[发明专利]一种新的多肽——σ－54因子9.79和编码这种多肽的多核苷酸

说明书

本发明属于生物技术领域，具体地说，本发明描述了一种新的多肽——σ-54因子9.79，以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

在转录起始阶段，一些调节蛋白能激活由核心RNA聚合酶结合σ-54因子识别的启动子基因的表达，这个过程依赖ATP的水解提供能量。大约一半以上的这种调节蛋白属于信号传导二元系统，并且都包含一个部位，其N-末端能被传导激活酶蛋白磷酸化，几乎所有这种蛋白的C-末端含有一个螺旋—折叠—螺旋(HTH)的结合区域。在调节蛋白上与σ-54因子相互作用的区域约含230个氨基酸残基。

与σ-54因子相互作用的区域自身具有ATP酶活性，在相互作用阶段能促进构象的改变，其中包含有非典型的ATP结合结构域A(P-loop)和结构域B，这两个ATP结合结构域位于蛋白的N-末端部位，除了一些真核生物GTP结合蛋白家族，大多数蛋白都有这样一段保守序列：[LIVMFY](3)-X-G-[DEQ]-[STE]-G-[STAV]-G-K-X(2)-[LIVMFY]。此外还有一些部位也较为保守。

σ-54因子结合到核心酶上后，形成一个稳定的、封闭的启动子复合物，当激活蛋白结合到σ-54因子上去后，整个复合物发生异构化反应，形成开链的启动子复合物，这个过程所需要的能量通过具有ATP酶活性的激活蛋白催化的ATP水解来供给。另外，σ-54结合系统还能在离转录起始位点-12和-24位点识别增强子DNA，取代了一般情况下的-10和-35位点。对一些关键的部位进行定点突变和专一性化学探针显示，σ-54因子与核心酶的结合和相互作用控制了转录起始的速度以及聚合酶的构象，因而间接影响到RNA的合成速度以及将来蛋白的合成速度和表达。

通过基因芯片的分析发现，在正常脑、肝癌、肌肉、胎脑、胎肾，胎肺、胎肝、甲状腺、胸腺、成人肝、肺、胶质瘤中，本发明的多肽的表达谱与σ-54因子的表达谱非常近似，因此二者功能也可能类似。本发明被命名为σ-54因子9.79。

由于如上所述σ-54因子9.79蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用，而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白，因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的σ-54因子9.79蛋白，特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新σ-54因子9.79蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾1病诊断和/或治疗药的基础，因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——σ-54因子9.79以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码σ-54因子9.79的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码σ-54因子9.79的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产σ-54因子9.79的方法。

本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——σ-54因子9.79的抗体。

本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——σ-54因子9.79的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。

本发明的另一个目的是提供诊断治疗与σ-54因子9.79异常相关的疾病的方法。

本发明涉及一种分离的多肽，该多肽是人源的，它包含：具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地，该多肽是具有SEQ ID NO：2氨基酸序列的多肽。

本发明还涉及一种分离的多核苷酸，它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体：

(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸；

(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸；

(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70％相同性的多核苷酸。

更佳地，该多核苷酸的序列是选自下组的一种：(a)具有SEQ ID NO：1中105-374位的序列；和(b)具有SEQ ID NO：1中1-1407位的序列。

本发明另外涉及一种含有本发明多核苷酸的载体，特别是表达载体；一种用该载体遗传工程化的宿主细胞，包括转化、转导或转染的宿主细胞；一种包括培养所述宿主细胞和回收表达产物的制备本发明多肽的方法。

本发明还涉及一种能与本发明多肽特异性结合的抗体。