[发明专利]一种新的多肽——真核RNA结合区域RNP-1-9和编码这种多肽的多核苷酸无效

专利信息
申请号: 00116239.X 申请日: 2000-05-31
公开(公告)号: CN1325862A 公开(公告)日: 2001-12-12
发明(设计)人: 毛裕民;谢毅 申请(专利权)人: 上海博德基因开发有限公司
主分类号: C07K14/00 分类号: C07K14/00;C07K14/435;C07K16/00;C07K16/18;C07H21/00;C12N15/10;C12N15/11;C12N15/12;C12N15/63;C12N15/64;C12P21/00;C12Q1/68;G01N33/68;A61K38/16;A61K38/17;A61K31/7088;A61K39/395;A61P35/00;A61P7/00;A61P37/00;A61P31/00;A61P31/18
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摘要:
搜索关键词: 一种 多肽 rna 结合 区域 rnp 编码 这种 多核苷酸
【说明书】:

发明属于生物技术领域,具体地说,本发明描述了一种新的多肽--真核RNA结合区域RNP-1-9,以及编码此多肽的多核苷酸序列。本发明还涉及此多核苷酸和多肽的制备方法和应用。

许多与结合单链RNA有关的真核蛋白包含一个或多个拷贝的RNA结合部位,一个单位约含有90个氨基酸。这个家族的蛋白可分为三类:异源核蛋白、小核蛋白以及RNA前体和mRNA结合蛋白;另外,也有其它一些蛋白有类似结构,如果蝇的性决定蛋白致死因子(Sx1)、果蝇的性决定蛋白转换基因-2(Tra-2)等。

真核RNA结合区域RNP有两个区域高度保守,其一是包含六个氨基酸残基的疏水性片段(称RNP-2motif);另一个是八肽的MOTIF(称RNP--1或RNP--CS),是整个区域中最为保守的部分。根据序列分析显示,典型的真核RNA结合区域RNP-1通常由8个氨基酸组成,其序列结构如下:[RK]-G-EDRKHPCG-[AGSCI]-[FY]-[LIVA]-X-[FYLM]。其中的芳香族氨基酸残基与RNA在碱基之间的插入有关,而附近的带正电的残基便于相应的带负电的核酸磷酸盐骨架的靠近和结合。

与RNA加工有关的许多蛋白之间的交互作用在细胞的代谢过程中起着重要的作用,而RNA结合区域对于高亲合力的RNA结合有重要意义。如异源核蛋白(hnRNP)与mRNA的拼接直接相关;真核蛋白合成启动因子4B(eIF-4B)是核内mRNA与核糖体相结合的必要因子。可见RNA结合蛋白的异常表达会引起人和脊椎动物的遗传混乱。

通过基因芯片的分析发现,在膀胱粘膜、PMA+的Ecv304细胞株、LPS+的Ecv304细胞株胸腺、正常成纤维细胞1024NC、Fibroblast,生长因子刺激,1024NT、疤痕成fc生长因子刺激,1013HT、疤痕成fc未用生长因子刺激,1013HC、膀胱癌建株细胞EJ、膀胱癌旁、膀胱癌、肝癌、肝癌细胞株、胎皮、脾脏、前列腺癌、空肠腺癌、贲门癌中,本发明的多肽的表达谱与真核RNA结合区域RNP-1的表达谱非常近似,因此二者功能也可能类似。本发明被命名为真核RNA结合区域RNP-1-9。

由于如上所述真核RNA结合区域RNP-1-9蛋白在调节细胞分裂和胚胎发育等机体重要功能中起重要作用,而且相信这些调节过程中涉及大量的蛋白,因而本领域中一直需要鉴定更多参与这些过程的真核RNA结合区域RNP-1-9蛋白,特别是鉴定这种蛋白的氨基酸序列。新真核RNA结合区域RNP-1-9蛋白编码基因的分离也为研究确定该蛋白在健康和疾病状态下的作用提供了基础。这种蛋白可能构成开发疾1病诊断和/或治疗药的基础,因此分离其编码DNA是非常重要的。

本发明的一个目的是提供分离的新的多肽--真核RNA结合区域RNP-1-9以及其片段、类似物和衍生物。

本发明的另一个目的是提供编码该多肽的多核苷酸。

本发明的另一个目的是提供含有编码真核RNA结合区域RNP-1-9的多核苷酸的重组载体。

本发明的另一个目的是提供含有编码真核RNA结合区域RNP-1-9的多核苷酸的基因工程化宿主细胞。

本发明的另一个目的是提供生产真核RNA结合区域RNP-1-9的方法。

本发明的另一个目的是提供针对本发明的多肽--真核RNA结合区域RNP-1-9的抗体。

本发明的另一个目的是提供了针对本发明多肽--真核RNA结合区域RNP-1-9的模拟化合物、拮抗剂、激动剂、抑制剂。

本发明的另一个目的是提供诊断治疗与真核RNA结合区域RNP-1-9异常相关的疾病的方法。

本发明涉及一种分离的多肽,该多肽是人源的,它包含:具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽、或其保守性变体、生物活性片段或衍生物。较佳地,该多肽是具有SEQ ID NO:2氨基酸序列的多肽。

本发明还涉及一种分离的多核苷酸,它包含选自下组的一种核苷酸序列或其变体:

(a)编码具有SEQ ID No.2氨基酸序列的多肽的多核苷酸;

(b)与多核苷酸(a)互补的多核苷酸;

(c)与(a)或(b)的多核苷酸序列具有至少70%相同性的多核苷酸。

更佳地,该多核苷酸的序列是选自下组的一种:(a)具有SEQ ID NO:1中166-411位的序列;和(b)具有SEQ ID NO:1中1-1644位的序列。

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