[发明专利]一种检测传染病病原体的方法及试剂盒有效
申请号: | 200910083896.3 | 申请日: | 2009-05-11 |
公开(公告)号: | CN101545009A | 公开(公告)日: | 2009-09-30 |
发明(设计)人: | 于常海;刘乐庭;冯晓燕 | 申请(专利权)人: | 北京海康基因芯片开发有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/90;C12R1/01 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 | 代理人: | 逯长明 |
地址: | 100176北京市大兴区经济技术开*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 传染病 病原体 方法 试剂盒 | ||
1.一种非疾病诊断或治疗目的的对可能存在于生物样品中的传染 病病原体进行检测的方法,包括:
(ⅰ)扩增生物样品的核酸片段,所述核酸片段为鹦鹉热衣原体内 涵体膜蛋白A基因的如SEQ ID NO.1所示的核酸片段或其与以下各种核 酸片段的组合:
卡氏肺囊虫的主要表面糖蛋白基因的如SEQ ID NO.2所示的核酸片 段;
钩端螺旋体促旋酶B亚单位基因的如SEQ ID NO.3所示的核酸片段;
Q热立克次体外膜蛋白基因的如SEQ ID NO.4所示的核酸片段;
布鲁氏杆菌外膜蛋白omp2b基因的如SEQ ID NO.5所示的核酸片 段;
(ⅱ)用探针进行检测,所述探针与步骤(ⅰ)扩增产物中的一种特 异性杂交;
所述步骤(ⅰ)使用第1组引物用于扩增如SEQ ID NO.1所示的核 酸片段,其上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,其下游引物核苷 酸序列如SEQ ID NO.7所示或其与以下各组的组合作为引物进行扩增:
第2组引物用于扩增如SEQ ID NO.2所示的核酸片段,其上游引物 核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,其下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;
第3组引物用于扩增如SEQ ID NO.3所示的核酸片段,其上游引物 核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示,其下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示;
第4组引物用于扩增如SEQ ID NO.4所示的核酸片段,其上游引物 核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.16 所示;
第5组引物用于扩增如SEQ ID NO.5所示的核酸片段,其上游引物核 苷酸序列如SEQ ID NO.18所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.19 所示;
所述步骤(ⅰ)利用NASBA技术扩增样品的核酸片段,NASBA运 行条件为41℃~45℃温育90~150分钟;
步骤(ⅱ)中所述探针与步骤(ⅰ)所得扩增产物的杂交在固体支 持物上进行;
所述步骤(ⅱ)使用捕获探针,其核苷酸序列如SEQ ID NO.21所示, 所述捕获探针直接或间接的连接在固体支持物上;
步骤(ⅱ)中使用以下的核苷酸序列作为检测探针:
如SEQ ID NO.8所示,检测如SEQ ID NO.1所示的核酸片段;
如SEQ ID NO.11所示,检测如SEQ ID NO.2所示的核酸片段;
如SEQ ID NO.14所示,检测如SEQ ID NO.3所示的核酸片段;
如SEQ ID NO.17所示,检测如SEQ ID NO.4所示的核酸片段;
如SEQ ID NO.20所示,检测如SEQ ID NO.5所示的核酸片段。
2.一种对可能存在于生物样品中的传染病病原体进行检测的试剂 盒,其包含用于扩增如SEQ ID NO.1所示的核酸片段的引物或其与用于 扩增如SEQ ID NO.2所示核酸片段的引物、用于扩增如SEQ ID NO.3所 示核酸片段的引物、用于扩增如SEQ ID NO.4所示核酸片段的引物和用 于扩增如SEQ ID NO.5所示核酸片段的引物中的一组或一组以上的组 合;
所述引物选自:
第1组引物用于扩增如SEQ ID NO.1所示的核酸片段,其上游引物 核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,其下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.7 所示;
第2组引物用于扩增如SEQ ID NO.2所示的核酸片段,其上游引物 核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,其下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;
第3组引物用于扩增如SEQ ID NO.3所示的核酸片段,其上游引物 核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示,其下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示;
第4组引物用于扩增如SEQ ID NO.4所示的核酸片段,其上游引物 核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.16 所示;
第5组引物用于扩增如SEQ ID NO.5所示的核酸片段,其上游引物 核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.19 所示;
还包含如核苷酸序列SEQ ID NO.21所示的捕获探针;
还包含以下至少一种与引物对应的检测探针:
如SEQ ID NO.8所示,检测如SEQ ID NO.1所示的核酸片段;
如SEQ ID NO.11所示,检测如SEQ ID NO.2所示的核酸片段;
如SEQ ID NO.14所示,检测如SEQ ID NO.3所示的核酸片段;
如SEQ ID NO.17所示,检测如SEQ ID NO.4所示的核酸片段;
如SEQ ID NO.20所示,检测如SEQ ID NO.5所示的核酸片段。
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