[发明专利]寡核苷酸芯片及其应用无效
| 申请号: | 200810016888.2 | 申请日: | 2008-06-24 |
| 公开(公告)号: | CN101586149A | 公开(公告)日: | 2009-11-25 |
| 发明(设计)人: | 韩金祥;庞靖祥;高雪芹 | 申请(专利权)人: | 山东省医药生物技术研究中心 |
| 主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 济南圣达专利商标事务所有限公司 | 代理人: | 李健康 |
| 地址: | 250062*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 寡核苷酸 芯片 及其 应用 | ||
1.一种基于biotin-avidin-cy3反应系统的随机引物PCR扩增标记的寡核苷酸芯片, 由基片和阵列涂布于其上的CMV、HSVI、RV、EBV或TB病原体探针以及阴性对照、阳性 对照、空白对照制成,其特征在于:所述基片是表面醛基化修饰的载玻片;所述病原体 探针是10条5’端合成有一个氨基、6个CH2碳臂和15个T的寡核苷酸序列的、点样浓度均 为10μM的CMV-1、CMV-2、HSVI-1、HSVI-2、RV1、RV2、EBV1、EBV2、TB1和TB2探针;所述阴性对 照为5’端合成有一个氨基、6个CH2碳臂和15个T的寡核苷酸序列的、点样浓度为10μM 的JEV探针;所述阳性对照为5’端合成有一个氨基、6个CH2碳臂和15个T的寡核苷酸序 列的、点样浓度为10μM的合成标记探针,探针的序列为NH2-(CH2)6-Poly(dT)15-Tamra;所 述空白对照为双蒸水;所述芯片的阵列布局如图1所示;其中:上述CMV-1、CMV-2、HSVI-1、 HSVI-2、RV1、RV2、TB1、TB2、EBV1和EBV2探针具体序列为:
CMV-1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
CGTCTCACGGTCTCGGGACTGGCCTGGACGCGTCAGCAGAACCAGTGGAAAGAGCCCGACGTCTACTACA;
CMV-2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
GAGCGGCAGAAACGGGTGGACGACGAGGTGGTGCAGCGTGAGAAACAGCAGCTGAAGGCTTGGGAGGAGA;
HSVI-1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
GACAAACCCAACCGTCCCGTAGTCCCATCCCCCGATCCCAACAACTCCCCCGCGCGCCCGGAGACCAGTC;
HSVI-2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
CCCCGCTGTTCTCGTTCCTCACTGCCTCCCCCGCCCTGGACACCCTCTTCGTCGTCAGCACCGTCATCCA;
RV1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
CCACCGACACCGTGATGAGCGTGTTTGCCCTCGCCAGCTACGTCCAGCACCCTCACAAGACCGTCCG;
RV2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
CCCCGACTGGGCCTCCCCGGTTTGCCAACGCCATTCCCCTGACTGCTCGCGGCTCGTGGG;
TB1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
GCCAACATACCCGCCGAGTTCTTGAAGAACTTCGTTCGTAGCAGCAACCTGAAGTTCCAGGATGCGTACA;
TB2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
CTGCCAGACTTACAAGTGGGAACCTTCCTGACCAGCGAGCTGCCGCAATGGTTGTCCGCCAACAG;
EBV1:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
CGTCCCGTAGTCCCATCCCCCGATCCCAACAACTCCCCCGCGCGCCCCGAGACCAGTCGCCCGAAGACAC;
EBV2:NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
CCACGACACACTGATGAACACCACCACGATGACTCCCTCCCGCACCCTCAACAAGCTACCGACGATTCTA;
所述阴性对照探针具体序列为:
NH2-(CH2)6-Poly(dT)15
GTGCAAACAAGGTTTCACTGATCGTGGGTGGGGCAACGGATGTGGACTTTTCGGGAAGGGAAGCATTGAC。
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