[发明专利]一种肝细胞肝癌术后复发预测基因芯片有效

专利信息
申请号: 200910047190.1 申请日: 2009-03-06
公开(公告)号: CN101560554A 公开(公告)日: 2009-10-21
发明(设计)人: 樊嘉;徐泱;杨欣荣;周俭;邱双健 申请(专利权)人: 复旦大学附属中山医院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C40B40/06
代理公司: 上海申汇专利代理有限公司 代理人: 翁若莹
地址: 200032*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 肝细胞 肝癌 术后 复发 预测 基因芯片
【说明书】:

技术领域

发明涉及一种肝细胞肝癌术后复发预测基因芯片,属于基因技术领域。 

背景技术

我国是全球肝癌高发区,每年约20万人死于肝癌,占全球肝癌死亡人数的一半左右。现代医学对肝癌进行科学研究一百多年,虽然取得了不少成绩,但肝癌人群的总体5年生存率至今仍只有3%左右,而提高肝癌预后的最大障碍是其极高的复发率,即使是根治性手术切除,仍有50%的病人会在5年内出现转移或复发。因此,预测肝癌病人术后复发以便早期进行必要的干预是进一步改善肝癌预后的关键。目前临床上虽然有一些预测肝癌预后的标志物,但对于早期肝癌(TNM分期I期)及甲胎蛋白(AFP)阴性肝癌病人仍缺乏有效的预测手段。 

我们前期研究表明,利用基因芯片技术筛选癌中的差异表达基因可以来预测肝癌术后复发。大量研究表明肿瘤干细胞是肿瘤转移和复发的根本来源。我们前期研究表明肝癌中侧群细胞具有肿瘤干细胞样细胞的特性,并且发现侧群细胞和主群细胞之间基因差异表达谱和肝癌的转移复发关系密切。但是,由于芯片技术操作过于繁复,技术要求高,费用昂贵,涉及基因数目庞大从而限制其在临床上的应用,而利用定量聚合酶链式反应(PCR)技术来联合检测数个关键基因,为肝癌的分子分型提供了一种在临床上易于实施的方案。因此,我们从肝癌干细胞样细胞的差异基因表达谱中进一步筛选,从中挑选出5个关键基因能够较好的预测肝癌病人转移和复发。到目前为止,从肝癌肿瘤干细胞样细胞的差异基因表达谱中筛选预后相关基因的类似研究在国内外未见报道。 

发明内容

本发明的目的一种能够方便运用于临床、能够预测肝细胞肝癌术后复发的基因芯片。为了达到上述目的,本发明的技术方案是提供一种肝细胞肝癌术后复发预测基因芯片,其特征在于,所述芯片以EPAS1、JMJD1C、NEDD9、EPC2和USP36基因为检测位点,以β-肌动蛋白为内参,以EPAS1基因上游引物5’TGCTACGCCACCCAGTACCA3’和下游引物5’CAGTTCGGGCAGCAGGTAGG3’、JMJD1C基因上游引物5’CAGCGGGAGCACTTCATCAG3’和下游引物5’TTCCTTCAAAAGTCTCAGTTCCTGTG3’、NEDD9基因上游引物5’CCCAAACCGAAGTCATAGCC3’和下游引物5’CAGGAACAGCCACCAATAAGC3’、EPC2基因上游 引物5’CATTTGGGAGACTATGGTGGT3’和下游引物CTCTGCTTTAGGCTTCTTTGG3’、USP36基因上游引物5’CGAAGAGTTTGACCGAGGGAAG3’和下游引物5’GCAGCCTTTGCTGGGTGAGT3’、以及β-肌动蛋白上游引物5’AAGAAGGTGGTGAAGCAGGC 3’和下游引物5’TCCACCACCCTGTTGCTGTA 3’作为检测探针。 

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