[发明专利]甲基化DNA的浓缩方法和检测方法以及试剂盒有效
申请号: | 200910085872.1 | 申请日: | 2009-06-03 |
公开(公告)号: | CN101906414A | 公开(公告)日: | 2010-12-08 |
发明(设计)人: | 夏东元 | 申请(专利权)人: | 博尔诚(北京)科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人: | 曹津燕 |
地址: | 100176 北京市北京经济技*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甲基化 dna 浓缩 方法 检测 以及 试剂盒 | ||
1.一种甲基化DNA的浓缩方法,该方法包括将生物样品直接与固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白接触,编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ ID NO:2所示。
2.根据权利要求1所述的浓缩方法,其特征在于,所述固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白的固相化载体选自凝胶颗粒、磁珠、树脂和膜系统中的一种或多种。
3.根据权利要求1或2所述的浓缩方法,其特征在于,所述浓缩方法还包括生物样品预处理的步骤,例如将生物样品进行蛋白变性预处理。
4.一种用于浓缩甲基化DNA的试剂盒,该试剂盒包括固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白,编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ ID NO:2所示。
5.一种甲基化DNA的检测方法,该方法包括以下步骤:
(1)浓缩:将生物样品直接与固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白接触,编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ IDNO:2所示;
(2)转化:使用重硫酸盐处理步骤(1)浓缩到的甲基化DNA;
(3)脱硫:使用碱性脱硫剂处理步骤(2)得到的经转化的甲基化DNA;以及
(4)测定步骤(3)得到的DNA序列。
6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,所述固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白的固相化载体选自凝胶颗粒、磁珠、树脂和膜系统中的一种或多种。
7.根据权利要求5或6所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中的测定方法选自PCR分析、基因序列分析和分子杂交分析中的一种或多种。
8.根据权利要求5至7中任一项所述的检测方法,其特征在于,所述生物样品选自血清、血浆、尿、痰、细胞提取物、组织提取物和粪便提取物中的一种或多种。
9.根据权利要求5至8中任一项所述的检测方法,其特征在于,所述检测方法还包括生物样品预处理的步骤,例如将生物样品进行蛋白变性预处理。
10.一种用于检测甲基化DNA的试剂盒,该试剂盒包括固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白,编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ ID NO:2所示。
11.根据权利要求10所述的试剂盒,其特征在于,所述固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白的固相化载体选自凝胶颗粒、磁珠、树脂和膜系统中一种或多种。
12.根据权利要求10或11所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括用于转化甲基化DNA的重硫酸盐、用于脱硫的碱性脱硫剂和转化后的DNA回收溶液。
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