[发明专利]一种新的多肽——SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98和编码这种多肽的多核苷酸无效

专利信息
申请号: 00116940.8 申请日: 2000-06-30
公开(公告)号: CN1331319A 公开(公告)日: 2002-01-16
发明(设计)人: 毛裕民;谢毅 申请(专利权)人: 上海博德基因开发有限公司
主分类号: C12N15/54 分类号: C12N15/54;C12N9/12;C12N15/63;C07K16/40;C12Q1/48;C12Q1/68;A61K38/45
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地址: 200092 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 多肽 sr 蛋白 特异性 丝氨酸 激酶 212.98 编码 这种 多核苷酸
【说明书】:

发明属于生物技术领域,具体地说,本发明描述了一种新的多肽——SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

发生在一个多组分剪接复合物中,该复合物包括两类剪接因子:U1,U2,U5和U4/6小核核糖核蛋白(snRNPs)和非snRNP剪接因子[Kramer,A.1996.Annu.Rev.Biochem.65:367-409]。发生于前体mRNA和snRNPs之间的一系列反应对于剪接位点的选择和来说是关键的,更重要的是为发生于剪接复合物中剪接反应选择一个催化核心。然而,大多数这些反应被非snRNP因子所调节,其中了解得最透彻的snRNP因子是精氨酸/丝氨酸富含(RS)结构域包含剪接因子[Fu,X-D.,1995.RNA.1:663-680]。RS蛋白家族成员的特点是N末端含有两个RNA识别结构域,在C末端有一个RS结构域以及在其他肽段亦含有RS结构域。RNA识别结构域负责识别并结合RNA,而RS结构域则可能作为蛋白质-蛋白质反应模型参与调节各种剪接复合物的集合。

可逆磷酸化作用在哺乳动物细胞前体mRNA剪接中扮演了一个非常重要的角色。两个激酶,RS蛋白特异性丝氨酸激酶1(SPPK1)和Clk/Sty都能磷酸化SR剪接因子家族。SPPK1是一个RS结构域包含剪接因子的高度特异性激酶,因为它只识别精氨酸,而不是赖氨酸,只磷酸化丝氨酸,而不是苏氨酸。Clk/Sty是后来发现的同样与RS结构域包含剪接因子反应,同时又能在体内高效催化剪接因子磷酸化的激酶。事实上,SPPK1和Clk/St

Y的激酶结构域有32%的相同性,并且都含有一个标志性氨基酸序列LAMMER结构域[C

Olwill,K.,T.Pawson.B.Andrews,J.Prasd,J.L.et al.,1996.EMBO J.15:265-275]。

生物学家最近发现了一个新的SPPK蛋白家族成员-SPPK2,实验表明SPPK1和SPPK2无论在氨基酸序列上还是在酶活性上以及底物特异性上都非常相似。然而这两种蛋白在人类不同组织中的表达有很大的不同,并且每种激酶有自己的唯一特征序列,这与它们在体内所起不同的特异性功能有关。因此,哺乳动物细胞可能在调节RNA剪接过程中有众多不同的激酶参加,这些RS蛋白激酶可能本身就是调节的靶蛋白。

SPPK2激酶有几个有趣的结构特征,其中一个是位于N末端的富含脯氨酸的结构域,该结构域包括几个SH3结构域共有的结合位点。该富含脯氨酸结构域同时也能作为WW结构域包含蛋白的靶蛋白[Macias,M.J.,M.Hyvonen,E.Baraldi,J.etal.1996.Nature.382:646-649],WW结构域已经在越来越多的结构、调节、信号分子中被发现。

通过基因芯片的分析发现,在膀胱粘膜、PMA+的Ecv304细胞株、LPS+的Ecv304细胞株胸腺、正常成纤维细胞1024NC、Fibroblast,生长因子刺激,1024NT、疤痕成fc生长因子刺激,1013HT、疤痕成fc未用生长因子刺激,1013HC、膀胱癌建株细胞EJ、膀胱癌旁、膀胱癌、肝癌、肝癌细胞株、胎皮、脾脏、前列腺癌、空肠腺癌、贲门癌中,本发明的多肽的表达谱与SR蛋白特异性丝氨酸激酶2的表达谱非常近似,因此二者功能也可能类似。本发明被命名为SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98。

由于如上所述SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用,而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白,因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98蛋白,特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾1病诊断和/或治疗药的基础,因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽——SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产SR蛋白特异性丝氨酸激酶212.98的方法。

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