[发明专利]一种检测转基因品系特异性时品系特异性序列的扩增方法无效
申请号: | 200710041264.1 | 申请日: | 2007-05-25 |
公开(公告)号: | CN101311275A | 公开(公告)日: | 2008-11-26 |
发明(设计)人: | 赵凯;朱宏;潘爱虎;贾军伟;孙建萍 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12P19/34 |
代理公司: | 上海开祺知识产权代理有限公司 | 代理人: | 费开逵 |
地址: | 20110*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 转基因 品系 特异性 序列 扩增 方法 | ||
1.一种在转基因生物品系特异性检测中扩增基因组品系特异序列方法,首先合成人工接头,分别在连接头上和基因组已知区域设计引物Primer S1、Primer S2,然后将基因组进行酶切,将酶切片段与此连接头连接,取连接产物做模板,以连接头引物和基因特异引物做PCR,步骤如下:
1)DNA的限制酶酶切反应:配制限制酶酶切反应液,反应3~5小时,回收DNA,并溶解于蒸馏水;
2)配制连接反应液:将步骤1)所得DNA溶液、接头、DNA连接酶、蒸馏水混合进行反应,回收DNA,并溶解于蒸馏水,加热;
3)进行1st PCR反应;
4)进行2nd PCR反应;
5)确认PCR反应产物。
2.根据权利要求1所述的扩增基因组品系特异序列方法,其特征在于:所述的转基因生物为:转基因玉米、转基因大豆、转基因油菜、转基因番茄或转基因棉花。
3.根据权利要求2所述的扩增基因组品系特异序列方法,其特征在于:所述的转基因生物为转基因玉米。
4.根据权利要求3所述的扩增基因组品系特异序列方法,其特征在于:引物Primer S1和Primer S2的序列为:
Primer S1 5′AGGGTCTTGCGAAGGATAGTGGGATTGTGCGTCAT 3′
Primer S2 5′CCTTTCCTTTATCGCAATGATGGCATTTGTAGGTG 3′
5.根据权利要求1所述的扩增基因组品系特异序列方法,其特征在于:步骤2)中所述的接头为Pst I接头、Sau3A I接头、Hind III接头、EcoR I接头、Sal I接头或Xba I接头。
6.根据权利要求5所述的扩增基因组品系特异序列方法,其特征在于:所述的接头和接头引物的序列为:
Sau3AI接头:5′HO:GTACA TATTG TCGTT AGAAC GCGTA ATACG ACTCA CTATA GGGA3′
3′:CATGT ATAAC AGCAA TCTTG CGCAT TATGC TGAGT GATAT CCCTC TAG OH 5′
EcoRI接头:5′HO:GTACA TATTG TCGTT AGAAC GCGTA ATACG ACTCA CTATA GGGAG AG 3′
3′:CATGT ATAAC AGCAA TCTTG CGCAT TATGC TGAGT GATAT CCCTC TCTTA A OH 5′
HindIII接头:5′HO:GTACA TATTG TCGTT AGAAC GCGTA ATACG ACTCA CTATA GGGAG A 3′
3′:CATGT ATAAC AGCAA TCTTG CGCAT TATGC TGAGT GATAT CCCTC TTCGA OH 5′
PstI接头:5′HO:GTACA TATTG TCGTT AGAAC GCGTA ATACG ACTCA CTATA GGGAG ACTGC A 3′
3′:CATGT ATAAC AGCAA TCTTG CGCAT TATGC TGAGT GATAT CCCTC TG OH 5′
SalI接头:5′HO:GTACA TATTG TCGTT AGAAC GCGTA ATACG ACTCA CTATA GGGAG AG
3′:CATGT ATAAC AGCAA TCTTG CGCAT TATGC TGAGT GATAT CCCTC TCAGC T OH 5′
XbaI接头:5′HO:GTACA TATTG TCGTT AGAAC GCGTA ATACG ACTCA CTATA GGGAG AT 3′
3′:CATGT ATAAC AGCAA TCTTG CGCAT TATGC TGAGT GATAT CCCTC TAGAT C OH 5′
接头PrimerC1:5′HO:GTACA TATTG TCGTT AGAAC GCGTA ATACG ACTCA 3′
接头PrimerC2:5′HO:CGTTA GAACG CGTAA TACGA CTCAC TATAG GGAGA 3′
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