[发明专利]辅助筛选籼稻和粳稻的方法

说明书

技术领域

本发明涉及一种辅助筛选籼稻和粳稻的方法。

背景技术

栽培稻是世界上最重要的粮食作物之一，在其11,500多年的栽培稻驯化历史中为适应不同的农业生态环境，栽培稻形成了丰富的遗传多样性和明显的遗传分化，产生了籼稻(indica)和粳稻(japonica)两个不同的生态型(Morishima H，Oka HI.Phylogenetic differentiation of cultivated rice.XXII.Numerableevaluation of the Indica-Japonica differentiation.Japanese Journal ofBreeding，1981，31：402-413；GlaszmannJC.Isozymes and classification ofAsian rice varieties.Theoretical and Applied Genetics，1987，74：21-30；Wang Z Y，Tanksley S D.Restriction fragment length polymorphism in OryzasativaL.Genome，1989，32：1113-1118；Blair M W，Panaud O，McCouch S R.Inter-simple sequence repeat(ISSR)amplification for analysis ofmicrosatellite motif frequency and fingerprinting in rice(Oryza sativaL.).Theoretical and Applied Genetics，1999，98(5)：780-782.))。它们之间在许多形态和生理性状上存在着明显的差异(Morishima H，Oka H I.Phylogenetic differentiation of cultivated rice.Numerical evaluations ofthe indica-japonica differentiation.Jpn.J.Breed，1981，31：402-413；WANG Xiang-Kun，CHENG Kan-Sheng，HUAN Nai-Wei，LUO Jun，LU Yi-Xuan，LIU Guang-Rong.Study on two important rice types concerning the origin anddifferentiation of Asian cultivated rice.Acta Genetica Sinica，1987，14(4)：262-270.)。然而，水稻的籼粳分化是一个缓慢的进化过程，在许多水稻地方种中存在着典型的籼稻或粳稻，但也存在籼粳分化不明显的中间型，对于这些类型很难用传统的方法来鉴定，更难研究水稻的籼粳分化程度。因此，开发新型的Marker基因及其分子标记来准确鉴定籼稻和粳稻，并用其研究水稻的进化非常必要。

过氧化物酶基因是一类与叶片衰老有关的基因(M.Kar and D.Mishra，Catalase，Peroxidase，and Polyphenoloxidase Activities during Rice LeafSenescence.Plant Physiology.57(1976)315-319.)，在植物抵御生物胁迫过程中起着重要作用(J.M.Chittoor，J.E.Leach and F.F.White，Differentialinduction of a peroxidase gene family during infection of rice by Xanthomonasoryzae pv.oryzae.Molecular Plant Microbe Interactions.10(1997)861-871.)。

发明内容

本发明的目的是提供一种辅助筛选籼稻和粳稻的方法。

本发明所提供的辅助筛选籼稻和粳稻的方法，是检测待测水稻中是否缺失GenBank accession AP003771中自5’末端第71046-72062位核苷酸序列，若缺失，则待测水稻为候选籼稻，若不缺失则待测水稻为候选粳稻。

其中，所述缺失具体可通过PCR扩增进行检测。

所述PCR扩增具体可扩增包含GenBank accession AP003771中自5’末端第71046-72062位核苷酸序列的片段。