[发明专利]11个用于区分原发性肝癌癌组织及癌旁组织的microRNA标志物无效

专利信息
申请号: 200910194812.3 申请日: 2009-08-31
公开(公告)号: CN102002491A 公开(公告)日: 2011-04-06
发明(设计)人: 何祥火;魏霖;梁琳慧;顾健人 申请(专利权)人: 上海市肿瘤研究所
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12N15/63;C12Q1/68;C40B40/06
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 徐迅
地址: 200032 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 11 用于 区分 原发性 肝癌 组织 microrna 标志
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物技术领域,更具体地,本发明涉及一类可用于区分原发性肝癌癌组织及癌旁组织的microRNA标志物以及用途。本发明还涉及检测所述microRNA标志物的芯片和试剂盒。

背景技术

原发性肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一,每年新发病例约占全球50%。肝癌的恶性程度高,发展迅速,治疗困难,病死率高。因此,肝癌的尽早诊断就愈发显得迫切。

任何事物的发生发展都处于内外因共同作用之下,内因为主,外因为辅。基因作为生命的遗传介质,在生物体的生、老、病、死中处于基础内因的地位。绝大部分基因通过转录生成核糖核酸,再翻译生成蛋白质而发挥生物学功能。

microRNA(miR或miRNA,微小RNA)是一类在较高等的真核生物体内广泛存在的,长度约18-26个碱基的单链RNA分子。它可以通过碱基配对原则特异性地与一些mRNA上的靶位点相结合,引起靶mRNA降解或翻译抑制,进而在转录后水平对靶基因进行调控。

microRNA来源于长度约为1000bp的长链RNA初始转录产物(Pri-miRNA),Pri-miRNA分子在细胞核中经Drosha酶剪切形成长度约60~80nt的具有茎环结构的miRNA前体(Pre-miRNA)。Pre-miRNA转运至胞质后,被Dicer酶进一步切割成长约22nt的双链miRNA。双链miRNA解开后,成熟的miRNA进入RNA诱导基因沉默复合物(RNA-induced silencing complex,RISC),与互补mRNA完全或不完全配对,降解靶mRNA或阻遏其表达。

尽管microRNA在细胞总RNA中所占的比重很小,但由于它可以高效地对所有具有靶位点的mRNA产生调控作用,microRNA在生物体的发育乃至肿瘤的发生、发展过程所起的作用仍不可小视。

然而,迄今为止,本领域对于与肿瘤(如肝癌)相关的microRNA了解甚少,因此本领域迫切需要进一步地分离各种microRNA,尤其是与肿瘤的发生、转移、复发或检测有关的microRNA。

发明内容

本发明的目的就是提供一类新的、可用于区分原发性肝癌癌组织及癌旁组织的microRNA标志物。

本发明的另一目的就是提供所述microRNA标志物的用途。

在本发明的第一方面,提供了一种分离的miRNA,所述的miRNA选自:

(i)序列如SEQ ID NO:n所示的miRNA,其中n为选自1-11的正整数;或

(ii)与SEQ ID NO:n所示序列互补的miRNA。

在另一优选例中,所述的miRNA分离自人。

在本发明的第二方面,提供了一种miRNA集(set)或组合(combination),所述的集或组合由序列如SEQ ID NO:1-11所示的11种miRNA所构成。

在本发明的第三方面,提供了一种分离的或人工构建的前体miRNA,所述的前体miRNA能在人细胞内剪切并表达成本发明第一方面中所述的miRNA。

在本发明的第四方面,提供了一种分离的多核苷酸,所述的多核苷酸能被人细胞转录成前体miRNA,所述的前体miRNA能在人细胞内被剪切且表达成本发明第一方面中所述的miRNA。

在另一优选例中,所述的多核苷酸具有式I所示的结构:

Seq正向-X-Seq反向    式I,

式I中,

Seq正向为能在人细胞中表达成所述的miRNA的核苷酸序列,

Seq反向为与Seq正向基本上互补或完全互补的核苷酸序列;

X为位于Seq正向和Seq反向之间的间隔序列,并且所述间隔序列与Seq正向和Seq反向不互补,

并且式I所示的结构在转入人细胞后,形成式II所示的二级结构:

式II,

式II中,Seq正向、Seq反向和X的定义如上述,

||表示在Seq正向和Seq反向之间形成的碱基互补配对关系。

在本发明的第五方面,提供了一种载体,它含有本发明第一方面中所述的miRNA,或第四方面中所述的多核苷酸。

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