[发明专利]寡核苷酸芯片及其应用无效

专利信息
申请号: 200810016888.2 申请日: 2008-06-24
公开(公告)号: CN101586149A 公开(公告)日: 2009-11-25
发明(设计)人: 韩金祥;庞靖祥;高雪芹 申请(专利权)人: 山东省医药生物技术研究中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04
代理公司: 济南圣达专利商标事务所有限公司 代理人: 李健康
地址: 250062*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 寡核苷酸 芯片 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种基于biotin-avidin-cy3反应系统的随机引物PCR扩增标记的寡核苷酸芯片, 由基片和阵列涂布于其上的CMV、HSVI、RV、EBV或TB病原体探针以及阴性对照、阳性 对照、空白对照制成,其特征在于:所述基片是表面醛基化修饰的载玻片;所述病原体 探针是10条5’端合成有一个氨基、6个CH2碳臂和15个T的寡核苷酸序列的、点样浓度均 为10μM的CMV-1、CMV-2、HSVI-1、HSVI-2、RV1、RV2、EBV1、EBV2、TB1和TB2探针;所述阴性对 照为5’端合成有一个氨基、6个CH2碳臂和15个T的寡核苷酸序列的、点样浓度为10μM 的JEV探针;所述阳性对照为5’端合成有一个氨基、6个CH2碳臂和15个T的寡核苷酸序 列的、点样浓度为10μM的合成标记探针,探针的序列为NH2-(CH2)6-Poly(dT)15-Tamra;所 述空白对照为双蒸水;所述芯片的阵列布局如图1所示;其中:上述CMV-1、CMV-2、HSVI-1、 HSVI-2、RV1、RV2、TB1、TB2、EBV1和EBV2探针具体序列为:

CMV-1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

CGTCTCACGGTCTCGGGACTGGCCTGGACGCGTCAGCAGAACCAGTGGAAAGAGCCCGACGTCTACTACA;

CMV-2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

GAGCGGCAGAAACGGGTGGACGACGAGGTGGTGCAGCGTGAGAAACAGCAGCTGAAGGCTTGGGAGGAGA;

HSVI-1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

GACAAACCCAACCGTCCCGTAGTCCCATCCCCCGATCCCAACAACTCCCCCGCGCGCCCGGAGACCAGTC;

HSVI-2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

CCCCGCTGTTCTCGTTCCTCACTGCCTCCCCCGCCCTGGACACCCTCTTCGTCGTCAGCACCGTCATCCA;

RV1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

CCACCGACACCGTGATGAGCGTGTTTGCCCTCGCCAGCTACGTCCAGCACCCTCACAAGACCGTCCG;

RV2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

CCCCGACTGGGCCTCCCCGGTTTGCCAACGCCATTCCCCTGACTGCTCGCGGCTCGTGGG;

TB1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

GCCAACATACCCGCCGAGTTCTTGAAGAACTTCGTTCGTAGCAGCAACCTGAAGTTCCAGGATGCGTACA;

TB2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

CTGCCAGACTTACAAGTGGGAACCTTCCTGACCAGCGAGCTGCCGCAATGGTTGTCCGCCAACAG;

EBV1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

CGTCCCGTAGTCCCATCCCCCGATCCCAACAACTCCCCCGCGCGCCCCGAGACCAGTCGCCCGAAGACAC;

EBV2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

CCACGACACACTGATGAACACCACCACGATGACTCCCTCCCGCACCCTCAACAAGCTACCGACGATTCTA;

所述阴性对照探针具体序列为:

NH2-(CH2)6-Poly(dT)15

GTGCAAACAAGGTTTCACTGATCGTGGGTGGGGCAACGGATGTGGACTTTTCGGGAAGGGAAGCATTGAC。

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