[发明专利]哲罗鲑线粒体全基因组序列及其扩增引物

说明书

技术领域

本发明涉及一种线粒体全基因组序列及其扩增引物。

背景技术

线粒体是细胞内一个重要的细胞器，它具有自身的一套基因组，在鱼类中线粒体基因组由于其母系遗传的特点，复制过程中缺乏修复机制导致序列的累积变异速率远远大于核基因组的变异速率等特点，使其作为保护生物学和进化生物学研究的一种非常有效的工具。同时由于线粒体在细胞内起到产能及能量传递的重要作用，其基因组中的碱基突变或缺失能造成重大线粒体疾病(如人类的线粒体肌肉病及线粒体脑肌肉病等)，且其基因组的多态性与物种的经济性状相关，因此对线粒体基因组的研究十分重要。目前鲑科鱼类中已有13个物种对线粒体基因组进行了测序，而哲罗鲑(Hucho taimen)的线粒体基因组序列到目前为止仍未测定。哲罗鲑是我国土著的珍稀名贵的鱼类，是鲑科鱼类中体型最大。由于环境恶化及过度捕捞等因素，其目前的资源量已十分稀少、濒临灭绝；因此，1998年哲罗鲑被列入《中国濒危动物红皮书(鱼类)》，2004年被列入《中国物种红色名录》。哲罗鲑同时也是一种优良的冷水性养殖鱼类，其具有生长快速、抗逆性强的特点，目前已成功进行了野生哲罗鲑的人工驯养，并在此基础上成功开展了规模化繁殖和养殖。但由于其自残严重、不耐高温、不耐低氧及在北方地区低温季节(如冬春季水文在10℃以下季节)生长缓慢等特性影响了生产的成本和产量。因此，确定哲罗鲑线粒体全基因组序列可以在哲罗鲑的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择上起到重要作用。

发明内容

本发明的目的是确定哲罗鲑线粒体全基因组序列，为哲罗鲑的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择提供物质基础。

哲罗鲑线粒体全基因组序列如SEQ ID NO：1所示。

哲罗鲑线粒体全基因组序列的扩增引物为33对；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第1对的正向引物为5’-AGAGCGCCGGTCTTGTAATC-3’，反向引物为5’-GCTAGCGGGACTTTCTAGGGTC-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第2对的正向引物为5’-TGAATTCCAGAGAACCCATGT-3’，反向引物为5’-TAAAACAAGGGGTGGTGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第3对的正向引物为5’-CAAAGGCTTGGTCCTGACTT-3’，反向引物为5’-TAAAACAAGGGGTGGTGAGG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第4对的正向引物为5’-TGATATCCGCCAGGGAACTA-3’，反向引物为5’-CCCTTGCGGTACTTTTTCTG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第5对的正向引物为5’-GGGTCACCCTGAGCTGACTA-3’，反向引物为5’-GTGCAGGTGGCTGCTCTTAG-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第6对的正向引物为5’-AAACCAGGAGAGTTAGTCAAAGGA-3’，反向引物为5’-CCCTCGTGATGCCATTCAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第7对的正向引物为5’-AACACAAGCCTCGCCTGTT-3’，反向引物为5’-CGTTGAACAAACGAACCCTTA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第8对的正向引物为5’-CTCTCCCAGAGTCCCTATCG-3’，反向引物为5’-GCGAGAAATAGAAAGGGTGAA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第9对的正向引物为5’TGCTTTCCTCACCCTACTTGA-3’，反向引物为5’-GTGGGATGCGCCTAAAAATA-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第10对的正向引物为5’-CCCTTTGACCTCACAGAAGG-3’，反向引物为5’-CTGGCAAAGGTGAGGACTGT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第11对的正向引物为5’-TTGGTGCTTCCACTACACCA-3’，反向引物为5’-GTGTGAGAGAGGGTGCGAAT-3’；

哲罗鲑线粒体全基因组序列扩增引物第12对的正向引物为5’-TTGGTGCTTCCACTACACCA-3’，反向引物为5’-TGTGGGATAAAGTCCTGCAA-3’；