[发明专利]通过靶特异性杂交捕获方法检测核酸有效
申请号: | 200680050037.9 | 申请日: | 2006-11-07 |
公开(公告)号: | CN101351564A | 公开(公告)日: | 2009-01-21 |
发明(设计)人: | 依瑞纳·纳扎恩克;阿迪拉·T·劳伦克兹;保罗·艾德;布赖恩·洛厄尔;理查德·马洛尼;哈·泰 | 申请(专利权)人: | 帝吉耐公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12P19/34;C07H21/04 |
代理公司: | 上海天翔知识产权代理有限公司 | 代理人: | 刘粉宝 |
地址: | 美国马*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 通过 特异性 杂交 捕获 方法 检测 核酸 | ||
1.一种检测多个靶核酸中的每一个的方法,其包括:
a)通过将所述多个靶核酸、与所述靶核酸的至少一部分互补的核 酸探针和固体载体混合来将所述多个靶核酸捕获至所述固体载体上,形 成多个富集的靶核酸,其中所述靶核酸及核酸探针一个为RNA另一个为 DNA;
b)扩增富集的核酸或核酸探针,形成多个扩增的靶;和
c)通过将所述多个扩增的靶、与所述扩增的靶的第一部分杂交的 可选择性寡核苷酸,和与所述扩增的靶的第二部分互补的核酸探针混合 形成DNA∶RNA杂交寡核苷酸复合体,来检测所述多个扩增的靶而进行 所述靶核酸的检测,其中DNA∶RNA杂交体通过DNA∶RNA杂交体特异性 结合剂检测,并通过所述寡核苷酸复合体分离进行选择,从而检测所述 多个靶核酸中的每一个。
2.如权利要求1所述的方法,其中在捕获的所述步骤中,所述固 体载体与DNA∶RNA杂交体特异性结合剂结合,由此将所述靶核酸捕获 至所述固体载体上。
3.如权利要求1所述的方法,其中所述DNA∶RNA杂交体特异性结 合剂选自由以下组成的组:DNA∶RNA杂交体特异性抗体、单克隆抗体或 多克隆抗体或其片段、蛋白质、催化失活的核糖核酸酶H,和核酸、核 酸适配子或结合并形成三链体结构的寡核苷酸。
4.如权利要求2所述的方法,其中所述DNA∶RNA杂交体特异性结 合剂为DNA∶RNA杂交体特异性抗体。
5.如权利要求2所述的方法,其中所述DNA∶RNA杂交体特异性结 合剂为与所述靶核酸互补的核酸探针。
6.如权利要求3所述的方法,其中所述DNA∶RNA杂交体特异性结 合剂被可检测地标记。
7.如权利要求6所述的方法,其中所述标记通过比色法、化学发 光、荧光和光散射方法检测。
8.如权利要求1所述的方法,其中所述捕获的靶核酸或核酸探针 通过等温扩增被扩增。
9.如权利要求8所述的方法,其中在所述等温扩增中使用DNA聚 合酶。
10.如权利要求8所述的方法,其中在所述等温扩增中使用随机引 物。
11.如权利要求10所述的方法,其中所述随机引物为五聚体。
12.如权利要求10所述的方法,其中所述随机引物包含疾病特异 性引物序列的子集。
13.如权利要求1所述的方法,其中所述选择性寡核苷酸被结合至 固体载体。
14.如权利要求1所述的方法,其中所述固体载体选自由以下所组 成的组:平板、微平板、微量板、载玻片、皿、微珠、颗粒、微粒、杯 子、条状物、芯片、微芯片、带状物、膜、微阵列和试管。
15.如权利要求14所述的方法,其中所述固体载体的制造材料选 自由以下所组成的组:玻璃、硅、塑料、聚苯乙烯、聚乙烯、聚丙烯和 聚碳酸酯。
16.如权利要求14所述的方法,其中修饰所述固体载体以使其包 含:进行修饰以便表面包含羧基、氨基、酰肼、醛基、核酸或核苷酸衍 生物、伯氨基和染料。
17.如权利要求1所述的方法,其进一步包括添加阻断剂探针。
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