[发明专利]抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片和检测方法有效
| 申请号: | 200910193799.X | 申请日: | 2009-11-10 |
| 公开(公告)号: | CN101698885A | 公开(公告)日: | 2010-04-28 |
| 发明(设计)人: | 许嘉森;郭元杰;罗彩英;吴诗扬;杨惠夷 | 申请(专利权)人: | 广州益善生物技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 万志香;曾旻辉 |
| 地址: | 510663 广东省广州市广州科*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 代谢 化疗 药物 疗效 相关 基因 mrna 表达 水平 检测 芯片 方法 | ||
1.一种抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片,其特征是,包括有:
(1)与胺基修饰的支持探针偶联的微球,每条支持探针主要包括5’端的间隔臂序列和 3’端能与支持延伸探针互补配对的特异性序列P1,所述支持探针选自SEQ.NO.1- SEQ.NO.5,每个目标基因选用一种微球,每种微球具有不同的荧光编码;
(2)连接支持探针与目标基因mRNA的支持延伸探针,每条支持延伸探针主要包括5’端 能与对应的目标基因mRNA结合的特异性序列P2、间隔臂序列、3’端能与对应的支 持探针的特异性序列P1互补配对的P3序列,所述支持延伸探针的特异性序列P2包 括有:针对RRM1基因的选自SEQ.NO.6-SEQ.NO.10中的2条或2条以上、和/或针对 TYMS基因的选自SEQ.NO.11-SEQ.NO.15中的2条或2条以上;以及针对B2M基因 的选自SEQ.NO.16-SEQ.NO.20中的2条或2条以上,针对TFRC基因的选自 SEQ.NO.21-SEQ.NO.25中的2条或2条以上,和针对TBP基因的选自SEQ.NO.26 -SEQ.NO.30中的2条或2条以上;
(3)扩增延伸探针,每条扩增延伸探针包括有5’端能与目标基因mRNA结合的特异性 序列P4、间隔臂序列、3’端序列P5,3’端还修饰有生物素;所述扩增延伸探针 的特异性序列P4包括有:针对RRM1基因的选自SEQ.NO.31-SEQ.NO.40中的5条或 5条以上、和/或针对TYMS基因的选自SEQ.NO.41-SEQ.NO.50中的5条或5条以上; 以及针对B2M基因的选自SEQ.NO.51-SEQ.NO.60中的5条或5条以上,针对 TFRC基因的选自SEQ.NO.61-SEQ.NO.70中的5条或5条以上,和针对TBP基因 的选自SEQ.NO.71-SEQ.NO.80中的5条或5条以上;所述P5为不存在发夹结构, 探针内部和探针间不形成二聚体、不存在错配、与P1、P2、P3、P4和总mRNA之间 均不存在非特异性结合的序列。
2.根据权利要求1所述的抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片,其特征 是,还包括有填充序列,包括有:针对RRM1基因的选自SEQ.NO.81-SEQ.NO.86中的一条或 多条、针对TYMS基因的选自SEQ.NO.87-SEQ.NO.90中的一条或多条、针对B2M基因的选自 SEQ.NO.91-SEQ.NO.98中的一条或多条,和/或针对TFRC基因的选自SEQ.NO.99- SEQ.NO.102中的一条或多条。
3.根据权利要求1或2所述的抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片,其 特征是,所述间隔臂序列为5-10个T。
4.根据权利要求1所述的抗代谢类化疗药物疗效相关基因mRNA表达水平检测液相芯片,其特 征是,所述P5的组成为CCTATGCCTCCCGTGTCTA。
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