[发明专利]一种新的多肽——人PHD锌指蛋白34.84和编码这种多肽的多核苷酸

说明书

本发明属于生物技术领域，具体地说，本发明描述了一种新的多肽——人PHD锌指蛋白34.84，以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

锌指结构域是很多蛋白中普遍存在的一种蛋白结构域，按C与H的不同组合主要分为以下几种：C2H2构型、C2C2构型、C2HC构型、C2HC4C构型、C3H构型、C3HC4构型(Dai KS et al.，1998)。其中C2H2结构域的分布最为广泛，该结构域与基因的转录活化及抑制有关。含有该结构域的蛋白的表达异常将引发各种发育紊乱性疾病、各种肿瘤的发生、各种遗传性疾病及免疫系统疾病[KamalChowdhury，Heidi Rohdewohld et al.，Nucleic Acids Research，1988，16：9995-10011]。C2H2锌指结构域最早在蛋白转录因子IIIA中被克隆得到，是真核生物转录因子中分布最广的DNA结合结构域。其由如下所示的保守的序列片段组成：(Tyr，Phe)-X-Cys-X(2，4)-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X(3，5)-His(其中X表示任意氨基酸残基；半胱氨酸与组氨酸与锌原子形成配位键，结合锌原子；其它三个保守的氨基酸残基形成疏水性中心区域；其它变化的氨基酸残基负责介导蛋白与其它分子的相互作用)。该结构域在生物体内独立完成自己的生理学功能。在很多情况下，含有锌指结构域的蛋白与特殊的双链及单链DNA序列相互作用，起着转录调节因子的作用。现有研究发现，C2H2类型的锌指结构域不仅在一些组织的基因表达过程中起重要的调节作用，其在发育调节过程亦起着非常关键的作用。

PHD锌指结构域是一种C4HC3型锌指结构相似的结构基序，最早在核蛋白中被发现。现已发现在多种不同的蛋白中均含有这一结构基序，这些蛋白在生物体内均参与各种染色质介导的转录调控过程。PHD结构域通常在蛋白作用过程中涉及蛋白与DNA、RNA的相互作用，其在生物体一些多组分复合物的聚集及活化过程中起着极为重要的作用，直接调控着染色质结构的形成。而染色质的结构又直接影响着一些基因的转录与表达过程。该结构基序由如下所示的一致性序列片段组成：C(X)1，2C(X)5，45(V，W，F，L，W，I，E)XC(X)1，4C(X)1，4(W，Y，F，V，Q，H，L，T)HXXC(X)5，45(W，F，L，Y，I)XCXXC；该一致性序列片段亦是蛋白发挥生理学功能的重要作用位点，其与C4HC3锌指结构域相似，通过与两个锌离子结合以形成具有活性的构象。该序列片段在生物体内通过调节相关蛋白的相互作用来调控一些基因的表达，从而影响相关组织细胞的增殖及分化。研究发现，该结构域在生物体的发育过程起着重要的作用，其突变将导致蛋白的功能异常，通常与一些相关组织的生长、发育紊乱性疾病及白血病等血液系统疾病的发生相关[Aasland R.，Gibson TJ et al.，Trends Biochem Sci，1995，20：56-59]。

本发明人的多肽与PHD锌指蛋白在氨基酸水平上分别有41％和58％的相同性和相似性，并具有相似的结构特征，同属于PHD锌指蛋白家族，故命名为人PHD锌指蛋白34.84，同时推测其具有相似的生物学特征。

由于如上所述人PHD锌指蛋白34.84蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用，而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白，因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的人PHD锌指蛋白34.84蛋白，特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新人PHD锌指蛋白34.84蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾病诊断和/或治疗药的基础，因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——人PHD锌指蛋白34.84以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码人PHD锌指蛋白34.84的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码人PHD锌指蛋白34.84的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产人PHD锌指蛋白34.84的方法。

本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽——人PHD锌指蛋白34.84的抗体。

本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽——人PHD锌指蛋白34.84的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。