[发明专利]用于诱导针对表皮葡萄球菌的保护性免疫应答的多肽

说明书

与相关申请的交叉参照

本申请要求于2007年1月24日提交的美国临时申请号60/897,150 的利益，所述专利引入本文作为参考。

发明背景

本申请自始至终引用的参考文献并非承认是本发明的现有技术。

表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)已特别在医院和无免 疫应答的患者中作为病原体出现。(Ziebuhr等人，International Journal of Antimicrobial Agents 28S：S14-S20，2006)凝固酶阴性葡萄球菌 (CoNS)，主要是表皮葡萄球菌，是与诊断或治疗操作中使用的异物 相关的最常分离的微生物感染。(Heilmann和Peters，Biology and Pathogenicity of Staphylococcus epidermidis，In：Gram Positive Pathogens， Eds.Fischetti等人，American Society for Microbiology，Washington D.C. 2000和The Staphylococci in Human Disease，Crossley和Archer(编辑)， Churchill Livingstone Inc.1997.)

来自表皮葡萄球菌的核酸已进行测序，以获得核酸序列信息并且进 行关于可读框和潜在多肽的预测。(Doucette-Stamm等人，美国专利号 6,380,370和Doucette-Stamm等人，美国专利号7,060,458.)

技术例如涉及展示技术的那些和来自受感染患者的血清可以在鉴 定编码潜在抗原的基因的努力中使用。(Meinke等人，国际公开号WO 02/059148，Meinke等人，国际公开号WO 04/087746.)

发明概述

本发明涉及包含与SEQ ID NO：1结构上相关的氨基酸序列的多肽 和此种多肽的用途。SEQ ID NO：1是全长表皮葡萄球菌多肽的截短的 衍生物。全长天然存在的多肽在本文中称为全长ORF1319e。发现SEQ ID NO：1的加His标签的衍生物产生针对表皮葡萄球菌的保护性免疫应答。

提及“保护性”免疫或免疫应答指针对表皮葡萄球菌感染的可检测 保护水平。提及“免疫原”指提供保护性免疫的能力。

因此，本发明的第一个方面描述包含与SEQ ID NO：1至少85％等 同的氨基酸序列的多肽免疫原，其中多肽不具有SEQ ID NOs：3或4的 氨基酸序列。在一个实施方案中，多肽不包含由SEQ ID NO：3的氨基 酸1-93提供的氨基末端。

提及包含与SEQ ID NO：1至少85％等同的氨基酸序列指存在SEQ ID NO：1相关区域，并且可能存在另外的多肽区域。在一个实施方案 中，如果存在另外的区域，那么多肽没有由SEQ ID NO：3的氨基酸1-93 提供的氨基末端。

与参考序列的百分比同一性(也称为百分比相同)通过使多肽序列 与参考序列比对，然后测定相应区域中的相同氨基酸数目进行测定。使 这个数目除以参考序列(例如，SEQ ID NO：1)中的氨基酸总数目，然 后乘以100并且四舍五入至最近整数。

本发明的另一个方面描述了包含氨基酸序列以及在羧基末端或氨 基末端处与序列共价连接的一个或多个另外区域或部分的免疫原，所述 氨基酸序列提供针对表皮葡萄球菌的保护性免疫，其中每个区域或部分 独立地选自具有至少一个下述性质的区域或部分：增强免疫应答，促进 纯化，或促进多肽稳定性。

提及“另外的区域或部分”指不同于ORF1319e区域的区域或部分。 另外的区域或部分可以是例如另外的多肽区域或非肽区域。

本发明的另一个方面描述了能够在患者中诱导针对表皮葡萄球菌 的保护性免疫的组合物。组合物包含药学上可接受的载体和免疫学有效 量的免疫原，所述免疫原提供针对表皮葡萄球菌的保护性免疫。

免疫学有效量是足以提供针对表皮葡萄球菌感染的保护性免疫的 量。量应足以显著阻止表皮葡萄球菌感染的可能性或严重程度。

本发明的另一个方面描述了包含编码多肽的重组基因的核酸，所述 多肽提供针对表皮葡萄球菌的保护性免疫。重组基因包含编码多肽的重 组核酸连同用于正确转录和加工的调节元件(其可以包括翻译和翻译后 元件)。重组基因可以独立于宿主基因组而存在，或可以是宿主基因组 的部分。