[发明专利]甲基化DNA的浓缩方法和检测方法以及试剂盒有效

专利信息
申请号: 200910085872.1 申请日: 2009-06-03
公开(公告)号: CN101906414A 公开(公告)日: 2010-12-08
发明(设计)人: 夏东元 申请(专利权)人: 博尔诚(北京)科技有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/68
代理公司: 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 代理人: 曹津燕
地址: 100176 北京市北京经济技*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 甲基化 dna 浓缩 方法 检测 以及 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种甲基化DNA的浓缩方法,该方法包括将生物样品直接与固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白接触,编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ ID NO:2所示。

2.根据权利要求1所述的浓缩方法,其特征在于,所述固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白的固相化载体选自凝胶颗粒、磁珠、树脂和膜系统中的一种或多种。

3.根据权利要求1或2所述的浓缩方法,其特征在于,所述浓缩方法还包括生物样品预处理的步骤,例如将生物样品进行蛋白变性预处理。

4.一种用于浓缩甲基化DNA的试剂盒,该试剂盒包括固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白,编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ ID NO:2所示。

5.一种甲基化DNA的检测方法,该方法包括以下步骤:

(1)浓缩:将生物样品直接与固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白接触,编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ IDNO:2所示;

(2)转化:使用重硫酸盐处理步骤(1)浓缩到的甲基化DNA;

(3)脱硫:使用碱性脱硫剂处理步骤(2)得到的经转化的甲基化DNA;以及

(4)测定步骤(3)得到的DNA序列。

6.根据权利要求5所述的检测方法,其特征在于,所述固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白的固相化载体选自凝胶颗粒、磁珠、树脂和膜系统中的一种或多种。

7.根据权利要求5或6所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中的测定方法选自PCR分析、基因序列分析和分子杂交分析中的一种或多种。

8.根据权利要求5至7中任一项所述的检测方法,其特征在于,所述生物样品选自血清、血浆、尿、痰、细胞提取物、组织提取物和粪便提取物中的一种或多种。

9.根据权利要求5至8中任一项所述的检测方法,其特征在于,所述检测方法还包括生物样品预处理的步骤,例如将生物样品进行蛋白变性预处理。

10.一种用于检测甲基化DNA的试剂盒,该试剂盒包括固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白,编码所述甲基化DNA结合蛋白的基因序列如SEQ ID NO:1所示,编码所述甲基化DNA结合蛋白的结构域蛋白的基因序列如SEQ ID NO:2所示。

11.根据权利要求10所述的试剂盒,其特征在于,所述固相化的甲基化DNA结合蛋白和/或其结构域蛋白的固相化载体选自凝胶颗粒、磁珠、树脂和膜系统中一种或多种。

12.根据权利要求10或11所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括用于转化甲基化DNA的重硫酸盐、用于脱硫的碱性脱硫剂和转化后的DNA回收溶液。

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