[发明专利]遗传标记和相关上位相互作用的使用方法

权利要求书

1.一种根据每只动物针对生产力和/或适合度的预测标记育种值来分配一只或多只动物的用途的方法，所述方法包括：

a.评估一只或多只动物以确定每只动物在一个或多个基因座处的基因型；其中至少一个基因座包含具有至少两个等位基因变异体且选自表1所述单核苷酸多态性(SNP)的SNP；

b.在选自表1所述SNP的一个或多个SNP处分析所确定的至少一个受评估动物的基因型以确定存在的等位基因变异体；

c.将所述等位基因变异体与表1所述的至少一个生产力性状或适合度性状相关联；

d.根据所确定的基因型分配所述动物的用途。

2.如权利要求1所述的方法，其中所述分析还包括对表1所述的至少一种相互作用效应的分析。

3.如权利要求1或2所述的方法，其中在含有选自表1所述SNP的SNP的两个以上基因座处对所述动物基因型进行评估。

4.如权利要求1或2所述的方法，其中在10个以上基因座处对所述动物基因型进行评估。

5.如权利要求1或2所述的方法，其中在100个以上基因座处对所述动物基因型进行评估。

6.如权利要求1或2所述的方法，其中在200个以上基因座处对所述动物基因型进行评估。

7.如权利要求1或2所述的方法，其中将评估的SNP与选自妊娠率(PR)、雌性子代妊娠率(DPR)、生产寿命(PL)、体细胞计数(SCC)和体细胞评分(SCS)的适合度性状相关联。

8.如权利要求1或2所述的方法，其中将评估的SNP与选自总乳产量、乳脂百分比、乳脂产量、乳蛋白百分比、乳蛋白产量、终生总产量、产乳速度和泌乳持续性的生产力性状相关联。

9.如权利要求1或2所述的方法，所述方法包括全基因组分析。

10.一种选择一只或多只育种用潜在亲本动物以改善潜在子代的适合度和/或生产力的方法：

a.确定在至少一个基因组基因座处的至少一个潜在亲本动物的基因型；其中至少一个基因座含有具有至少两个等位基因变异体并且选自表1所述单核苷酸多态性(SNP)的SNP；

b.针对选自表1所述SNP的一个或多个SNP分析所确定的至少一个受评估动物的基因型以确定存在的等位基因；

c.将所鉴定的等位基因与适合度和/或生产力表型相联系；

d.基于动物的基因型将至少一个动物分配用于育种用途。

11.如权利要求10所述的方法，其中所述分析包括对表1所述的相互作用效应的至少一次评估。

12.如权利要求10或11所述的方法，其中在含有选自表1所述SNP的SNP的五个以上基因座处对潜在亲本动物的基因型进行评估。

13.如权利要求10或11所述的方法，其中在10个以上基因座处对潜在亲本动物的基因型进行评估，所述10个以上基因座包括含有选自表1所述SNP的SNP的至少2个基因座。

14.如权利要求10所述的方法，其中在20个以上基因座处对潜在亲本动物的基因型进行评估，所述20个以上基因座包括含有选自表1所述SNP的SNP的至少2个基因座。

15.如权利要求10或11所述的方法，其中选择所述潜在亲本动物以改善潜在子代的适合度。

16.如权利要求10或11所述的方法，其中选择所述潜在亲本动物以改善潜在子代的生产力。

17.如权利要求10或11所述的方法，所述方法包括全基因组分析。

18.一种生产后代动物的方法，所述方法包括：

a)对已根据权利要求1或2所述的方法被分配用于育种的至少一个潜在亲本动物进行鉴定；

b)通过包括以下方法在内的方法从所分配的动物生产后代：

i)天然育种；

ii)人工授精；

iii)体外受精；和/或

iv)从动物收集精液/精子或至少两个卵子并通过任何方式将其分别与来自第二动物的卵子或精液/精子接触以产生孕体。

19.如权利要求18所述的方法，所述方法包括通过天然育种生产后代。