[发明专利]适体调节的核酸及其应用

权利要求书

1.一种核酸，包含：(i)能形成外源酶活性底物的底物序列，和(ii)与配体结合的适体，其中所述配体与所述适体的结合引起核酸构象变化，改变了所述底物序列形成所述底物的能力和/或改变了所述底物对外源酶活性的Km和/或Kcat.

2.一种核酸，包含：(i)用于抑制靶基因表达的反义序列，和(ii)与配体结合的适体，其中所述配体与所述适体的结合引起核酸构象变化，改变了所述反义序列抑制靶序列表达的能力。

3.一种核酸，包含：(i)与另一种核酸的靶序列杂交的杂交序列，和(ii)与配体结合的适体，其中所述配体与所述适体的结合引起核酸构象变化，改变了所述杂交序列与所述靶序列杂交的能力。

4.一种用于改变靶基因表达的反式作用核酸，包含：(i)能与所述靶基因杂交并调节所述靶基因表达的靶向序列；和(ii)与配体结合的适体序列，其中所述配体与所述适体的结合引起所述核酸构象变化，并且所述核酸以一种依赖于所述配体存在的方式调节所述靶基因的表达。

5.权利要求1-4任意一项的核酸，其中所述核酸是核糖核酸(RNA)。

6.权利要求1-4任意一项的核酸，其中所述核酸包括一种或多种非天然存在的核苷类似物和/或一种或多种在核苷残基之间的非天然存在的主链连接物。

7.权利要求6的核酸，相对于相应的天然存在的核苷和磷酸酯主链连接物的核酸，其具有不同的稳定性、对核酸酶的敏感性和/或生物可利用性。

8.权利要求1-4任意一项的核酸，其大小范围在50-200个核苷酸。

9.权利要求1的核酸，其中构象变化产生或消除了分子内双链特征，其包括所述底物序列在内，该双链特征是所述外源酶活性的底物。

10.权利要求1或9的核酸，其中所述外源酶活性是RNA酶。

11.权利要求10的核酸，其中所述RNA酶是RNA酶III，例如切酶或Drosha。

12.权利要求11的核酸，其中所述核酸以一种依赖于所述配体与所述适体结合、所述RNA酶III以及所述底物序列的序列的方式引起基因沉默。

13.权利要求12的核酸，其中作为与所述RNA酶III反应的产物，所述底物序列在RNA干扰途径中产生siRNA、miRNA或其前体或代谢物。

14.权利要求1的核酸，其中构象变化改变了底物序列与另一种核酸物种形成分子间双链特征的能力，该双链特征是所述外源酶活性的底物。

15.权利要求14的核酸，其中另一种核酸物种是mRNA，且所述外源性酶活性以一种依赖于所述双链特征形成的方式改变mRNA。

16.权利要求1、14或15任意一项的核酸，其中外源性酶活性是RNA酶H和/或RNA酶P。

17.权利要求1或14的核酸，其中外源性酶活性选自聚合酶、重组酶、连接酶、甲基化酶、糖基化酶和核酸酶。

18.权利要求1的核酸，其中所述配体对所述底物序列形成所述底物的能力和/或改变所述底物对外源酶活性的Km和/或Kcat的影响显示剂量依赖性动力学。

19.权利要求2的核酸，其中所述配体与所述适体的结合引起构象变化，致使所述反义序列可以与所述靶基因杂交。

20.权利要求2的核酸，其中所述配体与所述适体结合引起构象变化，致使所述反义序列无法与所述靶基因杂交。

21.权利要求2的核酸，其中所述配体与所述适体结合引起核酸构象变化，改变了所述反义序列与所述靶基因杂交形成的双链体的解链温度(T_m)。

22.权利要求2、19、20或21任意一项的核酸，其中选择所述反义序列以与所述靶基因的RNA杂交。

23.权利要求2、19、20或21任意一项的核酸，其中选择所述反义序列以与所述靶基因的基因组序列杂交。

24.权利要求2的核酸，其中所述配体影响所述反义序列抑制靶序列表达的能力显示剂量依赖性动力学。