[发明专利]利用酶促反应合成样品中的cDNA的方法有效

专利信息
申请号: 200880103457.8 申请日: 2008-02-13
公开(公告)号: CN101802222A 公开(公告)日: 2010-08-11
发明(设计)人: H·恩格尔;S·耶拉米利;M·科鲁兹;D·洛弗特;C·科菲哈格 申请(专利权)人: 恰根有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 韦东;张静
地址: 德国*** 国省代码: 德国;DE
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摘要:
搜索关键词: 利用 反应 合成 样品 中的 cdna 方法
【权利要求书】:

1.一种在酶反应中合成样品的cDNA的方法,该方法的特征在于包括 以下步骤:

a.提供反应混合物,所述反应混合物中同时提供具有末端转移酶活性的第 一种酶,具有反转录酶活性的第二种酶,缓冲液,至少一种核糖核苷酸,含有 dATP、dCTP、dGTP和dTTP的脱氧核糖核苷酸的混合物,锚定寡核苷酸以及 扩增产生的cDNA的酶及试剂,其中,所述锚定寡核苷酸选自聚腺苷酸寡核苷 酸、聚(C)寡核苷酸、聚(T)寡核苷酸、聚(G)寡核苷酸、聚(U)寡核苷酸、额 外包含5′-尾的聚腺苷酸寡核苷酸,额外包含5′-尾的聚(C)寡核苷酸,额外 包含5′-尾的聚(T)寡核苷酸,额外包含5′-尾的聚(G)和额外包含5′-尾的聚(U) 寡核苷酸;

b.将包含核糖核酸的样品加到所述反应混合物中,

c.在一个或多个温度步骤中温育步骤a)和b)的物质,所述温度步骤的选择 应使得所述第一种酶和所述第二种酶显示活性,然后扩增在该方法中如此产生 的cDNA。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述反应还包括65℃-95℃的 较高温度的至少一个温度步骤。

3.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,随后采用聚合酶链式反 应扩增该方法中产生的cDNA,该反应包含随机引物和/或特异性引物,和任选 含有一种或多种探针。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述末端转移酶活性是聚腺 苷酸化活性。

5.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述样品包含核糖核酸, 其选自下组:原核生物RNA、真核生物RNA、病毒RNA、太古细菌-RNA、 miRNA、snoRNA、mRNA、tRNA、非聚腺苷酸化的RNA、和rRNA,以 及它们的混合物。

6.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述锚定寡核苷酸的长 度通常介于6-150个核苷酸之间并且任选在3’-端具有锚定序列。

7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,所述锚定寡核苷酸是脱氧 核糖核酸(DNA)、肽核酸(PNA)、锁定核酸(LNA)、硫代磷酸-脱氧核糖核酸、 环己烯-核酸(CeNA)、N3′-P5′-亚磷酰胺(NP)、或三环-脱氧核糖核酸 (tcDNA)。

8.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述核糖核苷酸选自下 组:腺苷-5′-三磷酸、胸苷-5′-三磷酸、胞嘧啶-5′-三磷酸、鸟嘌呤-5′-三磷酸、 尿嘧啶-5′-三磷酸,其中所述核糖核苷酸任选经修饰或作标记。

9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述脱氧核糖核苷酸选自下 组:脱氧腺苷-5′-三磷酸(dATP)、脱氧胸苷-5′-三磷酸(dTTP)、脱氧胞嘧啶 -5′-三磷酸(dCTP)、脱氧鸟嘌呤-5′-三磷酸(dGTP)、脱氧尿嘧啶-5′-三磷酸 (dUTP),其中所述脱氧核糖核苷酸可任选经修饰或作标记。

10.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述脱氧核糖核苷酸的标记 物选自下组:放射性标记物;荧光染料;香豆素;苯甲亚胺;菲啶;吖啶类 染料;咔唑染料;吩嗪染料;卟啉染料;聚甲炔染料;花青苷染料;BODIPY 染料;喹啉染料;和Alexa染料。

11.如权利要求9所述的方法,其特征在于,所述脱氧核糖核苷酸的标记 物选自下组:生物素、洋地黄毒苷和半抗原。

12.如权利要求11所述的方法,其特征在于,所述反应中脱氧核糖核苷 酸的浓度范围是0.01mM到10mM。

13.如权利要求12所述的方法,其特征在于,所述脱氧核糖核苷酸dATP、 dCTP、dGTP和dTTP各自存在的浓度为0.2mM-2mM。

14.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述缓冲液的pH为6-10 并包含Mg2+离子。

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