[发明专利]糖尿病的诊断生物标志物有效
| 申请号: | 200880115967.7 | 申请日: | 2008-11-13 |
| 公开(公告)号: | CN101918589A | 公开(公告)日: | 2010-12-15 |
| 发明(设计)人: | J·F·帕尔马;J·W·巴库斯;Y·张;Y·王;J·X·于;T·维纳;C·德里乔;D·U·李 | 申请(专利权)人: | 维里德克斯有限责任公司 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 李志东;郭文洁 |
| 地址: | 美国新*** | 国省代码: | 美国;US |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 糖尿病 诊断 生物 标志 | ||
1.一种诊断患者中的糖尿病的方法,所述方法包括以下步骤:
a.提供取自患者的测试样本;
b.测量包含两种或更多种选自TOP1、CD24和STAP1基因的基因的基因特征的基因表达谱;
c.将所述基因表达谱与所述基因特征的诊断用基因表达谱进行比较;
d.至少部分地基于所述基因表达谱与所述诊断用基因表达谱之间的基本匹配确定所述患者中的糖尿病状态;
e.将所述确定结果显示给医疗人员。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述确定步骤是通过计算机系统来执行,所述计算机系统运行一种或更多种选自以下的算法:基因表达信号的线性组合、线性回归模型、Logistic回归模型、线性判别分析(LDA)模型、最近邻模型和微阵列预测分析(PAM)。
3.根据权利要求2所述的方法,其中所述确定步骤还包括对所述患者的代谢疾病谱的分析。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述基因特征还包含一种或更多种选自表1或6中所列基因的基因。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述糖尿病状态是前期糖尿病状态或2型糖尿病状态。
6.根据权利要求1所述的方法,其中所述测试样本是血样。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述测试样本包含PBMC或者CD11c+或CD11b+或Emr+或[CD11b+CD11c+]或[Emr+CD11b+]或[Emr+CD11c+]或[Emr+CD11b+CD11c+]细胞或者CD14+单核细胞。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述测量步骤涉及实时PCR或免疫化学测定法或特异性寡核苷酸杂交。
9.一种诊断患者中的糖尿病的方法,所述方法包括以下步骤:
a.提供取自患者的测试样本;
b.测量所述测试样本中包含两种或更多种选自TULP4、AA741300、ESCO1、EIF5B、ACTR2、WNK1、COCH、SON、TPR和NOG基因的基因的基因特征的基因表达谱;和
c.将所述基因表达谱与所述基因特征的诊断用基因表达谱进行比较;
d.至少部分地基于所述基因表达谱与所述诊断用基因表达谱之间的基本匹配确定所述患者中的糖尿病状态;和
e.将所述确定结果显示给医疗人员。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述基因特征的基因表达谱包含TULP4、AA741300、ESCO1、EIF5B、ACTR2、WNK1、COCH、SON、TPR和NOG基因。
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述确定步骤是通过计算机系统来执行,所述计算机系统运行一种或更多种选自以下的算法:基因表达信号的线性组合、线性回归模型、Logistic回归模型、线性判别分析(LDA)模型、最近邻模型和微阵列预测分析(PAM)。
12.根据权利要求9所述的方法,其中所述确定步骤还包括对所述患者的代谢疾病谱的分析。
13.根据权利要求9所述的方法,其中所述糖尿病状态是前期糖尿病状态或2型糖尿病状态。
14.根据权利要求9所述的方法,其中所述测试样本是血样。
15.根据权利要求9所述的方法,其中所述测试样本包含PBMC或者CD11c+或CD11b+或Emr+或[CD11b+CD11c+]或[Emr+CD11b+]或[Emr+CD11c+]或[Emr+CD11b+CD11c+]细胞或者CD14+单核细胞。
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