[发明专利]使用外来体来确定表现型的方法和系统

权利要求书

1.一种表征受试者中的表现型的方法，该方法包括：

i)确定得自所述的受试者的生物学样品中的一种或多种外来体的生物学特征；以及

ii)根据所述的生物学特征来表征所述受试者中的表现型，

其中根据所述的生物学特征的所述表现型的所述表征具有至少70％敏感性。

2.一种表征受试者中的表现型的方法，该方法包括：

i)确定得自所述的受试者的生物学样品中的一种或多种外来体的生物学特征；

ii)确定具有所述的生物学特征的所述的一种或多种外来体的量；以及

iii)根据所述的量来表征所述的受试者中的表现型，

其中所述的表征具有至少70％敏感性。

3.权利要求1或2所述的方法，其中所述的敏感性为至少80％。

4.权利要求1或2所述的方法，其中所述的敏感性为至少90％。

5.权利要求1或2所述的方法，其中所述的特异性为至少80％。

6.权利要求1或2所述的方法，其中所述的特异性为至少100％。

7.权利要求1或2所述的方法，其中所述的生物学样品为体液样品。

8.权利要求7所述的方法，其中所述样品的体积少于2mL。

9.权利要求7所述的方法，其中所述的体液为外周血，血清，血浆，腹水，尿，脑脊液(CSF)，痰，唾液，骨髓，滑液，水样液，羊膜液，耳垢，乳汁，支气管肺泡灌洗液，精液，前列腺液，考珀液或预射精液，女性射出液，汗液，排泄物，头发，泪液，囊液，胸腔积液和腹水液，心包液，淋巴液，食物糜，乳糜，胆汁，组织液，月经，脓，皮脂，呕吐物，阴道分泌物，黏膜分泌物，稀便，胰液，鼻腔灌洗液，支气管抽吸液，囊胚腔液或脐带血。

10.权利要求1或2所述的方法，其中所述的外来体的直径为大约30nm至大约80nm。

11.权利要求9所述的方法，其中所述的外来体的直径为大约30nm至大约200nm。

12.权利要求1或2所述的方法，其中通过体积排阻色谱、密度梯度离心、差速离心、纳米膜超滤、免疫吸附捕获、亲和纯化、微流体分离或它们的组合物来分离所述的外来体。

13.权利要求1或2所述的方法，其中所述的生物学样品在确定所述的生物学特征之前并非富集用于外来体。

14.权利要求1或2所述的方法，其中所述的外来体为细胞源特异性的外来体。

15.权利要求14所述的方法，其中所述的细胞源为肿瘤或癌症细胞。

16.权利要求14所述的方法，其中所述的细胞源为肺、胰腺、胃、肠、膀胱、肾、卵巢、睾丸、皮肤、结肠直肠、乳腺、前列腺、脑、食道、肝脏、胎盘或胚胎细胞。

17.权利要求1或2所述的方法，其中所述的外来体为尿的外来体。

18.权利要求1或2所述的方法，其中所述的生物学特征包括表达的水平、存在情况、缺乏情况、突变情况、拷贝数的变化、截短的情况、复制、插入、修饰、序列的变化或者生物标志物的分子结合情况。

19.权利要求1或2所述的方法，其中所述的生物学特征包括分离的外来体的定量、外来体半衰期变化的临时评价、循环外来体的半衰期、外来体新陈代谢的半衰期或者外来体的活性。

20.权利要求18所述的方法，其中所述的生物标志物选自：核酸、肽、蛋白质、脂质、抗原、碳水化合物和蛋白聚糖。

21.权利要求20所述的方法，其中所述的核酸为DNA或RNA。

22.权利要求20所述的方法，其中所述的核酸为扩增的。

23.权利要求21所述的方法，其中所述的DNA选自：双链DNA、单链DNA、互补DNA和非编码DNA。

24.权利要求21所述的方法，其中所述的RNA选自：mRNA，miRNA，snoRNA，snRNA，rRNAs，tRNAs，siRNA，hnRNA和shRNA。

25.权利要求20所述的方法，其中所述的生物标志物为选自图1中的抗原。