[发明专利]一种鉴定糖基化肽段的方法及装置

权利要求书

1.一种鉴定糖基化肽段的方法，其特征在于其包括如下步骤：

(1)质谱图过滤：选择糖基化肽段样品的串级质谱图中信噪比足够高具有解析意义的质谱峰；

(2)获取单电荷质量数：若鉴定所用质谱为MALDI质谱，则取步骤(1)所选峰的质量数为其单电荷质量数，若鉴定所用质谱为ESI质谱，则将步骤(1)所选峰的质量数进行去卷积化处理，获得其单电荷质量数；

(3)构建质量数网络：将步骤(2)所得的单电荷质量数两两配对相减得质量差异数，之后根据各组配对单电荷质量数及其质量差异数，采用Matlab软件中的Biograph模块，构建出包含相互独立的网络模块的质量数网络；

(4)理论库检索：对Matlab软件的Biograph模块显示出的该网络模块的关系树中以任一节点为起点的任一下游质量数路径中的各单电荷质量数，在理论库中进行检索，寻找与该质量数路径中各节点的单电荷质量数，在可接受的质量数容差范围内相符的，且满足下述标准a和b的糖基化肽段，则该质量数路径最下游节点检索出的糖基化肽段即为预测糖基化肽段；

标准a、包含相同的肽段，

标准b、检索的质量数路径中，任一节点与其上游节点相比，检索出的糖基化肽段中任一种单糖单元的个数相等或更多，且至少一种单糖单元的个数更多；

其中，所述的理论库是指，由肽段理论库中的各蛋白肽段与糖链理论库中的各糖链任选两两组合的糖基化肽段对应的质量数集合。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(1)中，所述的糖基化肽段样品的串级质谱图为符合下述标准的质谱图：谱图中含有366、528和690这三个质量数的质谱峰中的一个或多个，且信噪比排前20以内；容差范围为2.0道尔顿以内。

3.如权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(1)中，所述的串级质谱图所来源的质谱仪为ESI-LTQ-ORBITRAP或MALDI-QIT-TOF。

4.如权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(1)中，所述的信噪比足够高具有解析意义的质谱峰为信噪比最高的前30～70个峰。

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于：步骤(1)中，所述的信噪比足够高具有解析意义的质谱峰为信噪比最高的前50个峰。

6.如权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(3)中，若待鉴定的糖基化肽段样品属于N-糖苷键型，则：

当质谱峰来源为MALDI-QIT质谱仪时，在所述的配对单电荷质量数中，选择在可接受的质量差异数容差范围内，信噪比最高且质量数连续相差83和120道尔顿的一组单电荷质量数，以及所有质量差异数为132、146、162、203、291、324、365、589和689中一个或多个的配对单电荷质量数，进行后续的质量数网络的构建；

当质谱峰来源为ESI-LTQ-ORBITRAP质谱仪时，在所述的配对单电荷质量数中，选择在可接受的质量差异数容差范围内，所有质量差异数为132、146、162、203、291、324、365、589和689中一个或多个的配对单电荷质量数，进行后续的质量数网络的构建；

其中，所述的可接受的质量差异数容差范围为0.5～2道尔顿。

7.如权利要求6所述的方法，其特征在于：所述的可接受的质量差异数容差范围为1.0～1.5道尔顿。

8.如权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(4)中，所述的网络模块首选包含单电荷质量数数目最多的网络模块；若不能得到符合步骤(4)中搜索标准的预测糖基化肽段，则选择包含单电荷质量数数目次多的网络模块，直至获得符合步骤(4)中搜索标准的预测糖基化肽段；或者，在此之后，再选择其他网络模块进行分析，以获得更全面的预测糖基化肽段的鉴定结果。

9.如权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(4)中，所述的可接受的质量数容差范围为2.0道尔顿以内。

10.如权利要求9所述的方法，其特征在于：步骤(4)中，所述的可接受的质量数容差范围为1.0道尔顿。