[发明专利]一种食管癌易感性检测试剂盒

说明书

技术领域

本发明涉及一种疾病易感性检测用的试剂盒，尤其是一种检测食管癌易感性的试剂盒，通过检测X射线交错互补修复基因1(X-ray repair cross--complementing gene1，XRCC1)的单核苷酸多态性(SNP)位点来预测个体对食管癌的易感性。

背景技术

食管癌是原发于食管的恶性肿瘤，以鳞状上皮癌多见，是世界一些国家和地区的常见病，临床上以进行性吞咽困难为最典型的症状。中国是世界上食管癌的高发国家，也是世界上食管癌高死亡率的国家之一，年平均死亡率为14.59/10万。食管癌的流行病学有以下特点：①地区性分布，如在我国北方发病率可达130/10万，而美国仅为5/10万；而且在同一省的不同地区存在迥然不同的发病情况，高发与低发区之间的发病率相差数十倍到二三百倍；②男性高于女性，其比例为1.3～3∶1；③食管癌中老年易患，我国的80％的患者发病在50岁以后，高发地区人群发病和死亡比低发地区提前10年。

食管癌的确切病因目前尚不清楚，其发生与该地区的生活条件、饮食习惯、存在强致癌物、缺乏一些抗癌因素及有遗传易感性等有关。亚硝胺是被公认的化学致癌物，在高发区的粮食和饮水中，含量显著增高，且与当地食管癌和食管上皮重度增生的患病率呈正相关。各种霉变食物能产生致癌物质。镰刀菌、白地霉菌、黄曲霉菌和黑曲霉菌等真菌不但能还原硝酸盐为亚硝酸盐，并能增加二级胺的含量，促进亚硝胺的合成。霉菌与亚硝胺协同致癌。食物粗糙、进食过烫，咀嚼槟榔或烟丝等习惯，造成对食管粘膜的慢性理化刺激，可致局限性或弥漫性上皮增生，形成食管癌的癌前期病变。慢性食管疾病如腐蚀性食管灼伤和狭窄、胃食管反流病、食管贲门失弛缓症或食管憩室等患者食管癌发生率增高，可能是由于食管内容物滞留而致慢性刺激所致。饮食缺乏动物蛋白、新鲜蔬菜和水果，摄入的维生素A、B2和C缺乏，是食管癌的危险因素。流行病学调查表明，食物、饮水和土壤内的元素钼、硼、锌、镁和铁含量较低，可能与食管癌的发生间接相关。食管癌的发病常表现家族性聚集现象。在我国高发地区，本病有阳性家族史者达25％～50％，其中父系最高，母系次之，旁系最低。食管癌高发家族的外周血淋巴细胞染色体畸变率较高，可能是决定高发区的食管癌易感性的遗传因素。

环境和遗传等多因素引起食管癌的发生，其涉及的分子生物学基础是癌基因激活或抑癌基因失活一组基因变化所致，研究已证实的有Rb、p53等抑癌基因失活，以及环境等多因素使原癌基因H-ras、C-mys和hsl-1等激活有关。

XRCC1位于第19号染色体1q13.2-13.3位置，全长32.3kb，mRNA全长2087bp，共有17个外显子，编码634个氨基酸的蛋白。XRCC1编码的蛋白对因电离辐射和烷基化物引起的DNA单链断裂能起到有效的修复作用。XRCC1编码的蛋白与DNA连接酶III、聚合酶β、多聚ADP核糖转移酶交互作用，参与DNA的碱基切除修复(Base Excision Repair，BER)通路。XRCC1参与的DNA修复通路的遗传性或获得性缺陷将破坏基因的完整性，导致细胞向恶性转变，从而影响个体对肿瘤疾病的易感性。众多研究显示，XRCC1基因上部分位点的多态性，与癌症发生有密切的关系。与XRCC1相关的癌症主要有：乳腺癌、头颈部鳞状细胞癌、食管癌、胃癌、结肠癌、胰腺癌、肺癌等。

SNP(single nucleotide polymorphism)，即单核苷酸多态性标记，是一类基于单碱基变异引起的DNA多态性，被遗传学界称为第三代遗传标记。主要是指由基因组核苷酸水平上的变异引起的DNA序列多态性，包括单碱基转换、颠换，以及单碱基的插入/缺失等。它是基因组中最为广泛存在的一类多态性标记，占大约90％。这些基因组序列变异可以导致个体间表型的差异以及不同个体对疾病，特别是复杂疾病的易感性、和对环境因素、药物反应的差异。

rs1799782是位于第19号染色体XRCC1基因上的一个C/T多态，引起XRCC1基因编码的蛋白第194个氨基酸由Arg变为Trp。在世界人群中的该多态的频率分布，C占0.8752，T占0.125左右。中国人群中的分布C为0.72，T为0.28。国内研究表明，携带XRCC1TrpTrp基因型的个体患食管癌的风险度为其他人群的2倍左右，因此rs1799782位点携带T型即为食管癌易感型。

发明内容

基于XRCC1基因上的rs1799782号SNP位点可用来评估个体对食管癌的易感性的基础上，本发明提供一种检测食管癌易感性的试剂盒。