[发明专利]一种基于高通量测序的生物强化功能菌群解析方法有效

专利信息
申请号: 201810323589.7 申请日: 2018-04-10
公开(公告)号: CN108486238B 公开(公告)日: 2020-10-16
发明(设计)人: 黄开龙;任洪强;张徐祥;叶林;孙浩浩;赵福正 申请(专利权)人: 南京大学
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/04
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 李倩
地址: 210023 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于高通量测序的生物强化功能菌群解析方法,包括如下操作步骤:采用膜生物反应器,通过不断提高进水中负荷进行功能微生物组的驯化;采集膜生物反应器中每个运行阶段稳定运行后的污泥,离心沉淀以富集微生物,并对每个运行阶段的污泥样品进行微生物总DNA的提取;目标片段PCR扩增并纯化扩增产物;对扩增产物质量鉴定,并将不同样品PCR扩增产物按等质量进行混合;对混合文库进行片段大小和定量检测,并高通量测序;最后进行原始数据质控及生物信息学分析。本发明解析方法能从生态学角度系统解析废水生化处理工艺中微生物群落的结构特征,确定废水处理系统中核心功能菌群,并甄别影响微生物群落结构的关键水质参数。
搜索关键词: 一种 基于 通量 生物 强化 功能 解析 方法
【主权项】:
1.一种基于高通量测序的生物强化功能菌群解析方法,其特征在于:通过采集污泥驯化过程中各阶段的污泥,提取其微生物总DNA,并进行基于16S rDNA的高通量测序,最后运用时序分析和网络分析生物信息学手段对驯化获得的生物强化功能菌群进行深度解析,从生态学角度系统解析生化处理工艺中微生物群落的结构特征,确定其中的核心功能菌群,并甄别影响功能微生物群落结构的关键水质参数。
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