[发明专利]寡核苷酸设计和/或核酸检测的方法和/或装置无效

专利信息
申请号: 200680036976.8 申请日: 2006-08-08
公开(公告)号: CN101292044A 公开(公告)日: 2008-10-22
发明(设计)人: C·W·C·黄;宋永健;李华星;L·D·米勒 申请(专利权)人: 新加坡科技研究局
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;G06F19/00
代理公司: 北京润平知识产权代理有限公司 代理人: 周建秋;王凤桐
地址: 新加坡*** 国省代码: 新加坡;SG
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摘要:
搜索关键词: 寡核苷酸 设计 核酸 检测 方法 装置
【权利要求书】:

1.设计至少一种用于核酸检测的寡核苷酸的方法,该方法包括以下步 骤:

(I)对靶核酸va的每个位置i计算扩增效率得分:

AESi=Σj=i-Zi{Pf(j)×Σk=max(i+1,j+500)j+ZPr(k)}]]>

其中Σk=max(i+1,j+500)j+ZPr(k)=Pr(i+1)+Pr(i+2)+......Pr(j+Z);]]>

Pf(i)和Pr(i)为随机引物ri作为正向引物和反向引物分别与va的位置i 结合的概率,并且Z≤10000bp为va的想要扩增的区域;

(II)确定和/或选择至少一种靶核酸的至少一个待扩增区域,该区域的扩 增效率高于平均扩增效率;和

(III)设计至少一种能够与所确定和/或选择的区域进行杂交的寡核苷酸。

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