[发明专利]对拉伸分子动力学模拟中拉伸方向优化的方法及装置

权利要求书

1. 一种对拉伸分子动力学模拟中拉伸方向优化的方法，主要包括以下步骤：

(a)对模拟体系建立数学优化模型的步骤；

(b)运用非数值的优化算法对上述优化模型进行优化，得到新的拉伸方向r^t的步骤；

(c)用所得优化后的r^t做为拉伸分子动力学模拟中的拉伸方向，继续动力学模拟，直至需要开始新的方向调整，重新进行方向优化，得到最优方向r^t′，如此循环，直至拉伸模拟结束的步骤。

2. 根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述数学优化模型为如下式(1)：

maxF(x)=||xlignew(r)-xliginit(r)||]]>

s.t.-π≤φ≤π0≤θ≤π2......(1)]]>

式中，‖x_lig^new(r)-x_lig^old(r)‖表示配体在新的拉伸方向为r^t的作用下，经过一定的时间步后配体分子的移动距离；而新的拉伸方向r^t是初始拉伸方向r⁰和进动角φ与章动角θ的函数。

3. 根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述非数值的优化算法为遗传算法。

4. 根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述遗传算法中采用多种群优化、信息熵的优化、加权系数法优化和最优保留优化。