[发明专利]使用光钳自动提取和纯化样品无效

专利信息
申请号: 200580042023.8 申请日: 2005-12-12
公开(公告)号: CN101437957A 公开(公告)日: 2009-05-20
发明(设计)人: 约瑟夫·S·普莱瓦;埃文·B·坦纳;丹尼尔·M·米特;克里斯特尔·J·杜克;凯文·J·埃伦赖希 申请(专利权)人: 阿尔利克斯公司
主分类号: C12Q1/00 分类号: C12Q1/00
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司 代理人: 刘晓东;顾晋伟
地址: 美国伊*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 使用 自动 提取 纯化 样品
【说明书】:

相关申请的交叉引用

本申请要求2004年12月10日提交的序列号60/635,164和2004年 12月13日提交的序列号60/634,980的美国临时专利申请的优先权,通 过引用将其全文并入本文。

发明背景

1.技术领域

本发明涉及使用光钳(optical tweezer)自动提取和纯化样品。具体 而言,本发明涉及使用全息光学捕捉(optical trapping)自动提取和纯 化来自样品-尤其是性侵犯的法医样品(即拭样、织物等)的精子。

2.相关技术

法医鉴定需要严格仔细保持保管的连续性。此外,在诸如法医DNA 鉴定等领域,适当处理证据能够防止污染DNA样品,允许来自分离细胞 的DNA的有效PCR(聚合酶链反应)扩增以及允许STR(短串联重复) 分析。

由于强奸案件中样品收集的特点,例如,分离受害者DNA与犯人DNA 对于实施鉴定是必需的。鉴定时,来自受害者的上皮细胞所含DNA经常 与犯人精子内的DNA混合,干扰鉴定结果。目前,广泛应用的从上皮细 胞中分离精子的现有技术是一系列的洗脱步骤,其被设计用来选择性的拆 开一种或另一种细胞类型的细胞膜,接着从该细胞类型中洗脱出DNA,然 后溶解(lysing)第二细胞类型,收集第二DNA样品。由于此技术的不严 密性,以及细胞和细胞/样品历史的多样性,这种溶解/洗脱技术经常给出 混杂了受害者与加害者二者特征的STR结果。如果加害者未知,则利用 DNA/STR数据库来查找/识别加害者。对于这些情况,混杂的STR特征妨 碍数据库的使用,也妨碍将法医数据与(a)其它犯罪和(b)潜在加害者 相联系。

因此,需要一种能够对大量物体进行高精度三维处理的方法和装置, 其能远距离移动物体,如细胞,或者旋转物体以从多个角度分析。还希望 对样品的处理过程进行视觉记录,例如通过摄像和/或录像。具有一种能在 密闭室中进行该操作的方法和装置也是有利的,例如避免交叉感染的可能 性以及不造成物体的损伤。此外,为了贮存和在以后某一时间潜在的进一 步分析,保藏所有收集的材料也是有益的。

发明概述

本发明建立了使用光钳作为自动分离方法的核心的应用,该分离方 法可实际应用于从样品中分离精子的法医工作、遗传分析或者其它法医 应用。具体而言,本发明涉及一种自动化仪器,其利用光学捕捉或全息 光学捕捉(HOT)从包含精子、上皮细胞和其它物质的复杂样品中分离 出纯化的精子样品,以鉴定精子DNA的基因组成。

具体而言,全息光学捕捉(HOT)技术可以通过高速处理、大量平 行分选来自动分离精子与上皮细胞而使法医样品的处理发生革命。

具体地,HOT将单束激光束全息分成多个由计算机控制(因此可定 位与可移动)的三维光阱。HOT系统通过使用空间光调节器(通常是 液晶装置)编码全息图而完成上述工作。计算机界面输入所需全息图案 至空间光调节器。接着,激光束从空间光调节器弹出,在进入显微镜物 镜时,分裂成所需的光阱图案。计算机产生的图案可迅速更新,以产生 激光光阱的活动序列,沿用户规定的路径拉动颗粒。全息控制甚至允许 调整光阱的类型和特性以使得可以处理类似金属的颗粒或吸附颗粒。净 结果是完全的微米处理或纳米处理系统,为用户提供沿三维任意路径同 时移动大量细胞或其它颗粒的能力。CCD照相机和图像处理的加入提 供了机器视觉引导系统,其能自动执行复杂的处理。

因为可创建大型光阱阵列,所以HOT可被用于创建光过滤器,其 优点远超过标准的基于材料的过滤器。这些光过滤器能扫除不想要的物 质,纯化或分选样品以提供所需的组分。HOT过滤器永不堵塞,无背 压,并且可被调节至不损伤材料,例如细胞。此外,计算机控制的过滤 器的全能性意味着可以分选广泛的材料。

因此,HOT系统结合了两种强大的技术-激光和全息摄影术-使得 能够高精度地三维处理大量物体。例如细胞的样品可被长距离移动,或 者旋转以从多个角度分析。由于激光束被用于有效地使物体飘浮空中, 因而处理可发生在密闭室中,使得交叉污染最小化或被消除。此外,光 对有生命或无生命物质的处理非常温和,因而使对颗粒产生损伤的影响 最小化。全息激光处理系统也可被用于用户交互模式或可对事实上无限 的处理任务组进行编程。

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