[发明专利]偏凸-柱穗山羊草双二倍体D基因组的SSR标记

说明书

技术领域

偏凸-柱穗山羊草双二倍体D基因组的SSR标记，属于作物遗传育种学领域。

背景技术

山羊草属是与小麦亲缘关系最为密切的属，全属有24个种，包括C、D、M、S和U等17个染色体组，蕴藏着许多抗病、抗虫、抗逆等有益基因，同时它在小麦进化中起着重要作用，并为小麦改良提供了一批优良基因。对山羊草属进行深入研究具有理论意义和应用价值。山羊草属均为一年生野生杂草，系禾本科、小麦族植物，全属包括11个二倍体种，7个四倍体种，2个六倍体种和2个兼有四倍体和六倍体的种，所有多倍体种均起源于不同二倍体的杂交和染色体加倍。经分类学、形态学、细胞学以及地理学等多方面的考证，将山羊草17个染色体组23种组合分为6个组24个种。山羊草属植物自然分布在西经10°至东经83°，北纬30°～49°的区域，主要以土耳其为中心，衍生在原苏联外高加索、伊朗、阿富汗、伊拉克、叙利亚等地中海沿岸国家。24个种分别具有各自相对独立的栖息地。中国的新疆和黄河流域是粗山羊草的主要分布地区，具有广泛的遗传多样性。

发明内容

偏凸山羊草(DDM^VM^V)和柱穗山羊草(CCDD)杂交F₁经过染色体加倍获得了了它们的完全双二倍体SDAU18。本研究利用SSR技术对SDAU18中的两个分别来自不同亲本的D基因组进行了鉴定，为其在小麦遗传育种中的有效利用提供理论依据。

本研究利用的实验材料为双二倍体SDAU18、其双亲偏凸山羊草和柱穗山羊草以及两份粗山羊草Ae37和Ae44。其中，偏凸山羊草、柱穗山羊草、粗山羊草引自中国农业科学院，SDAU18由国家小麦改良中心泰安分中心选育保存。

结果与分析

本研究利用普通小麦D染色体专化的258对SSR引物和11对EST-SSR引物，对SDAU18、其双亲偏凸山羊草和柱穗山羊草以及粗山羊草Ae37和Ae44之间的多态性进行了分析。获得的主要结果如下：

偏凸山羊草和SDAU18的多态性表现

绝大多数D组专化的SSR引物和EST引物都能在偏凸山羊草中扩增出带，出带率平均为76.6％。同时，从表1还可以看出绝大多数(平均为86.9％)能在偏凸山羊草中扩增出带的引物所产生的带型能完全(如图1引物Xgdm111-1D、Xwmc503-2D、图3引物Xgdm128-3D、Xgdm3-5D、BARC071-3D、Xgdm34-4D以及图5引物Xwmc503-2D、Xwmc552-3D扩增出的带型)或部分(如图1引物Xgwm337-1D、Xgdm107-2D和图2引物BARC183-6DS库增出的带型)体现在SDAU18的带型之中；前类引物有123对，后类引物有58对。

柱穗山羊草和SDAU18的多态性表现

绝大多数D组专化的SSR引物和EST引物都能在柱穗山羊草中扩增出带，出带率平均为78.4％。同时，从表2还可以看出多数(平均为56.0％)能在柱穗山羊草中扩增出带的引物所产生的带型能基本或部分体现在SDAU18的带型之中；前类引物有83对，后类引物有35对。