧光探针(5pmol/μL):            0.5μL

20X荧光探针增强剂:                     1μL

DNA模板:                               5pg-50ng

无核酸酶的蒸馏水:                      至20μL

其中HBV组DNA模板为108-101拷贝/μL倍比稀释的HBV阳性工作标准品和从供体眼球的结膜组织提取的DNA;TP组DNA模板为108-101拷贝/μL倍比稀释的TP阳性工作标准品和从供体眼球的结膜组织提取的DNA,每个模板设立三个复孔,混匀离心后进行扩增反应,具体程序如下:

当供体眼球的结膜组织的DNA与阳性工作标准品同时进行反应后,制作出标准曲线,再将供体眼球的结膜组织的DNA扩增曲线得到的Ct值代入标准曲线,就可以得到供体眼球的结膜组织的HBV或TP DNA的拷贝数,从而确定供体角膜组织内是否感染致病病原体HBV或TP及其数量。

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