[发明专利]与质量分析结合的甲基化特异性扩增产物的碱基特异性切割无效
| 申请号： | 200580017164.4 | 申请日： | 2005-03-24 |
| 公开（公告）号： | CN101233240A | 公开（公告）日： | 2008-07-30 |
| 发明（设计）人： | 马蒂亚斯·埃里希;迪克尔·约翰内斯·范德博姆 | 申请（专利权）人： | 斯昆诺有限公司 |
| 主分类号： | C12P19/34 | 分类号： | C12P19/34 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 | 代理人： | 章社杲 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 质量 分析 结合 甲基化 特异性 扩增 产物 碱基 切割 | ||
1.一种鉴定甲基化的核酸分子的方法，包括：
(a)用可将未甲基化的胞嘧啶修饰生成尿嘧啶的试剂处理靶核酸分子；
(b)用靶核酸结合区含有一个或多个鸟嘌呤核苷酸的引物特异性扩增处理过的靶核酸分子；
(c)碱基特异性地切割扩增产物；以及
(d)检测切割产物，其中两个或多个片段的存在表示靶核酸分子含有一个或多个甲基化的胞嘧啶。
2.一种鉴定甲基化的核酸分子的方法，包括：
(a)用可将未甲基化的胞嘧啶修饰生成尿嘧啶的试剂处理靶核酸分子；
(b)扩增处理过的靶核酸分子以形成第一扩增产物；
(c)用靶核酸结合区含有一个或多个胞嘧啶核苷酸的引物特异性扩增所述第一扩增产物以形成第二扩增产物；
(d)碱基特异性地切割第二扩增产物；以及
(e)检测切割产物，其中两个或多个片段的存在表示靶核酸分子含有一个或多个甲基化的胞嘧啶。
3.一种鉴定甲基化的核酸分子的方法，包括：
(a)用可将未甲基化的胞嘧啶修饰生成尿嘧啶的试剂处理靶核酸分子；
(b)用靶核酸结合区含有一个或多个鸟嘌呤核苷酸的引物特异性扩增处理过的靶核酸分子；
(c)碱基特异性地切割扩增产物；以及
(d)检测切割产物的质量，其中：与参考质量相比较，
一个或多个切割产物的质量变化表示所述靶分子含有一个或多个甲基化的胞嘧啶。
4.一种鉴定甲基化的核酸分子的方法，包括：
(a)用可将未甲基化的胞嘧啶修饰生成尿嘧啶的试剂处理靶核酸分子；
(b)扩增处理过的靶核酸分子以形成第一扩增产物；
(c)用靶核酸结合区含有一个或多个胞嘧啶核苷酸的引物特异性扩增所述第一扩增产物以形成第二扩增产物；
(d)碱基特异性地切割所述第二扩增产物；以及
(e)检测切割产物的质量，其中：与参考质量相比较，
一个或多个切割产物的质量变化表示所述靶分子含有一个或多个甲基化的胞嘧啶。
5.一种鉴定甲基化的核酸分子的方法，包括：
(a)用可将未甲基化的胞嘧啶修饰生成尿嘧啶的试剂处理靶核酸分子；
(b)用靶核酸结合区含有一个或多个鸟嘌呤核苷酸的引物特异性扩增处理过的靶核酸分子；
(c)碱基特异性地切割所述扩增产物；以及
(d)检测所述切割产物的质量，其中：一个或多个与参考质量相同的切割产物的质量表示所述靶分子含有一个或多个甲基化的胞嘧啶。
6.一种鉴定甲基化的核酸分子的方法，包括：
(a)用可将未甲基化的胞嘧啶修饰生成尿嘧啶的试剂处理靶核酸分子；
(b)扩增处理过的靶核酸分子以形成第一扩增产物；
(c)用靶核酸结合区含有一个或多个胞嘧啶核苷酸的引物特异性扩增所述第一扩增产物以形成第二扩增产物；
(d)碱基特异性地切割所述第二扩增产物；以及
(e)检测切割产物的质量，其中：一个或多个与参考质量相同的切割产物的质量表示所述靶分子含有一个或多个甲基化的胞嘧啶。
7.一种用于鉴定核酸中甲基化的核苷酸的核苷酸基因座的方法，包括：
(a)用可将未甲基化的胞嘧啶修饰生成尿嘧啶的试剂处理靶核酸分子；
(b)用靶核酸结合区含有一个或多个鸟嘌呤核苷酸的引物特异性扩增处理过的靶核酸分子；
(c)碱基特异性地切割扩增产物；以及
(d)检测切割产物的质量，其中：与参考质量相比较，
一个或多个切割产物的质量变化表示靶分子中的核苷酸基因座是甲基化的。
8.一种用于鉴定核酸中甲基化的核苷酸的核苷酸基因座的方法，包括：
(a)用可将未甲基化的胞嘧啶修饰生成尿嘧啶的试剂处理靶核酸分子；
(b)扩增处理过的靶核酸分子以形成第一扩增产物；
(c)用靶核酸结合区含有一个或多个胞嘧啶核苷酸的引物特异性扩增所述第一扩增产物，形成第二扩增产物；
(d)碱基特异性的切割所述第二扩增产物；以及
(e)检测切割产物的质量，其中：与参考质量相比较，一个或多个切割产物的质量变化表示靶分子中的核苷酸基因座是甲基化的。
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