[发明专利]针对TRAP-1样蛋白基因的siRNA序列及其用途无效

专利信息
申请号: 200910100258.8 申请日: 2009-07-02
公开(公告)号: CN101597606A 公开(公告)日: 2009-12-09
发明(设计)人: 陈峰;陈智;朱海红;周林福;刘东成 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;A61K48/00;A61P35/00;A61P1/16
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 代理人: 金 祺
地址: 310027浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 针对 trap 蛋白 基因 sirna 序列 及其 用途
【说明书】:

技术领域

发明属于生物技术,涉及基因工程技术领域和生物信息学领域,具体地涉及针对TRAP-1样蛋白(TLP)基因的siRNA靶序列的设计、合成及其在体外抑制肝脏肿瘤细胞生长、抑制肝纤维化形成的应用。

背景技术

RNA干扰(RNA interference,RNAi)现象的发现,被《SCIENCE》杂志和美国科学促进会评为2002年十大科学成就之一。RNA干扰是指同源双链RNA的导入引起目标基因的不表达或减效表达,在哺乳动物细胞中,21-23个核苷酸长度的双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA),可有效降解同源RNA,从而阻断蛋白质的表达,这些特定长度的dsRNA被称为siRNA(small interfering RNAs)。RNA干扰被称为RNA基础上的细胞“免疫”系统。

经证实RNA干扰技术具有以下特点:(1)特异性高:一个碱基的不同就可导致作用的显著降低;(2)高效:少量siRNA分子就能较彻底抑制细胞内相应基因的表达;(3)稳定:由于RNA干扰采用的是双链RNA,它比较稳定,不易被降解,因此RNA干扰不仅在体外,而且在动物体内亦具有较好的效果;(4)筛选周期短:针对某一基因的有效siRNA序列筛选的方法较简单,因此研发周期较短。

RNAi在HIV的体外实验中取得了较理想的结果。Rossi等将HIV-1编码rev的基因和与它同源的双链RNA共转染293细胞,rev基因的表达被显著抑制;同时将siRNA的抑制效应与反义RNA和核酶等进行了比较,发现只有siRNA组抑制了HIV rev-EGFP的表达,其抑制率达到90%,远优于反义RNA和核酶组,这一结果同样被Novina等学者所证实。Novina等用针对CD4的dsRNA能将细胞表面HIV病毒的受体表达减少75%,从而抵抗HIV病毒的感染。因此,针对病毒基因的siRNA是慢性病毒性感染的最佳治疗策略,具有广阔的应用前景。

目前我国有1.7亿HBV感染者,其中慢性乙肝患者1,700万人,每年有50万人死于HBV引起的肝硬化和肝癌。因此,目前以及今后相当长的一段时间内,针对慢性乙型肝炎——肝纤维化、肝硬化治疗的研究,仍具有十分重要的现实意义。

体内外研究均证实转化生长因子β1(TGF-β1)是促进肝纤维化形成最强的刺激因子之一,是治疗肝纤维化的理想靶点。但是由于TGF-β1体内普遍存在,具有广泛的生物学作用,在细胞生理反应中起核心作用,包括细胞增生、粘附、凋亡、分化和特异性的发展,以及免疫调节等功能,把TGF-β1基因敲除将引起机体内所有与TGF-β1相关的一系列基础功能的缺失或紊乱。更可行的方法是研究TGF-β1信号下传中涉及的效应蛋白和调节蛋白,将他们按照TGF-β1不同的功能进行分类,最终找到阻断TGF-β1某种单一功能的靶点。

Smads通路是TGF-β1信号传导中最重要的通路。其中,Smad2/Smad3是TGF-β1信号下传的重要传导分子。Smad3是介导TGF-β1诱导肝纤维化功能的关键分子,TGF-β1激活的HSC主要表达Smad3,缺失了Smad3的HSC虽然经TGF-β1激活也不能分泌I型胶原,缺失了Smad3的小鼠可以抵抗放射、博来霉素和四氯化碳等各种原因引起的肝纤维化形成。

发明内容

本发明要解决的技术问题是提供一种针对TRAP-1样蛋白(TLP)基因的siRNA序列,该针对TLP基因的siRNA,可抑制胶原的表达,可用于制备治疗肝纤维化的药物。

为了解决上述技术问题,本发明提供一种针对TRAP-1样蛋白基因的siRNA序列,其目标RNA靶序列的核苷酸序列为以下任意一种:

TLP-1   5’GCAACAAUUCAUCACAUCdtdt    3’和

TLP-2   5’CCAUGUGGUUUCCCAGUUUdtdt   3’。

dt是脱氧胸腺核苷酸,RNA干扰片段后加两个核苷酸有利于增加干扰效果,一般加dtdt或UU。

本发明还提供了上述针对TRAP-1样蛋白基因的siRNA序列在制备抑制肝脏肿瘤生长和/或抑制肝纤维化药物中的应用。

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