[发明专利]抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片和检测方法有效

专利信息
申请号: 200910193799.X 申请日: 2009-11-10
公开(公告)号: CN101698885A 公开(公告)日: 2010-04-28
发明(设计)人: 许嘉森;郭元杰;罗彩英;吴诗扬;杨惠夷 申请(专利权)人: 广州益善生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 代理人: 万志香;曾旻辉
地址: 510663 广东省广州市广州科*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 代谢 化疗 药物 疗效 相关 基因 mrna 表达 水平 检测 芯片 方法
【权利要求书】:

1.一种抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片,其特征是,包括有:

(1)与胺基修饰的支持探针偶联的微球,每条支持探针主要包括5’端的间隔臂序列和 3’端能与支持延伸探针互补配对的特异性序列P1,所述支持探针选自SEQ.NO.1- SEQ.NO.5,每个目标基因选用一种微球,每种微球具有不同的荧光编码;

(2)连接支持探针与目标基因mRNA的支持延伸探针,每条支持延伸探针主要包括5’端 能与对应的目标基因mRNA结合的特异性序列P2、间隔臂序列、3’端能与对应的支 持探针的特异性序列P1互补配对的P3序列,所述支持延伸探针的特异性序列P2包 括有:针对RRM1基因的选自SEQ.NO.6-SEQ.NO.10中的2条或2条以上、和/或针对 TYMS基因的选自SEQ.NO.11-SEQ.NO.15中的2条或2条以上;以及针对B2M基因 的选自SEQ.NO.16-SEQ.NO.20中的2条或2条以上,针对TFRC基因的选自 SEQ.NO.21-SEQ.NO.25中的2条或2条以上,和针对TBP基因的选自SEQ.NO.26 -SEQ.NO.30中的2条或2条以上;

(3)扩增延伸探针,每条扩增延伸探针包括有5’端能与目标基因mRNA结合的特异性 序列P4、间隔臂序列、3’端序列P5,3’端还修饰有生物素;所述扩增延伸探针 的特异性序列P4包括有:针对RRM1基因的选自SEQ.NO.31-SEQ.NO.40中的5条或 5条以上、和/或针对TYMS基因的选自SEQ.NO.41-SEQ.NO.50中的5条或5条以上; 以及针对B2M基因的选自SEQ.NO.51-SEQ.NO.60中的5条或5条以上,针对 TFRC基因的选自SEQ.NO.61-SEQ.NO.70中的5条或5条以上,和针对TBP基因 的选自SEQ.NO.71-SEQ.NO.80中的5条或5条以上;所述P5为不存在发夹结构, 探针内部和探针间不形成二聚体、不存在错配、与P1、P2、P3、P4和总mRNA之间 均不存在非特异性结合的序列。

2.根据权利要求1所述的抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片,其特征 是,还包括有填充序列,包括有:针对RRM1基因的选自SEQ.NO.81-SEQ.NO.86中的一条或 多条、针对TYMS基因的选自SEQ.NO.87-SEQ.NO.90中的一条或多条、针对B2M基因的选自 SEQ.NO.91-SEQ.NO.98中的一条或多条,和/或针对TFRC基因的选自SEQ.NO.99- SEQ.NO.102中的一条或多条。

3.根据权利要求1或2所述的抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片,其 特征是,所述间隔臂序列为5-10个T。

4.根据权利要求1所述的抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片,其特 征是,所述P5的组成为CCTATGCCTCCCGTGTCTA。

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