[发明专利]细环病毒分离株和组合物

说明书

本发明在35 USC第119条下要求2008年10月16日提出的美国临时专利申请61/196468的权益和优先权。在本文中，为了美国国家阶段的目的，‘468申请的全部内容通过参考整体并入本文，如同其被充分阐述。

技术领域

本发明涉及细环病毒(Torque teno virus)(“TTV”)的新核苷酸和氨基酸序列，包括其新基因型，所有这些用于制备治疗和预防猪和其他动物的疾病的疫苗。按照本发明实践提供的疫苗有效对抗多种猪TTV基因型和分离株。诊断和治疗用多克隆和单克隆抗体也是本发明的特征，如在病毒繁殖和疫苗制备中有用的感染性克隆。特别重要的是，其中公开了疫苗，其包含作为抗原的单TTV开放阅读框的表达蛋白质——最特别的是来自ORF1或ORF2，以及还包含全长ORF1和ORF2-编码蛋白质的片段。

背景技术

细环病毒(“TTV”)也被称为输血传染的病毒，其通常被归于环病毒科(Circoviridae)家族。通常认为，TTV首先分离自人输注患者(例如参见Nishizawa等，Biochem.Biophys.Res.Comm.vol.241，1997，pp.92-97)。后来，TTV或TTV-样病毒已经从包括猪在内的其他哺乳动物中得以鉴定，而且很多菌株或分离物已经被公布(例如参加McKeown等，Vet.Microbiol.vol.104，2004，pp 113-117)。

后来的工作显示，TTV和TTV-类病毒非常普通；然而，TTV的发病机理以及其对其他疾病状态(例如，由其他病毒和细菌引起的那些)可能产生的作用仍然是不清楚的。例如，TTV感染在人类中包括甚至在健康个体中看起来是普遍的，而且此类感染通常是无症状的，并且保留数年之久。另外，通常不能在细胞培养中繁殖该病毒并且缺乏任何明确的机械论疾病模型，这使得TTV生物学的任何总体表征是困难的。尽管TTV病毒血症在遭受其他病毒病(诸如肝炎或HIV/AIDS)的人类患者中增加，但是也有相当多的医学文献提出TTV实际上是无毒性的，并且期待与已知疾病状态的任何清楚的实际的联系。例如参见Biagini等，Vet.Microbiol.vol.98，2004，pp.95-101。

关于猪，情况类似。有相当多的工作提出，TTV感染与很多疾病有关并促进很多疾病，诸如猪环状病毒病(及其各种临床表现，诸如断奶仔猪多系统衰弱综合征(postweaning multisystemic wasting syndrome)和由于肺损害而复杂化的呼吸系统疾病)和PRRSV-相关疾病(猪呼吸繁殖综合征病毒)。例如参见已公布的国际专利申请WO2008/150275和WO2008/127279。Krakowka等也报告了猪中一种经常致命的疾病，称为PDNS(猪皮炎及神经病变综合症(porcine dermatitis and neuropathy syndrome))，其被描述为弥漫性血管内凝血的表现形式，并且由血清型1TTV和PRRSV病毒引起的混合感染可能牵涉其中(Am.J.Vet Res，vol 69(12)，2008，pp.1615-1622。PDNS病也与猪环状病毒病(特别是PCV-2)有关而且也与细菌感染相关。因此，尽管已经完成相当多的工作，但是决定性关联猪TTV感染与具体病理学的工作仍然很少。然而，已经相当清楚的是，TTV感染可加强很多疾病状态。因此，对各类TTV试剂存在需求，诸如高亲和性抗体，以及例如TTV的肽片段或高度免疫的全毒粒，其促进我们对总体TTV生物学的理解以及直接或间接对TTV可能作用的很多疾病状态接种。

因此，尽管TTV是猪疾病的主要病因因子这种可能性存在，但是看起来更可能的是，很多猪疾病需要一种以上的病毒存在，或者某些“主要”病原体的主要作用被TTV感染加强。如所述，通过向受侵袭或潜在受侵袭动物施用抗TTV剂，猪的很多疾病可以被治疗或减轻，这种可能性是存在的。尽管对TTV具有广泛接受的兴趣，但是有效的疫苗还没有出现。