[发明专利]人乳头瘤病毒基因芯片、制备方法、应用及检测用试剂盒与应用有效
申请号: | 200810133503.0 | 申请日: | 2008-07-08 |
公开(公告)号: | CN101624632A | 公开(公告)日: | 2010-01-13 |
发明(设计)人: | 王磊;曹勃阳;胡品良 | 申请(专利权)人: | 天津生物芯片技术有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 北京连和连知识产权代理有限公司 | 代理人: | 姜兆元 |
地址: | 300457天津市经*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乳头 病毒 基因芯片 制备 方法 应用 检测 试剂盒 | ||
1.一种人乳头瘤病毒基因芯片,包括固相载体和固定在该固相载体上 的寡聚核苷酸探针,其特征在于该寡聚核苷酸探针为SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:36所示的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的人乳头瘤病毒基因芯片,其特征在于还包括 阳性对照探针、阴性对照探针和荧光探针。
3.根据权利要求2所述的人乳头瘤病毒基因芯片,其特征在于所述的 阳性对照探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:37所示;所述的阴性对照探针 的核苷酸序列如SEQ ID NO:38所示;所述的荧光探针的核苷酸序列如 SEQ ID NO:39所示。
4.权利要求1-3任一项所述的人乳头瘤病毒基因芯片的制备方法,其 特征在于包括以下步骤:
1)获取人乳头瘤病毒的L1基因或人类的β珠蛋白基因的序列;
2)根据步骤1)获得的序列设计寡聚核苷酸探针;
3)合成步骤2)中设计的寡聚核苷酸探针;
4)筛选步骤3)中合成的寡聚核苷酸探针,筛选到的探针序列如SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:36所示;
5)制备阳性对照探针、阴性对照探针和荧光探针;
6)将步骤4)中筛选的寡聚核苷酸探针和步骤5)中制备的阳性对照 探针、阴性对照探针和荧光探针固定到固相载体上,制得人乳头瘤病毒基 因芯片。
5.根据权利要求4所述的人乳头瘤病毒基因芯片的制备方法,其特征 在于步骤2)中包括将步骤1)中获取的L1基因序列导入Glustal X软件 中,选取一条代表序列在公共数据NCBI中作blastn比对,以确定特异靶 点的位置。
6.根据权利要求5所述的人乳头瘤病毒基因芯片的制备方法,其特征 在于使用Glustal X软件时参数设定如下:-n 20;-l 30;-L 40;-D 3000; -t 79;-T 90;-s 65℃;-x 65℃;-N 2;-p 33,-P 65;-m GGGGG CCCCC TTTTT AAAAA;-g 15。
7.权利要求1所述的人乳头瘤病毒基因芯片在制备检测用试剂盒中 的应用。
8.一种检测用试剂盒,其特征在于包括权利要求1所述的人乳头瘤病 毒基因芯片。
9.根据权利要求8所述的检测用试剂盒,其特征在于还包括从待测样 品中用于扩增人乳头瘤病毒基因的SEQ ID NO:40-SEQ ID NO:41所示的 PCR引物,或用于扩增β珠蛋白基因的SEQ ID NO:42-SEQ ID NO:43所 示的引物。
10.根据权利要求8所述的检测用试剂盒,其特征在于还包括下列试 剂中的至少一种:
从待检样品中提取DNA的样品处理试剂;
PCR扩增试剂;
杂交试剂;
显色试剂。
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