[发明专利]与黄瓜雌性性状相关的分子标记及其应用无效
申请号: | 200710035159.7 | 申请日: | 2007-06-15 |
公开(公告)号: | CN101113469A | 公开(公告)日: | 2008-01-30 |
发明(设计)人: | 徐向丽;易克;陈刚;卢向阳 | 申请(专利权)人: | 易克;湖南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;A01H1/02 |
代理公司: | 长沙市融智专利事务所 | 代理人: | 颜勇 |
地址: | 410128湖南省长沙市火星开*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 黄瓜 雌性 性状 相关 分子 标记 及其 应用 | ||
1.与黄瓜雌性性状相关的分子标记,其特征在于该分子标记是黄瓜EIN3基因在153bp和501bp处发生的两个单核苷酸变异,见序列表SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2,这两个单核苷酸变异分别为G153bp和A153bp、T501bp和A501bp。
2.利用权利要求1所述的两个单核苷酸的变异设计的两组引物,其特征在于:上游引物3’端前6个碱基序列为3’ttg aag,为10~20个碱基组成的DNA片段。
3.根据权利要求2所述的引物,其特征在于:它包括两组引物,其中引物组I上游引物具有序列表中SEQ ID NO.3所述的核苷酸序列,引物组I下游引物具有序列表中SEQ ID NO.4所述的核苷酸序列,引物组II上游引物具有序列表中SEQ ID NO.5所述的核苷酸序列,引物组II下游引物具有序列表中SEQID NO.6所述的核苷酸序列。
4.一种获得黄瓜雌性性状分子标记的方法,其特征在于包括以下步骤:
1)材料培养和黄瓜性别的鉴定;
2)黄瓜幼嫩叶片基因组DNA的提取;
3)根据EIN3或EIL基因mRNA的保守序列设计引物进行PCR扩增;
4)PCR产物的克隆测序及测序结果的比对分析;
5)根据序列比对结果设计两组引物引物,在亲本及F2群体中进行验证。
5.根据权利要求4所述的获得黄瓜雌性性状分子标记的方法,其特征在于基因组DNA提取过程中分别用1%CTAB、5M KAc和1M NaCl处理。
6.根据权利要求4所述的获得黄瓜雌性性状分子标记的方法,其特征在于PCR扩增的反应程序为:94℃预变性5min,94℃变性1min、60℃退火1min、72℃延伸2min,共40个循环后于72℃延伸7min。
7.根据权利要求4所述的获得黄瓜雌性性状分子标记的方法,其特征在于用于群体验证的上游引物3’端前6个碱基序列为3’ttg aag,为10~20个碱基组成的DNA片段。
8.根据权利要求4所述的获得黄瓜雌性性状分子标记的方法,其特征在于用于群体验证的两组引物分别为:由序列表中SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4构成的引物组I和由序列表中SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6构成的引物组II。
9.黄瓜EIN3基因的分子标记在选择育种上的的应用,其特征在于:EIN3基因上带有G153bp和T501bp分子标记或两者之一的植株均为纯雌株。
10.黄瓜EIN3基因的分子标记在选择育种上的应用,其特征在于:通过引物组I可特异性扩增得到一条382bp大小的条带;或通过引物组II可特异性扩增得到一条605bp大小的条带,即可判定该黄瓜植株为纯雌株。
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