[发明专利]OB折叠结构域无效
申请号: | 200780028107.5 | 申请日: | 2007-05-25 |
公开(公告)号: | CN101506227A | 公开(公告)日: | 2009-08-12 |
发明(设计)人: | V·L·阿尔库斯;J·D·斯蒂姆森;M·巴克 | 申请(专利权)人: | 怀卡托灵科有限公司 |
主分类号: | C07K14/00 | 分类号: | C07K14/00;C07K17/02;C12N15/63;C07H21/00;C12N15/01;G01N33/68 |
代理公司: | 北京市中咨律师事务所 | 代理人: | 黄革生;林柏楠 |
地址: | 新西兰*** | 国省代码: | 新西兰;NZ |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ob 折叠 结构 | ||
1.经分离的经修饰的OB-折叠结构域,其可从天然存在的OB-折叠结 构域获得,其中所述经修饰的OB-折叠结构域包含:
a)较之所述天然存在的OB-折叠结构域而言,在所述OB-折叠结构域 结合面的β-链中的至少一个经修饰的氨基酸残基,或
b)在所述OB-折叠结构域结合面的β-链中的至少一个经修饰的氨基 酸残基和在所述OB-折叠结构域环区域的链中的至少一个经修饰的氨基酸 残基,或
c)在所述OB-折叠结构域环区域的链中的至少一个经修饰的氨基酸残 基,
并且,其中,所述经修饰的OB-折叠结构域较之所述天然存在的OB- 折叠结构域而言具有改变的结合特性。
2.权利要求1的经修饰的OB-折叠结构域,其中所述结构域特异性地 与较所述天然存在的OB-折叠结构域不同的结合伴侣结合,或者与其天然 存在的结合伴侣具有经修饰的结合。
3.权利要求1或权利要求2的经修饰的OB-折叠结构域,其中,所述 天然存在的OB-折叠结构域存在于蛋白质或蛋白质类中,其选自葡萄球菌 核酸酶蛋白质、细菌肠毒素、TIMP样蛋白质、血红素分子伴侣CcmE蛋 白质、尾部-相关溶菌酶gp5、N末端结构域蛋白质、核酸结合蛋白质、无 机焦磷酸酶、Mop样蛋白质、CheW样蛋白质、tRNA_抗(OB-折叠核酸 结合结构域)、Telo_结合(端粒-结合蛋白α亚基,中央结构域)、SSB (单链结合蛋白质家族OB-折叠结构域)、DUF338 OB-折叠结构域;DNA- 连接酶_aben(NAD依赖性DNA连接酶OB-折叠结构域)、Stap-Strp-毒 素(葡萄球菌/链球菌毒素、OB-折叠结构域)、EIF-5a(真核起始因子5A 羟丁赖氨酸,DNA结合OB-折叠结构域)、GP5_OB(GP5N末端OB- 折叠结构域)、CSD、DNA_连接酶_OB、DUF388、EFP、eIF-1a、 mRNA_cap_C、OB_RNB、噬菌体_DNA_结合、Rep-A_N、Rho_RNA 结合、核糖体_L2、核糖体_S12;核糖体_S17、RNA_pol_Rpb8、RuvA_N、 S1、TOBE、TOBE_2和tRNA_结合。
4.权利要求1或权利要求2的经修饰的OB-折叠结构域,其中所述天 然存在的OB-折叠结构域来自嗜热生物。
5.权利要求4的经修饰的OB-折叠结构域,其中所述嗜热生物是耐超 高温热棒菌(Pyrobaculum aerophilum)。
6.权利要求1-5中任意一项的经修饰的OB-折叠结构域,其中所述经 修饰的氨基酸残基在折叠相关结合面的β-链中。
7.权利要求1-6中任意一项的经修饰的OB-折叠结构域,其中所述经 修饰的OB-折叠结构域的结合伴侣选自核酸、寡糖、蛋白质、激素和小有 机分子。
8.获得权利要求1-7中任意一项的经修饰的OB-折叠结构域的方法, 其包括:
a)获得编码天然存在的OB-折叠结构域或者编码包含结合面的链和/ 或环的链的其部分的核酸,以及
b)改变所述核酸,使得其编码:较之所述天然存在的OB-折叠结构域 而言,在结合面的β-链上的至少一个经修饰的氨基酸残基和/或在环的链上 的至少一个经修饰的氨基酸残基,其中,获得经修饰的OB-折叠结构域, 并且,其中,所述经修饰的OB-折叠结构域较之所述天然存在的OB-折叠 结构域,具有改变的结合。
9.权利要求8的方法,其还包括:改变编码所述经修饰的OB-折叠结 构域的核酸,和/或改变编码下述蛋白质的至少一个氨基酸的核酸,所述蛋 白质包含所述经修饰的OB-折叠结构域。
10.产生用于展示的经修饰的OB-折叠结构域蛋白质的文库的方法, 所述方法包括:
a)获得编码OB-折叠结构域或其部分的核酸,以及
b)对所述核酸进行随机改变,由此产生编码经修饰的OB-折叠结构域 的经改变的核酸的集合,所述经修饰的OB-折叠结构域具有至少一个随机 化的氨基酸残基。
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