[发明专利]对DNA进行定量或检测的方法无效

专利信息
申请号: 200980129483.2 申请日: 2009-06-11
公开(公告)号: CN102105585A 公开(公告)日: 2011-06-22
发明(设计)人: 冨原祥隆;佐藤日出夫;樽井弘和 申请(专利权)人: 住友化学株式会社
主分类号: C12N15/09 分类号: C12N15/09;C12Q1/25;C12Q1/68;G01N33/53
代理公司: 中科专利商标代理有限责任公司 11021 代理人: 朱丹
地址: 日本国*** 国省代码: 日本;JP
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摘要:
搜索关键词: dna 进行 定量 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种方法,其是对标本中所含的具有目标DNA区域的DNA进行定量或检测的方法,其特征在于,具备:

(1)从标本制备要检测目标DNA区域的DNA的第一工序;

(2)用DNA甲基化酶对由第一工序制备的DNA进行处理的第二工序;

(3)从经第二工序处理后的DNA制备单链甲基化DNA的第三工序;

(4)第四工序,其中,使由第三工序制备的单链甲基化DNA、甲基化DNA抗体、具有如下碱基序列的特定寡核苷酸混合,形成具有甲基化后的目标DNA区域的单链甲基化DNA、该甲基化DNA抗体与该特定寡核苷酸的复合体,

所述碱基序列不抑制单链甲基化DNA中的目标DNA区域的被甲基化后的一个以上的碱基与该甲基化DNA抗体的结合,且可以通过互补性与具有目标DNA区域的单链DNA结合;及

(5)第五工序,其中,对由第四工序形成的复合体中所含的所述甲基化DNA抗体,利用其识别功能进行定量或检测,由此,对所述单链甲基化DNA中的具有目标DNA区域的DNA进行定量或检测。

2.根据权利要求1所述的方法,其中,

第四工序中,在含有二价阳离子的反应体系中使复合体形成。

3.根据权利要求2所述的方法,其中,

二价阳离子是镁离子。

4.根据权利要求1~3中任一项所述的方法,其中,

在第五工序开始之前,使第四工序形成的复合体中所含的抗体和支持体结合。

5.根据权利要求1~3中任一项所述的方法,其中,

在第五工序开始之前,使第四工序形成的复合体中所含的特定寡核苷酸和支持体结合。

6.根据权利要求1~5中任一项所述的方法,其中,

DNA甲基化酶是胞嘧啶甲基化酶。

7.根据权利要求1~6中任一项所述的方法,其中,

DNA甲基化酶是SssI甲基化酶。

8.根据权利要求1~7中任一项所述的方法,其中,

甲基化DNA抗体是甲基胞嘧啶抗体。

9.根据权利要求1~8中任一项所述的方法,其中,

标本是下述任一种标本:

(a)哺乳动物来源的血液、体液、粪尿、体分泌物、细胞溶解液或组织溶解液;

(b)从选自哺乳动物来源的血液、体液、粪尿、体分泌物、细胞溶解液及组织溶解液的一种中提取的DNA;

(c)以从选自哺乳动物来源的组织、细胞、组织溶解液及细胞溶解液的一种中提取的RNA为模板而制作的DNA;

(e)从细菌、真菌或病毒中提取的DNA;或

(f)以从细菌、真菌或病毒中提取的RNA为模板而制作的DNA。

10.根据权利要求1~9中任一项所述的方法,其中,

要检测目标DNA区域的DNA是下述的任一种DNA:

(a)预先用不以目标DNA区域为识别剪切位点的限制酶进行了消化处理的DNA、

(b)预先精制后的DNA、

(c)血液中的游离DNA、

(d)微生物基因组来源的DNA、或

(e)通过逆转录酶由RNA生成的DNA。

11.根据权利要求1~10中任一项所述的方法,其中,

在第四工序中的复合体形成时,添加反向寡核苷酸。

12.根据权利要求1~11中任一项所述的方法,其中,

在第一工序中,在用于从标本制备DNA的DNA提取操作中所使用的溶液中的钠盐的浓度为100mM以上1000mM以下。

13.根据权利要求1~11中任一项所述的方法,其中,

在第一工序中,在用于从标本制备DNA的DNA提取操作中所使用的溶液中的钠盐的浓度为100mM以上200mM以下。

14.一种方法,其是筛选癌症患者来源的标本的方法,其中,包括如下工序:

利用权利要求1~13中任一项所述的方法使用被检者来源的标本而定量或检测的DNA的定量结果或检测结果、与利用相同方法使用健康者来源的标本而定量或检测的DNA的定量结果或检测结果之间的差异如有显著性意义,则将被检者来源的标本作为癌症患者来源的标本进行评价,根据该评价的结果来鉴定癌症患者来源的标本。

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