[发明专利]新鉴定的人类鼻病毒HRV-C和检测HRV-C的方法和试剂盒有效
| 申请号: | 200980113369.0 | 申请日: | 2009-04-16 |
| 公开(公告)号: | CN102007208A | 公开(公告)日: | 2011-04-06 |
| 发明(设计)人: | R·冈萨雷斯;王健伟;相子春;申昆玲 | 申请(专利权)人: | 生物梅里埃公司;中国医学科学院病原生物学研究所;首都医科大学附属北京儿童医院 |
| 主分类号: | C12N7/00 | 分类号: | C12N7/00;C12N15/11;C12N15/41;C07K14/095;C12Q1/68;C07H21/04;C12R1/93 |
| 代理公司: | 永新专利商标代理有限公司 72002 | 代理人: | 左路;林晓红 |
| 地址: | 法国迈合西*** | 国省代码: | 法国;FR |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 鉴定 人类 病毒 hrv 检测 方法 试剂盒 | ||
1.分离的HRV-C鼻病毒,其具有RNA基因组,所述基因组包含选自如下一组中的多核苷酸序列:
(i)SEQ ID NO:1所代表的序列,
(ii)与SEQ ID NO:1具有至少75%相同性的序列,和
(iii)(i)或(ii)所代表的序列的互补序列。
2.权利要求1的病毒,特征在于其基因组包含至少一个编码多蛋白的读框,所述多蛋白的序列由SEQ ID NO:20代表。
3.可从权利要求1的病毒的基因组获得的核酸序列。
4.核酸片段,特征在于其包含至少50个连续核苷酸、优选地至少100个连续核苷酸或由所述至少50个连续核苷酸、优选地至少100个连续核苷酸组成,所述至少50个连续核苷酸、优选地至少100个连续核苷酸来自从SEQ ID NO:1的第627位核苷酸开始至第7064位核苷酸结束的核苷酸序列或来自与从SEQ ID NO:1的第627位核苷酸开始至第7064位核苷酸结束的核苷酸序列具有至少85%相同性的核苷酸序列或来自它们的互补序列。
5.权利要求4的核酸片段,特征在于其选自如下一组:
-SEQ ID NO:21、与SEQ ID NO:21具有至少85%相同性的序列或它们的互补序列,
-SEQ ID NO:22、与SEQ ID NO:22具有至少85%相同性的序列或它们的互补序列,和
-SEQ ID NO:23、与SEQ ID NO:23具有至少85%相同性的序列或它们的互补序列。
6.引物对,用于通过PCR扩增来扩增样品中的HRV-C毒株,其中至少一个引物的序列由18-30个连续核苷酸组成,所述18-30个连续核苷酸位于从SEQ ID NO:1的大约第556位核苷酸至大约第886位核苷酸的区域内。
7.权利要求6的引物对,其中正向引物由SEQ ID NO:6所示核苷酸序列组成,反向引物由SEQ ID NO:7所示核苷酸序列组成。
8.检测样品中的HRV-C毒株的方法,其步骤包括:
(a)从所述样品中提取核酸,
(b)扩增所提取的核酸,和
(c)确定一或多种HRV-C特异性核酸序列的存在,
其中所述扩增步骤例如通过使用权利要求6或7所定义的至少一个引物对进行RT-PCR扩增而进行。
9.权利要求8的方法,其中所述样品选自人类鼻部和口腔样品和培养上清液。
10.用于扩增样品中的HRV-C毒株的试剂盒,其包括至少一个权利要求6或7所定义的引物对。
11.权利要求1所定义的多核苷酸序列或其片段在设计用于检测样品中的HRV-C鼻病毒的引物或探针中的用途。
12.分离的蛋白质,其由权利要求1所定义的多核苷酸序列编码。
13.分离的蛋白质,其由具有权利要求4所定义的核苷酸序列的核酸片段编码。
14.分离的蛋白质,其包含SEQ ID NO:20的氨基酸序列或由SEQ IDNO:20的氨基酸序列组成。
15.多肽,特征在于其氨基酸序列包含权利要求12-14中任一项所定义的蛋白质的至少15个连续的氨基酸、优选地至少20个连续的氨基酸、有利地至少30个连续的氨基酸,或由权利要求12-14中任一项所定义的蛋白质的至少15个连续的氨基酸、优选地至少20个连续的氨基酸、有利地至少30个连续的氨基酸组成。
16.抗体,其对权利要求12-14中任一项所定义的蛋白质的表位具有特异性。
17.用于检测样品中的HRV-C毒株的方法,其步骤包括将所述样品与权利要求12-14中任一项所定义的蛋白质相接触或与权利要求15所定义的多肽相接触,并检测所述蛋白质或多肽与抗HRV-C抗体所形成的免疫复合物的存在。
18.用于检测样品中的HRV-C毒株的方法,其步骤包括将所述样品与至少一种权利要求16所定义的抗体相接触,并检测抗体/HRV-C蛋白质的免疫复合物的存在。
19.权利要求17的方法,其中所述样品是选自血液、血浆和血清的人类样品。
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