[发明专利]HIV毒株耐药表型分析细胞模型及其专用假型慢病毒无效
申请号: | 200810118436.5 | 申请日: | 2008-08-15 |
公开(公告)号: | CN101353667A | 公开(公告)日: | 2009-01-28 |
发明(设计)人: | 童贻刚;李敬云;张昕;安小平;周育森 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所 |
主分类号: | C12N15/63 | 分类号: | C12N15/63;C12N15/867;C12N7/01;C12N5/10;C12Q1/70;C12Q1/02 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 | 代理人: | 关畅;任凤华 |
地址: | 100071北京市丰台区东大*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | hiv 耐药 表型 分析 细胞 模型 及其 专用 假型慢 病毒 | ||
1.表达HIV的Gag基因的重组表达质粒pGag,其构建方法如下:
以质粒pHIV-NL4-3为模板,以RRE-fNde:5’-CATATGAGGGACAATTGGAGA-3’和RRE-r:5’-GGAGTGTATTAAGCTTGTGTAATTG-3’为引物,扩增HIV的RRE序列;扩增产物经NdeI和HindIII双酶切后回收;用BglII和NdeI双酶切pHIV-NL4-3,回收含Gag-Pol基因的DNA片段;将上述两个片段与经BamHI和HindIII双酶切的整合表达载体pcDNA3.1(-)共同连接,得到表达HIV Gag和Pol基因的辅助质粒pGag-Pol;
以pGag-Pol为模板,以HIV-PRRT-DEL-F:5’-GAGTATGTAGATGGGGCAGCCA-3’和HIV-PRRT-DEL-R:5’-GAGAAGCTAAAGGATACAGTTCCTTGT-3’为引物,进行PCR扩增;扩增产物经5’磷酸化后进行自连,再使用酶切位点XhoI筛选得到重组表达质粒pGag。
2.一种混合质粒,包括表达HIV的Gag基因的重组表达质粒、表达报告基因的重组慢病毒质粒、表达HIV的Rev基因的重组表达质粒和表达疱疹性口炎病毒壳G糖蛋白基因的重组表达质粒;
所述表达HIV的Gag基因的重组表达质粒pGag,其构建方法如下:
以质粒pHIV-NL4-3为模板,以RRE-fNde:5’-CATATGAGGGACAATTGGAGA-3’和RRE-r:5’-GGAGTGTATTAAGCTTGTGTAATTG-3’为引物,扩增HIV的RRE序列;扩增产物经NdeI和HindIII双酶切后回收;用BglII和NdeI双酶切pHIV-NL4-3,回收含Gag-Pol基因的DNA片段;将上述两个片段与经BamHI和HindIII双酶切的整合表达载体pcDNA3.1(-)共同连接,得到表达HIV Gag和Pol基因的辅助质粒pGag-Pol;
以pGag-Pol为模板,以HIV-PRRT-DEL-F:5’-GAGTATGTAGATGGGGCAGCCA-3’和HIV-PRRT-DEL-R:5’-GAGAAGCTAAAGGATACAGTTCCTTGT-3’为引物,进行PCR扩增;扩增产物经5’磷酸化后进行自连,再使用酶切位点XhoI筛选得到重组表达质粒pGag;
所述表达报告基因的重组慢病毒质粒pLenti-Luc,其构建方法如下:
用BamHI和PvuII双酶切质粒pUC19,回收209bp片段;用PvuII和EcoRI双酶切质粒pUC19,回收92bp片段;将上述两种片段混合,与经BamHI和EcoRI双酶切并脱磷的载体pEGFP-N1连接,得到重组质粒pEGFP-N1-lac;
用XbaI和NcoI双酶切含荧光素酶基因的质粒pG5Luc,切胶回收1656bp的Luc基因片段,Klenow处理后,与经SmaI酶切的载体pUC19相连,得到中间质粒pUC19-Luc;
用BamHI和EcoRI双酶切质粒pUC19-Luc,回收含有Luc基因的长1700bp的片段,连接到经EcoRI和BglII双酶切的含CMV启动子的质粒pEGFP-N1-lac上,得到质粒pEGFP-N1-lac-luc;
合成如下两条寡核苷酸序列:
5’-tatgaagcttggatccgaattcgggcccgtcgacggtac-3’和
5’-cgtcgacgggcccgaattcggatccaagcttca-3’;
上述两条寡核苷酸经变性后退火,形成末端分别为NdeI和KpnI的linker;用NdeI和KpnI双酶切慢病毒载体pLenti6/V5gwLacZ,与上述linker连接,得到质粒pLenti-Link;
用NdeI和EcoRI双酶切质粒pEGFP-N1-lac-luc,回收含有CMV早期启动子和Luc基因的长为2056bp的DNA片段,连接到经NdeI和EcoRI双酶切的质粒pLenti-Link上,得到重组慢病毒质粒pLenti-Luc;
所述表达HIV的Rev基因的重组表达质粒pRev,其构建方法如下:
以质粒pHIV-NL4-3为模板,以Rev-rEco:
5’-CGGAATTCGGAGTGTATTAAGCTTGTGT-3’和Rev-fBam:
5’-AGGGATCCAAAGAGCAGTGGGAATAGGA-3’为引物,扩增HIV Rev基因;扩增产物经BamHI和EcoRI双酶切后插入到经相同酶切的真核表达载体pcDNA3.1(-)中,得到重组表达质粒pRev;
所述表达疱疹性口炎病毒壳G糖蛋白基因的重组表达质粒为pVSV-G。
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